Las familias de transportadores de solutos atípicos (SLC atípicos) son nuevas proteínas transportadoras secundarias activas o facilitadoras plausibles que comparten antecedentes ancestrales con las familias de transportadores de solutos conocidas (SLC) . Sin embargo, no se les ha asignado un nombre de acuerdo con el sistema raíz de SLC ni se han clasificado en ninguna de las familias de SLC existentes. [1] [2]
Familias de transporte de superfamilias facilitadoras mayores atípicas
La mayoría de las SLC atípicas son familias dentro de la superfamilia de facilitadores principales (MFS). [3] Estas SLC atípicas son proteínas transportadoras secundarias activas o facilitadoras plausibles que comparten ascendencia con los transportadores de solutos conocidos . [1] [2] [4] Sin embargo, no se nombran de acuerdo con el sistema raíz de SLC ni se clasifican en ninguna de las familias de SLC existentes. [1] Los ATMF se clasifican en función de su similitud de secuencia y cercanía filogenética. [3]
Algunas SLC atípicas del tipo MFS son: OCA2 , CLN3 , SPNS1, SPNS2 , SPNS3 , SV2A , SV2B , SV2C, SVOP, SVOPL, MFSD1 , MFSD2A , MFSD2B, MFSD3 , MFSD4A, [5] MFSD4B, MFSD5 , MFSD6, MFSD6L, MFSD8 , MFSD9 , [5] MFSD10, MFSD11 , MFSD12, MFSD13A, MFSD14A , MFSD14B , UNC93A [6] y UNC93B1 . Todas estas son SLC atípicas que se encuentran dentro de la superfamilia de facilitadores mayores . También TMEM104 (clan APC), OCA2 (clan IT) y CLN3 (que no tiene clan) son SLC atípicos en humanos. [7] [8] [9]
Familias de transporte no pertenecientes a MFS
Aunque la mayoría de las SLC atípicas pertenecen a la superfamilia de facilitadores principales, existen excepciones: TMEM104 ( superfamilia APC ), OCA2 (superfamilia IT) y CLN3 (superfamilia desconocida). [1]
Referencias
- ^ abcd Perland E, Fredriksson R (marzo de 2017). "Sistemas de clasificación de transportadores activos secundarios". Tendencias en ciencias farmacológicas . 38 (3): 305–315. doi :10.1016/j.tips.2016.11.008. PMID 27939446.
- ^ ab Sreedharan S, Stephansson O, Schiöth HB, Fredriksson R (junio de 2011). "Larga conservación evolutiva y considerable especificidad tisular de varios transportadores de solutos atípicos". Gene . 478 (1–2): 11–18. doi :10.1016/j.gene.2010.10.011. PMID 21044875.
- ^ ab Perland E, Bagchi S, Klaesson A, Fredriksson R (septiembre de 2017). "Características de 29 nuevos portadores de solutos atípicos del tipo de superfamilia de facilitadores principales: conservación evolutiva, estructura predicha y coexpresión neuronal". Open Biology . 7 (9): 170142. doi :10.1098/rsob.170142. PMC 5627054 . PMID 28878041.
- ^ Höglund PJ, Nordström KJ, Schiöth HB, Fredriksson R (abril de 2011). "Las familias de transportadores de solutos tienen una historia evolutiva notablemente larga, y la mayoría de las familias humanas estaban presentes antes de la divergencia de las especies bilaterales". Biología molecular y evolución . 28 (4): 1531–1541. doi :10.1093/molbev/msq350. PMC 3058773 . PMID 21186191.
- ^ ab Perland E, Hellsten SV, Schweizer N, Arapi V, Rezayee F, Bushra M, Fredriksson R (2017). "Predicción estructural de dos nuevos transportadores de SLC atípicos humanos, MFSD4A y MFSD9, y su distribución neuroanatómica en ratones". PLOS ONE . 12 (10): e0186325. Bibcode :2017PLoSO..1286325P. doi : 10.1371/journal.pone.0186325 . PMC 5648162 . PMID 29049335.
- ^ Ceder MM, Lekholm E, Hellsten SV, Perland E, Fredriksson R (2017). "La expresión neuronal y periférica de UNC93A ligada a la membrana responde a la disponibilidad de nutrientes en ratones". Frontiers in Molecular Neuroscience . 10 : 351. doi : 10.3389/fnmol.2017.00351 . PMC 5671512 . PMID 29163028.
- ^ "TMEM104 proteína transmembrana 104 [Homo sapiens (humano)] - Gen - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov . Consultado el 14 de marzo de 2022 .
- ^ "OCA2 OCA2 proteína transmembrana melanosomal [Homo sapiens (humano)] - Gen - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov . Consultado el 14 de marzo de 2022 .
- ^ "CLN3 CLN3 proteína transmembrana lisosomal/endosomal, battenina [Homo sapiens (humano)] - Gen - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov . Consultado el 14 de marzo de 2022 .