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Proyecto BioGenoma de la Tierra

El Proyecto BioGenoma de la Tierra ( EBP , por sus siglas en inglés) es una iniciativa que tiene como objetivo secuenciar y catalogar los genomas de todas las especies eucariotas descritas actualmente en la Tierra durante un período de diez años. [1] La iniciativa produciría una base de datos de ADN abierta con información biológica que proporcione una plataforma para la investigación científica y respalde iniciativas ambientales y de conservación. [2] Un artículo científico que presenta la visión del proyecto se publicó en PNAS en abril de 2018, [3] y el proyecto se lanzó oficialmente el 1 de noviembre de 2018. [4]

La iniciativa se inspiró en el Proyecto Genoma Humano , y surgió durante la reunión de noviembre de 2015 entre Harris Lewin ( UCD ), Gene E. Robinson ( IGB ) y W. John Kress ( Museo Nacional de Historia Natural del Instituto Smithsonian ). [3] [5] En febrero de 2017, en una importante conferencia sobre genómica y biodiversidad organizada por el Instituto Smithsonian y BGI en Washington, DC, se apoyó el plan de 10 años y la estructura organizativa del proyecto. [3]

Resumen

Se estima que el proyecto costará 4.700 millones de dólares. [1] Incluye proyectos ya en marcha como i5K (insectos), [6] B10K (aves), 10KP (plantas), [7] [8] y el Árbol de la Vida de Darwin, que tienen como objetivo secuenciar las aproximadamente 66.000 especies eucariotas del Reino Unido. [1] El proyecto tiene como objetivo secuenciar y anotar las aproximadamente 1,5 millones de especies eucariotas conocidas en tres fases, con la primera de las cuales crear "conjuntos de referencia anotados a escala cromosómica para al menos una especie representativa de cada una de las ~9.000 familias taxonómicas eucariotas". [3] [8]

Según el artículo de PNAS , varios centros de secuenciación están apoyando el proyecto, incluidos BGI (China), Baylor College of Medicine (EE. UU.), Wellcome Sanger Institute (Reino Unido), Rockefeller University (EE. UU.), con un centro adicional que se establecerá para el proyecto en América del Sur por la Fundación de Investigación de São Paulo . [3] En cuanto a los bioobservatorios que utilizan la genómica, los ejemplos que satisfacen las necesidades del proyecto son la Red Nacional de Observatorios Ecológicos , la Red de Investigación Ecológica China, ForestGEO y MarineGEO. [3] Para proporcionar una idea de la viabilidad y los requisitos técnicos para proyectos de "escala planetaria" como este, el Proyecto 10,000 Plant Genome ha publicado un proyecto piloto "Digitalización del Jardín Botánico de Ruili " muestreando y secuenciando 761 especímenes de plantas vasculares que crecen en un jardín botánico en el suroeste de China. [9]

Véase también

Referencias

  1. ^ abc "La vida en la Tierra analizará su ADN en nombre de la conservación". Nature . 563 (7730): 155–156. Noviembre de 2018. Bibcode :2018Natur.563..155.. doi : 10.1038/d41586-018-07323-y . PMID  30401859.
  2. ^ "Secuenciando el mundo". The Economist . 23 de enero de 2018. Archivado desde el original el 24 de enero de 2018. Consultado el 3 de febrero de 2018 .
  3. ^ abcdef Lewin HA, Robinson GE, Kress WJ, Baker WJ, Coddington J, Crandall KA, et al. (abril de 2018). "Proyecto BioGenome de la Tierra: secuenciación de la vida para el futuro de la vida". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 115 (17): 4325–4333. Bibcode :2018PNAS..115.4325L. doi : 10.1073/pnas.1720115115 . PMC 5924910 . PMID  29686065. 
  4. ^ "Los científicos lanzan un esfuerzo para mapear el ADN de cada especie". The Presidential Daily Brief: Intrigante. OZY . 2 de noviembre de 2018 . Consultado el 2 de noviembre de 2018 .
  5. ^ Daley J (5 de noviembre de 2018). "Comienza un ambicioso proyecto para secuenciar genomas de 1,5 millones de especies". Smithsonian . Consultado el 3 de diciembre de 2018 .
  6. ^ Consorcio i5K (1 de septiembre de 2013). "La iniciativa i5K: avances en la genómica de los artrópodos para el conocimiento, la salud humana, la agricultura y el medio ambiente". The Journal of Heredity . 104 (5): 595–600. doi :10.1093/jhered/est050. PMC 4046820 . PMID  23940263. {{cite journal}}: CS1 maint: nombres numéricos: lista de autores ( enlace )
  7. ^ Cheng S, Melkonian M, Smith SA, Brockington S, Archibald JM, Delaux PM, et al. (marzo de 2018). "10KP: Un plan de secuenciación del genoma filodiverso". GigaScience . 7 (3): 1–9. doi :10.1093/gigascience/giy013. PMC 5869286 . PMID  29618049. 
  8. ^ ab Exposito-Alonso, Moises; Drost, Hajk-Georg; Burbano, Hernán; Weigel, Detlef (1 de abril de 2020). "El proyecto BioGenoma de la Tierra: oportunidades y desafíos para la genómica y la conservación de las plantas". The Plant Journal . 102 (2): 222–229. doi : 10.1111/tpj.14631 . PMID  31788877.
  9. ^ Liu H, Wei J, Yang T, Mu W, Song B, Yang T, et al. (enero de 2019). "Digitalización molecular de un jardín botánico: secuenciación de genoma completo de alta profundidad de 689 especies de plantas vasculares del Jardín Botánico Ruili". GigaScience . 8 (4). doi :10.1093/gigascience/giz007. PMC 6441391 . PMID  30689836. 

Enlaces externos