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Ciencia de cuaderno abierto

La ciencia de cuaderno abierto es la práctica de hacer que todo el registro primario de un proyecto de investigación esté disponible públicamente en línea a medida que se registra. Esto implica colocar el cuaderno personal, o de laboratorio, del investigador en línea junto con todos los datos brutos y procesados, y cualquier material asociado, a medida que este material se genera. El enfoque puede resumirse con el lema "sin información privilegiada". Es el extremo lógico de los enfoques transparentes para la investigación e incluye explícitamente la puesta a disposición de experimentos fallidos, menos significativos y de otro modo no publicados; los llamados "datos oscuros". [1] La práctica de la ciencia de cuaderno abierto, aunque no es la norma en la comunidad académica , ha ganado una atención significativa recientemente en la investigación [2] [3] y en general [1] [4] como parte de una tendencia general hacia enfoques más abiertos en la práctica y publicación de la investigación. Por lo tanto, la ciencia de cuaderno abierto puede describirse como parte de un movimiento de ciencia abierta más amplio que incluye la defensa y adopción de la publicación de acceso abierto , los datos abiertos , los datos de colaboración colectiva y la ciencia ciudadana . Está inspirada en parte por el éxito del software de código abierto [5] y se basa en muchas de sus ideas.

Historia

El término "ciencia de cuaderno abierto" [6] se utilizó por primera vez en 2006 en una publicación de blog de Jean-Claude Bradley , profesor asociado de química en la Universidad de Drexel en ese momento. Bradley describió la ciencia de cuaderno abierto de la siguiente manera: [7]

... existe una URL que lleva a un cuaderno de laboratorio que está disponible de forma gratuita e indexado en los motores de búsqueda más habituales. No tiene por qué parecerse necesariamente a un cuaderno de papel, pero es esencial que toda la información disponible para que los investigadores puedan sacar sus conclusiones esté igualmente disponible para el resto del mundo.

—  Jean Claude Bradley

Practicantes

Activo

Experimental (orden alfabético por apellido)

"Un equipo de científicos innovadores del SGC ahora comparte sus cuadernos de laboratorio en línea" . [11] [12] [13]


Teorético

Archivado (orden alfabético por apellido)

Recurrente (educativo)

Cuadernos parcialmente abiertos/pseudoabiertos

Se trata de iniciativas más abiertas que los cuadernos de laboratorio tradicionales, pero que carecen de un componente clave para la Ciencia Abierta en Cuadernos. Por lo general, el cuaderno se comparte solo parcialmente o con un retraso significativo. [40]

Beneficios

Un cuaderno de laboratorio público permite citar de manera conveniente las instancias exactas de los experimentos utilizados para respaldar los argumentos en los artículos. Por ejemplo, en un artículo sobre la optimización de una reacción de Ugi , [52] [53] se utilizan tres lotes diferentes de producto en la caracterización y cada espectro hace referencia al experimento específico en el que se utilizó cada lote: EXP099, [54] EXP203 [55] y EXP206. [56] Este trabajo se publicó posteriormente en el Journal of Visualized Experiments , [57] lo que demuestra que la procedencia de los datos de integridad se puede mantener desde el cuaderno de laboratorio hasta la publicación final en una revista revisada por pares.

Sin más salvedades, la Ciencia de Cuaderno Abierto implica que la investigación se está divulgando de forma continua sin demoras ni filtros irrazonables. Esto permite que otros comprendan exactamente cómo se lleva a cabo la investigación en un campo o un grupo de investigación específico. Dicha información podría ser valiosa para colaboradores, futuros estudiantes o futuros empleadores. Proporcionar acceso a páginas de cuadernos seleccionadas o insertar un período de embargo sería incompatible con el significado del término "Abierto" en este contexto. A menos que se comuniquen correcciones de errores, experimentos fallidos y resultados ambiguos, un observador externo no podrá comprender exactamente cómo se está haciendo la ciencia. Términos como Pseudo [58] o Parcial [40] se han utilizado como calificadores para compartir información de cuadernos de laboratorio de forma selectiva o con una demora significativa.

Desventajas

Los argumentos en contra de la adopción de la ciencia de cuadernos abiertos se dividen principalmente en tres categorías que tienen diferente importancia en distintos campos de la ciencia. La principal preocupación, expresada en particular por los científicos biológicos y médicos, es la del " robo de datos " o "ser primicia". Si bien el grado en que los grupos de investigación roban o adaptan los resultados de otros sigue siendo un tema de debate, es cierto que el miedo a no ser el primero en publicar impulsa muchas conductas, en particular en algunos campos. Esto está relacionado con el enfoque en estos campos sobre el artículo publicado y revisado por pares como la principal métrica del éxito profesional.

El segundo argumento que se presenta contra la ciencia de cuadernos abiertos es que constituye una publicación previa, lo que hace imposible patentar y difícil publicar los resultados en la literatura tradicional revisada por pares . Con respecto a las patentes, la publicación en la web está claramente clasificada como divulgación . Por lo tanto, si bien puede haber argumentos sobre el valor de las patentes y enfoques que evitan este problema, está claro que la ciencia de cuadernos abiertos no es apropiada para la investigación para la cual la protección de patentes es un resultado esperado y deseado. Con respecto a la publicación en la literatura revisada por pares, el caso es menos claro. La mayoría de los editores de revistas científicas aceptan material que se ha presentado previamente en una conferencia o en forma de preimpresión. Aquellos editores que aceptan material que se ha publicado previamente en estas formas generalmente han indicado informalmente que la publicación web de datos, incluida la ciencia de cuadernos abiertos, cae en esta categoría. Los proyectos de cuadernos abiertos se han publicado con éxito en revistas revisadas por pares de alto factor de impacto [59] [60], pero esto no se ha probado con una amplia gama de editores. Es de esperar que aquellos editores que excluyan explícitamente estas formas de prepublicación no acepten material previamente divulgado en un cuaderno abierto.

Un tercer argumento que se esgrime contra la ciencia de los cuadernos abiertos es que vicia la independencia de las investigaciones en competencia y, por lo tanto, puede dar lugar a la falta de una verificación independiente de los resultados, que es de suma importancia. Esto no es lo mismo que la recolección de datos, sino la posibilidad mucho más sutil de permitir que los datos que están evolucionando conjuntamente se influyan entre sí. En la ciencia tradicional, las grandes colaboraciones experimentales suelen establecer reglas de cortafuegos que impiden la comunicación entre los miembros de las colaboraciones en competencia para evitar no solo la fuga de datos, sino también la influencia en la metodología mediante la que se analizan los datos.

El argumento final se relaciona con el problema de la "avalancha de datos". Si el volumen actual de literatura revisada por pares es demasiado grande para que una sola persona pueda manejarlo, entonces ¿cómo se puede esperar que alguien pueda manejar la enorme cantidad de material no revisado por pares que potencialmente podría estar disponible, especialmente cuando parte, tal vez la mayoría, sería de mala calidad? Un argumento relacionado es que "mi cuaderno es demasiado específico" para que sea de interés para alguien más. La cuestión de cómo descubrir material relevante y de alta calidad es un tema relacionado. La cuestión de la curación y validación de datos y la calidad metodológica es un tema serio y uno que podría decirse que tiene relevancia más allá de la ciencia de cuadernos abiertos, pero es un desafío particular aquí.

Financiación y patrocinio

El Open Notebook Science Challenge , [61] ahora orientado a informar mediciones de solubilidad en solventes no acuosos, ha recibido patrocinio de Submeta, [62] Nature [63] y Sigma-Aldrich . [64] La primera de los diez ganadores del concurso de diciembre de 2008 fue Jenny Hale. [65]

Logotipos

Se pueden utilizar logotipos en los cuadernos para indicar las condiciones de uso compartido. Los cuadernos completamente abiertos se marcan como "todo el contenido" y acceso "inmediato". Los cuadernos parcialmente abiertos se pueden marcar como "contenido seleccionado" y/o "con acceso diferido". [66]

Véase también

Referencias

  1. ^ ab Liberando los datos oscuros de experimentos científicos fallidos, Goetz, T., Wired Magazine, 25 de septiembre de 2007
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