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Proteína de unión al ADN monocatenaria

La proteína de unión al ADN monocatenaria ( SSB ) es una proteína que se encuentra en la bacteria Escherichia coli ( E. coli ) , que se une a regiones monocatenarias de ácido desoxirribonucleico ( ADN ). [1] El ADN monocatenario se produce durante todos los aspectos del metabolismo del ADN: replicación, recombinación y reparación. Además de estabilizar este ADN monocatenario, las proteínas SSB se unen y modulan la función de numerosas proteínas implicadas en todos estos procesos.

La SSB activa de E. coli está compuesta por cuatro subunidades idénticas de 19 kDa . La unión del ADN monocatenario al tetrámero puede ocurrir en diferentes "modos", ocupando SSB diferentes números de bases de ADN dependiendo de varios factores, incluida la concentración de sal. Por ejemplo, el modo de unión (SSB) 65 , en el que aproximadamente 65 nucleótidos de ADN se envuelven alrededor del tetrámero SSB y contactan con sus cuatro subunidades, se ve favorecido en altas concentraciones de sal in vitro . A concentraciones de sal más bajas, tiende a formarse el modo de unión (SSB) 35 , en el que alrededor de 35 nucleótidos se unen a sólo dos de las subunidades de SSB. Se requiere más trabajo para dilucidar las funciones de los distintos modos de unión in vivo .

SSB bacteriano

Los dominios de la proteína SSB en las bacterias son importantes en su función de mantener el metabolismo del ADN, más específicamente la replicación , reparación y recombinación del ADN. [2] Tiene una estructura de tres cadenas beta a una sola hoja beta de seis cadenas para formar un dímero de proteína . [3]

Ver también

Referencias

  1. ^ Shishmarev D, Wang Y, Mason CE, Su XC, Oakley AJ, Graham B, et al. (Febrero 2014). "Modo de unión intramolecular del extremo C de la proteína de unión al ADN monocatenario de Escherichia coli determinado por espectroscopia de resonancia magnética nuclear". Investigación de ácidos nucleicos . 42 (4): 2750–2757. doi : 10.1093/nar/gkt1238. PMC  3936761 . PMID  24288378.
  2. ^ Meyer RR, Laine PS (diciembre de 1990). "La proteína de unión al ADN monocatenaria de Escherichia coli". Revisiones microbiológicas . 54 (4): 342–380. doi :10.1128/MMBR.54.4.342-380.1990. PMC 372786 . PMID  2087220. 
  3. ^ Raghunathan S, Ricard CS, Lohman TM, Waksman G (junio de 1997). "Estructura cristalina del dominio de unión al ADN homotetramérico de la proteína de unión al ADN monocatenaria de Escherichia coli determinada por difracción de rayos X de longitudes de onda múltiples en la proteína selenometionilo con una resolución de 2,9 A". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 94 (13): 6652–6657. doi : 10.1073/pnas.94.13.6652 . PMC 21213 . PMID  9192620. 
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enlaces externos