Nicolás de Vergara el Mozo (1540 - 11 de diciembre de 1606) fue un escultor, arquitecto, herrero y vidriero español. Trabajó en la Catedral de Toledo , de la que fue maestro de obras, y en otros edificios religiosos y civiles. Era hijo del arquitecto y escultor Nicolás de Vergara el Viejo y de Catalina de Colonia, y hermano de Juan de Vergara. También era sobrino de los maestros vidrieros Arnao de Vergara y Arnao de Flandes y nieto de Arnao de Flandes el Viejo.
Aún en vida de su padre, el cabildo de la Catedral de Toledo le nombró escultor suyo en el año 1573. Realizó junto a su padre los dos atriles de bronce del coro de la Catedral, y cuando su padre murió dos años después, trabajó con su hermano Juan de Vergara, para terminar los vitrales de la catedral, obras que finalizaron en 1580.
Fue nombrado dos veces maestre de la Catedral, la segunda vez en 1587, permaneciendo en el cargo hasta su muerte. Inició entonces las obras de la Capilla del Sagrario en estilo herreriano y se encargó de las trazas del conjunto arquitectónico de Capilla del Sagrario, Relicario, Sacristía y patio y casa del tesorero. Realizó también la ventana del rosetón de la puerta de los Leones y en la fachada interior de la puerta del reloj el medallón de la Virgen de la Anunciación.
En estas fechas realizó con los maestros Juan Bautista Vázquez el Viejo y Juan Correa de Vivar (pintura) el retablo mayor de la iglesia de Santa María Magdalena de Mondejar (Guadalajara) diseñado por Alonso de Covarruvias. Esta magna y magna obra hoy en día no existe ya que fue destruida en la Guerra Civil Española , pudiéndose admirar en el mismo emplazamiento, una copia exacta del conjunto pictórico y escultórico en toda su magnitud y calidad original.