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Tapa N

El término N cap (N-cap, Ncap) describe un aminoácido en una posición particular dentro de una proteína o polipéptido . [1] [2] [3] [4] [5] [6] El residuo de N cap de una hélice alfa es el primer residuo de aminoácido en el extremo N de la hélice. Más precisamente, se define como el primer residuo (i) cuyo grupo CO está unido por puente de hidrógeno al grupo NH del residuo i+4 (o, a veces, residuo i+3). Debido a esto, a veces también se lo describe como el residuo anterior a la hélice.

Los motivos de recubrimiento son aquellos que se encuentran a menudo en la tapa N. Los giros Asx , los giros ST y los motivos asx se encuentran a menudo en tales situaciones, con el residuo asx o serina o treonina en la tapa N.

La tapa C es el residuo de aminoácido correspondiente en el otro extremo de la hélice.

Referencias

  1. ^ Richardson, JM; Richardson DC (1988). "Preferencias de aminoácidos para ubicaciones específicas en los extremos de las hélices alfa". Science . 240 (4859): 1648–1652. Bibcode :1988Sci...240.1648R. doi :10.1126/science.3381086. PMID  3381086. S2CID  38467101.
  2. ^ Presta, LG; Rose GD (1988). "Capuchones helicoidales". Science . 240 (4859): 1632–1641. Bibcode :1988Sci...240.1632P. doi :10.1126/science.2837824. PMID  2837824.
  3. ^ Doig, AJ; MacArthur MW (1997). "Estructuras de los extremos N de las hélices en proteínas". Protein Science . 6 (1): 147–155. doi :10.1002/pro.5560060117. PMC 2143508 . PMID  9007987. 
  4. ^ Aurora, R; Rose GD (1998). "Captura de hélice". Protein Science . 7 (1): 21–38. doi :10.1002/pro.5560070103. PMC 2143812 . PMID  9514257. 
  5. ^ Gunasekaran, K; Nagarajam HA (1998). "Signos de puntuación estereoquímicos en la estructura de las proteínas" (PDF) . Revista de Biología Molecular . 275 (5): 917–932. doi :10.1006/jmbi.1997.1505. PMID  9480777.
  6. ^ Líder, DP; Milner-White EJ (2011). "La estructura de los extremos de las hélices en proteínas globulares". Proteínas . 79 (3): 1010–1019. doi :10.1002/prot.22942. PMID  21287629. S2CID  22240314.