stringtranslate.com

Rafael Irizarry (científico)

Rafael Irizarry es profesor de bioestadística en la Escuela de Salud Pública TH Chan de Harvard y profesor de bioestadística y biología computacional en el Dana-Farber Cancer Institute . [1] [3] [4] [5] Irizarry es conocido como uno de los fundadores del proyecto Bioconductor .

Educación

Irizarry obtuvo su Licenciatura en Ciencias en Matemáticas de la Universidad de Puerto Rico en Río Piedras en 1993, seguida de una Maestría en Artes de la Universidad de California, Berkeley en 1994. Continuó sus estudios en Berkeley, obteniendo un doctorado en estadística en 1998. Su tesis doctoral exploró el uso de estadísticas para modelar armonías en señales de sonido y fue supervisada por David R. Brillinger . [2] [6] [7]

Investigación y carrera

Irizarry se unió a la Escuela de Salud Pública Bloomberg de Johns Hopkins en 1998, donde su investigación se centró en genómica y biología computacional . [6] Ha trabajado en el análisis y procesamiento de datos que surgen de experimentos de microarrays y ayudó a desarrollar el método Robust Multiarray Analysis (RMA) para el análisis de microarrays en colaboración con el estadístico Terry Speed ​​y sus colegas; [8] este método se amplió posteriormente como método RMA congelado (fRMA). [9] [10] También ha trabajado en el análisis de datos de secuenciación de próxima generación .

Irizarry es uno de los fundadores del proyecto Bioconductor , un proyecto de software de desarrollo y código abierto para el análisis de datos genómicos en el lenguaje de programación R. [11] [12] [13] Ha estado involucrado en el desarrollo de varios de los paquetes de bioconductores más utilizados, incluido el paquete 'affy' para el análisis de datos de microarrays de Affymetrix . [10] [14] [15]

Irizarry es el desarrollador e instructor del curso en línea Análisis de datos para ciencias biológicas en la plataforma edX de la Universidad de Harvard; este curso inscribe a más de 30.000 estudiantes por año. [10] [16]

Premios y honores

2009 Premio Presidentes COPSS en estadística. [17]

Premio Mortimer Spiegelman 2009 de la Asociación Estadounidense de Salud Pública [18] [19] otorgado a destacados estadísticos de salud pública menores de 40 años.

Premio Benjamin Franklin 2017 en Bioinformática por su promoción de materiales y métodos gratuitos y de acceso abierto en las ciencias de la vida. [20] [21]

Fue elegido miembro de la Sociedad Internacional de Biología Computacional en 2020. [22]

Referencias

  1. ^ ab Publicaciones de Rafael Irizarry indexadas por Google Scholar
  2. ^ ab Rafael Irizarry en el Proyecto Genealogía de Matemáticas
  3. ^ "Rafael Irizarry". Departamento de Física de la Universidad de Harvard . Consultado el 12 de agosto de 2017 .
  4. ^ "Rafael Irizarry, PhD - DF/HCC". Dana-Farber/Centro Oncológico Harvard . Consultado el 12 de agosto de 2017 .
  5. ^ Zimmer, Carl (1 de julio de 2016). "Dolores crecientes para el campo de la epigenética mientras algunos piden una revisión". Los New York Times . Consultado el 30 de agosto de 2017 .
  6. ^ ab Irizarry, Rafael. "Acerca de". Laboratorio Rafael Irizarry .
  7. ^ Irizarry, Rafael (1998). Estadística y música: adaptación de un modelo armónico local a señales de sonido musicales (PDF) (tesis doctoral). OCLC  892825726. S2CID  58781935. ProQuest  304424980. Archivado desde el original (PDF) el 12 de agosto de 2017 . Consultado el 12 de agosto de 2017 .}
  8. ^ Pevsner, Jonathan (2015). Bioinformática y genómica funcional (3ª ed.). John Wiley e hijos. pag. 488.ISBN​ 978-1-118-58178-0. Consultado el 30 de agosto de 2017 .
  9. ^ McCall, Minnesota; Bolstad, BM; Irizarry, RA (22 de enero de 2010). "Análisis multiarray robusto congelado (fRMA)". Bioestadística . 11 (2): 242–253. doi : 10.1093/bioestadística/kxp059. PMC 2830579 . PMID  20097884. 
  10. ^ abc "Anuncio del ganador del Premio Benjamin Franklin 2017". Bioinformática.org . Consultado el 12 de agosto de 2017 .
  11. ^ "Rafael Irizarry". edX . 20 de diciembre de 2013 . Consultado el 12 de agosto de 2017 .
  12. ^ Caballero, Robert C ; Carey, Vicente J; Bates, Douglas M; Bolstad, Ben; Dettling, Marcel ; Dudoit, Sandrine ; Ellis, Byron; Gautier, Laurent; Ge, Yongchao; Gentry, Jeff; Hornik, Kurt; Hothorn, Torsten; Huber, Wolfgang; Yaco, Stefano; Irizarry, Rafael; Leisch, Friedrich; Li, Cheng; Maechler, Martín; Rossini, Antonio J; Sawitzki, Gunther; Smith, Colin; Smith, Gordon; Tierney, Lucas; Yang, Jean YH; Zhang, Jianhua (2004). "Bioconductor: desarrollo de software abierto para biología computacional y bioinformática". Biología del genoma . 5 (10): R80. doi : 10.1186/gb-2004-5-10-r80 . PMC 545600 . PMID  15461798. 
  13. ^ Mulekar, Madhuri (octubre de 2009). "Estadísticos honrados por sus contribuciones | Amstat News". revista.amstat.org . Consultado el 30 de agosto de 2017 .
  14. ^ Irizarry, Rafael; Gautier, Laurent (2017). "Métodos para matrices de oligonucleótidos Affymetrix". Bioconductor . doi : 10.18129/B9.bioc.affy . Consultado el 12 de agosto de 2017 .
  15. ^ Gautier, L.; Hacer frente, L.; Bolstad, BM; Irizarry, RA (10 de febrero de 2004). "affy - análisis de datos de Affymetrix GeneChip a nivel de sonda". Bioinformática . 20 (3): 307–315. doi : 10.1093/bioinformática/btg405 . PMID  14960456.
  16. ^ "Análisis de datos para ciencias biológicas 1: estadística y R". Aprendizaje en línea de Harvard . 2016-04-10 . Consultado el 12 de agosto de 2017 .
  17. ^ "Premio de los Presidentes". Comité de Presidentes de Sociedades de Estadística . Archivado desde el original el 6 de diciembre de 2015 . Consultado el 12 de agosto de 2017 .
  18. ^ "Validación de la biología compleja: cómo las matrices pueden complementar sus datos de próxima generación". Seminarios web científicos . 5 de diciembre de 2012 . Consultado el 12 de agosto de 2017 .
  19. ^ "Premio Mortimer Spiegelman - SECCIÓN DE ESTADÍSTICAS APHA". sitios.google.com . Consultado el 30 de agosto de 2017 .
  20. ^ "Premio Benjamin Franklin". Bioinformática.org . Consultado el 12 de agosto de 2017 .
  21. ^ "Rafael Irizarry gana el premio Ben Franklin 2017". Departamento de Bioestadística de la Escuela de Salud Pública TH Chan de Harvard . 11 de abril de 2017. Archivado desde el original el 12 de agosto de 2017 . Consultado el 12 de agosto de 2017 .
  22. ^ "19 de febrero de 2020: ¡ISCB felicita y presenta la generación de becarios de 2020!". www.iscb.org . Consultado el 23 de junio de 2020 .