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NFYA

La subunidad alfa del factor de transcripción nuclear Y es una proteína que en los humanos está codificada por el gen NFYA . [5] [6]

Función

La proteína codificada por este gen es una subunidad de un complejo trimérico NF-Y, que forma un factor de transcripción altamente conservado que se une a los motivos CCAAT en las regiones promotoras de una variedad de genes. [7] La ​​subunidad NFYA se asocia con un dímero apretado compuesto por las subunidades NFYB y NFYC, lo que da como resultado un trímero que se une al ADN con alta especificidad y afinidad. Las interacciones específicas de secuencia del complejo son realizadas por la subunidad NFYA, lo que sugiere un papel como subunidad reguladora. Además, existe evidencia de regulación postranscripcional en este producto génico, ya sea por degradación de proteínas o control de la traducción. Una regulación adicional está representada por el empalme alternativo en el dominio de activación rico en glutamina, con claras preferencias específicas de tejido para las dos isoformas. [8]

El complejo NF-Y actúa como un factor pionero al promover la accesibilidad de la cromatina para facilitar la co-localización de otros factores de transcripción específicos del tipo de célula. [9]

NF-Y también se ha implicado como un actor central en la selección del sitio de inicio de la transcripción (TSS) en animales . [10] Salvaguarda la integridad de la región agotada de nucleosomas y la localización de PIC en los promotores de genes codificadores de proteínas .

Interacciones

Se ha demostrado que NFYA interactúa con el factor de respuesta sérica [11] y ZHX1 . [11] [12] NFYA, NFYB y NFYC forman el complejo NFY y se ha demostrado que el complejo NFY sirve como un factor pionero al promover la accesibilidad de la cromatina para facilitar otros factores de transcripción co-localizadores específicos del tipo de célula. [7]

Estructura

La estructura atómica del heterotrímero NFY en complejo con dsADN se resolvió mediante cristalografía de rayos X (PDB ID 4awl). [13] Utilizando una de las hélices alfa de NFYA como plantilla, se diseñaron péptidos grapados inspirados en la estructura para interrumpir la formación del heterotrímero NFY al evitar que NFYA se una al heterodímero NFYB/C . [14]

Referencias

  1. ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000001167 – Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000023994 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  5. ^ Li XY, Mattei MG, Zaleska-Rutczynska Z, et al. (noviembre de 1991). "Una subunidad del factor de transcripción NF-Y se localiza cerca del complejo mayor de histocompatibilidad en cromosomas humanos y murinos". Genomics . 11 (3): 630–634. doi :10.1016/0888-7543(91)90070-U. PMID  1774067.
  6. ^ Maity SN, de Crombrugghe B (mayo de 1998). "Función de la proteína de unión a CCAAT CBF/NF-Y en la transcripción". Tendencias en ciencias bioquímicas . 23 (5): 174–178. doi :10.1016/S0968-0004(98)01201-8. PMID  9612081.
  7. ^ ab Oldfield AJ, Yang P, Conway AE, et al. (septiembre de 2014). "La proteína NF-Y con dominio de plegamiento de histonas promueve la accesibilidad de la cromatina para factores de transcripción maestros específicos del tipo celular". Molecular Cell . 55 (5): 708–722. doi :10.1016/j.molcel.2014.07.005. PMC 4157648 . PMID  25132174. 
  8. ^ "Entrez Gene: factor de transcripción nuclear NFYA Y, alfa".
  9. ^ Oldfield AJ, Yang P, Conway AE, et al. (septiembre de 2014). "La proteína NF-Y con dominio de plegamiento de histonas promueve la accesibilidad de la cromatina para factores de transcripción maestros específicos del tipo celular". Molecular Cell . 55 (5): 708–722. doi :10.1016/j.molcel.2014.07.005. PMC 4157648 . PMID  25132174.  [ verificación necesaria ]
  10. ^ Oldfield AJ, Henriques T, Kumar D, et al. (julio de 2019). "NF-Y controla la fidelidad de la iniciación de la transcripción en los promotores de genes mediante el mantenimiento de la región depletada de nucleosomas". Nature Communications . 10 (1): 3072. Bibcode :2019NatCo..10.3072O. doi : 10.1038/s41467-019-10905-7 . PMC 6624317 . PMID  31296853. 
  11. ^ ab Yamada K, Osawa H, Granner DK (octubre de 1999). "Identificación de proteínas que interactúan con NF-YA". FEBS Letters . 460 (1): 41–45. Bibcode :1999FEBSL.460...41Y. doi : 10.1016/S0014-5793(99)01311-3 . PMID  10571058. S2CID  28576187.
  12. ^ Yamada K, Printz RL, Osawa H, et al. (agosto de 1999). "ZHX1 humano: clonación, ubicación cromosómica e interacción con el factor de transcripción NF-Y". Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 261 (3): 614–621. doi :10.1006/bbrc.1999.1087. PMID  10441475.
  13. ^ Nardini M, Gnesutta N, Donati G, et al. (Enero de 2013). "El factor de transcripción específico de secuencia NF-Y muestra unión de ADN similar a histonas y ubiquitinación similar a H2B". Celúla . 152 (1–2): 132–143. doi :10.1016/j.cell.2012.11.047. hdl : 2318/1590740 . PMID  23332751.
  14. ^ Jeganathan S, Wendt M, Kiehstaller S, et al. (noviembre de 2019). "Los péptidos restringidos con flexibilidad ajustada inhiben el ensamblaje del factor de transcripción NF-Y". Angewandte Chemie . 58 (48): 17351–17358. doi :10.1002/anie.201907901. PMC 6900064 . PMID  31539186. 

Lectura adicional

Enlaces externos

Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que se encuentra en el dominio público .

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