El Comité Internacional de Taxonomía de Virus ( ICTV ) autoriza y organiza la clasificación taxonómica y la nomenclatura de los virus . [1] [2] [3] El ICTV desarrolla un esquema taxonómico universal para los virus y, por lo tanto, tiene los medios para describir, nombrar y clasificar adecuadamente cada taxón de virus. Los miembros del Comité Internacional de Taxonomía de Virus son considerados virólogos expertos . [4] El ICTV se formó y está gobernado por la División de Virología de la Unión Internacional de Sociedades Microbiológicas . [5] El trabajo detallado, como la identificación de nuevos taxones y la delimitación de los límites de especies, géneros, familias, etc., normalmente lo realizan grupos de estudio de expertos en las familias. [2]
El Comité Internacional de Nomenclatura de Virus (ICNV) se creó en 1966, en el Congreso Internacional de Microbiología celebrado en Moscú, para estandarizar la denominación de los taxones de virus. [6] La ICVN publicó su primer informe en 1971. [6] Para los virus que infectan a los vertebrados , el primer informe incluyó 19 géneros, 2 familias y otros 24 grupos no clasificados. [ cita necesaria ]
El ICNV pasó a llamarse Comité Internacional sobre Taxonomía de Virus en 1974. [6]
La organización está dividida en un comité ejecutivo, que incluye miembros y ejecutivos con funciones elegidas por períodos fijos, así como jefes de siete subcomités designados directamente. Cada jefe de subcomité, a su vez, nombra numerosos "grupos de estudio", cada uno de los cuales consta de un presidente y un número variable de miembros dedicados a la taxonomía de un taxón específico, como un orden o una familia. Esta estructura se puede visualizar de la siguiente manera: [7]
Los objetivos del Comité Internacional sobre Taxonomía de Virus son: [8] : §3
Los principios esenciales de nomenclatura de virus del ICTV son: [9] : §2.1
El sistema universal de clasificación de virus del ICTV utiliza una versión ligeramente modificada del sistema de clasificación biológica estándar . Sólo reconoce el orden de los taxones , familia, subfamilia, género y especie. Cuando no se sabe cómo clasificar una especie en un género pero su clasificación en una familia es clara, se clasificará como una especie no asignada de esa familia. Muchos taxones permanecen sin clasificar. También hay, a partir de 2005, secuencias de GenBank asignadas a 3.142 "especies" que no se contabilizan en el informe de ICTV (sin embargo, debido a la forma en que funciona GenBank, el número real de especies adecuadas es probablemente significativamente menor). [2] Sólo se espera que el número de secuencias de virus no identificadas aumente a medida que la tasa de secuenciación de virus aumente dramáticamente. [2][actualizar]
El ICTV ha tenido un éxito sorprendente en lograr estabilidad desde su creación en 1962. Todos los géneros y familias reconocidos en la década de 1980 continuaron en uso hasta 2005, por ejemplo. [2]
Las propuestas de nuevos nombres, cambios de nombres y el establecimiento y ubicación taxonómica de taxones son manejadas por el comité ejecutivo del ICTV en forma de propuestas. Antes de tomar una decisión se consulta a todos los subcomités y grupos de estudio relevantes de ICTV. [9] : §3.8,3.19
El nombre de un taxón no tiene estatus oficial hasta que haya sido aprobado por ICTV, y sólo se aceptarán nombres si están vinculados a taxones jerárquicos aprobados. [9] : §2.4,3.7 Si no se propone un nombre adecuado para un taxón, el taxón podrá aprobarse y el nombre quedará indeciso hasta la adopción de un nombre internacional aceptable, cuando ICTV lo proponga y lo acepte. [ cita necesaria ] Los nombres no deben transmitir un significado para el taxón que parezca excluir virus que son legítimamente miembros de ese taxón, excluir miembros que algún día podrían pertenecer a ese taxón o incluir virus que son miembros de diferentes taxones. [9] : §3.17
No existe un principio de prioridad para la virología, por lo que un nombre actualmente en uso no puede invalidarse reivindicando prioridad. [9] : §3.10
Desde 2020, [10] el Código Viral exige el uso de nombres binomiales para las nuevas especies: un género seguido de un epíteto específico. [9] : §3.21 El nombre de una especie debe proporcionar una identificación apropiada e inequívoca de la especie. [9] : §3.22
Antes de eso, estaba en vigor un sistema de denominación más liberal: el nombre de una especie debe consistir en la menor cantidad de palabras posible, pero no debe consistir únicamente en el nombre del huésped y la palabra virus . Se pueden utilizar números, letras o combinaciones de ellos como epítetos de especies cuando dichos números y letras ya se utilicen ampliamente. Sin embargo, los números de serie, letras o combinaciones de los mismos recientemente designados no son aceptables solos como epítetos de especie. Si existe una serie de números o letras, se puede continuar. [ cita necesaria ]
Un género de virus es un grupo de especies relacionadas que comparten algunas propiedades importantes y, a menudo, sólo difieren en el rango de huéspedes y la virulencia. El nombre de un género debe ser una sola palabra que termine en el sufijo -virus . La aprobación de un nuevo género debe ir acompañada de la aprobación de una especie tipo . [9] : §3.24
Una subfamilia es un grupo de géneros que comparten ciertos caracteres comunes. El taxón se utilizará únicamente cuando sea necesario para resolver un problema jerárquico complejo. Un nombre de subfamilia debe ser una sola palabra que termine en el sufijo -virinae . [9] : §3.24
Una familia es un grupo de géneros, estén o no organizados en subfamilias, que comparten ciertos caracteres comunes entre sí. Un apellido debe ser una sola palabra que termine en el sufijo -viridae . [9] : §3.24
Una orden es un grupo de familias que comparten ciertos caracteres comunes. El nombre de un pedido debe ser una sola palabra terminada en el sufijo -virales . [9] : §3.24
Las normas relativas a la clasificación de los virus se aplicarán también a la clasificación de los viroides . Las terminaciones formales de los taxones de viroides son la palabra viroide para especies, el sufijo -viroid para géneros, el sufijo -viroinae para subfamilias, en caso de que este taxón sea necesario, y -viroidae para familias. [9] : §3.26 Se utiliza un sistema similar para satélites y viriformes, sustituyendo -vir- en las terminaciones de taxones normales por -satellit- y -viriform- . [9] : §3.26 [ ¿cuándo? ]
Los retrotransposones se consideran virus en clasificación y nomenclatura. Los priones no se clasifican como virus, pero se les asigna una clasificación arbitraria que parece útil para los trabajadores en campos particulares. [ cita necesaria ]
Reconociendo la importancia de la metagenómica viral, el ICTV reconoce que los genomas ensamblados a partir de datos metagenómicos representan virus reales y fomenta su clasificación oficial siguiendo los mismos procedimientos que los utilizados para los virus aislados y caracterizados utilizando enfoques de virología clásica. [12] [13]
El ICTV ha publicado informes sobre taxonomía de virus aproximadamente dos veces por década desde 1971 (enumerados a continuación: "Informes"). El noveno informe del ICTV se publicó en diciembre de 2011; [14] el contenido ahora está disponible gratuitamente a través del sitio web de ICTV. [15] A partir de 2017, el décimo informe de ICTV se publicará en línea en el sitio web de ICTV [16] [17] y será de acceso gratuito con capítulos individuales actualizados de forma continua. La taxonomía de 2018 está disponible en línea, [18] e incluye una hoja de cálculo de Excel descargable de todas las especies reconocidas.
ICTVdb es una base de datos de especies y aislamientos que pretende servir como complemento de la base de datos de taxonomía ICTV. El desarrollo de ICTVdB ha contado con el apoyo del ICTV desde 1991 e inicialmente tenía como objetivo ayudar a la investigación taxonómica. La base de datos clasifica los virus basándose principalmente en sus características químicas, tipo genómico , replicación de ácidos nucleicos , enfermedades, vectores y distribución geográfica, entre otras características. [ cita necesaria ]
La base de datos fue desarrollada en la Universidad Nacional de Australia con el apoyo de la Fundación Nacional de Ciencias de EE. UU. y patrocinada por la Colección Estadounidense de Cultivos Tipo . Utiliza el sistema de lenguaje de descripción para taxonomía ( DELTA ), un estándar mundial para el intercambio de datos taxonómicos, desarrollado en la Organización de Investigación Científica e Industrial de la Commonwealth de Australia (CSIRO). DELTA es capaz de almacenar una amplia diversidad de datos y traducirlos a un lenguaje adecuado para informes tradicionales y publicaciones web. Por ejemplo, ICTVdB no contiene información de secuencia genómica, pero puede convertir datos DELTA al formato NEXUS. [19] También puede manejar grandes entradas de datos y es adecuado para compilar largas listas de propiedades de virus, comentarios de texto e imágenes.
ICTVdB ha crecido en concepto y capacidad hasta convertirse en un importante recurso de referencia y herramienta de investigación; en 1999 recibía más de 30.000 visitas combinadas en línea por día desde su sitio principal en la Universidad Nacional de Australia y dos sitios espejo con sede en el Reino Unido y Estados Unidos. [20]
En 2011, el ICTV decidió suspender el proyecto y el sitio web de ICTVdb. Esta decisión se tomó después de que se hizo evidente que la taxonomía proporcionada en el sitio estaba desactualizada durante muchos años y que parte de la información en el sitio era inexacta debido a problemas con la forma en que se consultaba y procesaba la base de datos para admitir el lenguaje natural. salida del sitio web de ICTVdb. ICTV ha iniciado discusiones sobre la mejor manera de solucionar estos problemas, pero decidió que el plazo para las actualizaciones y la corrección de errores era lo suficientemente largo como para que fuera mejor cerrar el sitio en lugar de perpetuar la publicación de información inexacta. [ cita necesaria ] En agosto de 2013, la base de datos permanece en espera. [3] Según algunas opiniones, "ICTV también debería promover el uso de una base de datos pública para reemplazar la base de datos ICTV como almacén de metadatos primarios de virus individuales, y debería publicar resúmenes de los informes ICTV en esa base de datos, de modo que son 'Acceso Abierto'." [3] La base de datos se reactivó en 2017. [17]
Agotado
Y aunque el ICTV dice que un cambio en el nombre formal del virus de la viruela simica podría ocurrir en el próximo año o dos, la revisión no sería una respuesta al brote actual. En cambio, es parte de una revisión amplia de las convenciones de nomenclatura para todas las especies de virus, incluida la viruela simica, después de que el ICTV adoptara cambios en 2020 para estandarizar su formato de nomenclatura.
ID de virus ICTV (P1076) (ver usos )Resumen: El Comité Internacional sobre Taxonomía de Virus cambió recientemente su definición aprobada de especie viral y también suspendió el trabajo en su base de datos de descripción de virus.
