La repetición pentatricopeptídica (PPR) es un motivo de secuencia de 35 aminoácidos . Las proteínas que contienen repeticiones pentatricopeptídicas son una familia de proteínas que se encuentran comúnmente en el reino vegetal . Se distinguen por la presencia de motivos PPR degenerados en tándem [1] y por la relativa falta de intrones en los genes que los codifican. [2]
Se han identificado aproximadamente 450 de estas proteínas en el genoma de Arabidopsis y otras 477 en el genoma del arroz . [3] A pesar del gran tamaño de la familia de proteínas, los datos genéticos sugieren que hay poca o ninguna redundancia de función entre las proteínas PPR en Arabidopsis . [2]
Actualmente, el propósito de las proteínas PPR es objeto de debate. Se ha demostrado que una buena parte de las de Arabidopsis interactúan (a menudo de manera esencial) con las mitocondrias y otros orgánulos [2] y que posiblemente estén involucradas en la edición del ARN . [4] Sin embargo, se requieren muchas proteínas trans para que se produzca esta edición y la investigación continúa buscando qué proteínas son necesarias. [5]
Se ha resuelto la estructura de la PPR. Se pliega en una estructura de hélice-vuelta-hélice similar a las que se encuentran en la repetición tetratricopeptídica . Varias repeticiones de la proteína forman un anillo alrededor de una molécula de ARN monocatenario de una manera sensible a la secuencia que recuerda a los efectores TAL . [6]
Ejemplos
Los genes humanos que codifican proteínas que contienen esta repetición incluyen:
Referencias
- ^ Mingler MK, Hingst AM, Clement SL, Yu LE, Reifur L, Koslowsky DJ (noviembre de 2006). "Identificación de proteínas repetidas de pentatricopéptidos en Trypanosoma brucei". Mol. Biochem. Parasitol . 150 (1): 37–45. doi :10.1016/j.molbiopara.2006.06.006. PMID 16837079.
- ^ abc Lurin C, Andrés C, Aubourg S, Bellaoui M, Bitton F, Bruyère C, Caboche M, Debast C, Gualberto J, Hoffmann B, Lecharny A, Le Ret M, Martin-Magniette ML, Mireau H, Peeters N, Renou JP, Szurek B, Taconnat L, Small I (agosto de 2004). "El análisis de todo el genoma de las proteínas repetidas pentatricopéptidos de Arabidopsis revela su papel esencial en la biogénesis de los orgánulos". Célula vegetal . 16 (8): 2089–103. doi :10.1105/tpc.104.022236. PMC 519200 . PMID 15269332.
- ^ O'Toole N, Hattori M, Andres C, Iida K, Lurin C, Schmitz-Linneweber C, Sugita M, Small I (junio de 2008). "Sobre la expansión de la familia de genes de repetición pentatricopeptídica en plantas". Mol. Biol. Evol . 25 (6): 1120–8. doi : 10.1093/molbev/msn057 . PMID: 18343892.
- ^ Kotera E, Tasaka M, Shikanai T (enero de 2005). "Una proteína de repetición pentatricopeptídica es esencial para la edición de ARN en cloroplastos". Nature . 433 (7023): 326–30. Bibcode :2005Natur.433..326K. doi :10.1038/nature03229. PMID 15662426. S2CID 4416316.
- ^ Takenaka M, Verbitskiy D, Zehrmann A, Brennicke A (junio de 2010). "El cribado genético inverso identifica cinco proteínas PPR de clase E implicadas en la edición de ARN en las mitocondrias de Arabidopsis Thaliana". J Biol Chem . 285 (35): 27122–27129. doi : 10.1074/jbc.M110.128611 . PMC 2930711 . PMID 20566637.
- ^ Yin P, Li Q, Yan C, Liu Y, Liu J, Yu F, et al. (diciembre de 2013). "Base estructural para el reconocimiento modular de ARN monocatenario por proteínas PPR". Nature . 504 (7478): 168–71. Bibcode :2013Natur.504..168Y. doi :10.1038/nature12651. PMID 24162847. S2CID 4471801.
