Jmol es un software informático para modelar estructuras químicas moleculares en tres dimensiones . [2] Jmol devuelve una representación tridimensional de una molécula que puede utilizarse como herramienta de enseñanza, [3] o para investigación, por ejemplo, en química y bioquímica .
Jmol está escrito en el lenguaje de programación Java , por lo que puede ejecutarse en los sistemas operativos Windows , macOS , Linux y Unix , si Java está instalado. Es un software gratuito y de código abierto publicado bajo la Licencia Pública General Reducida de GNU (LGPL) versión 2.0. Existe una aplicación independiente y un kit de desarrollo de software (SDK) que se puede integrar en otras aplicaciones Java, como Bioclipse y Taverna .
Una característica popular es un subprograma que se puede integrar en páginas web para mostrar moléculas de diversas maneras. Por ejemplo, las moléculas se pueden mostrar como modelos de bolas y palos , modelos que llenan el espacio , diagramas de cinta , etc. [4] Jmol admite una amplia gama de formatos de archivos químicos , incluidos Protein Data Bank (pdb), Crystallographic Information File (cif), MDL Molfile (mol) y Chemical Markup Language (CML). También hay una versión solo para JavaScript ( HTML5 ), JSmol , que se puede usar en computadoras sin Java. [5]
El subprograma Jmol, entre otras funciones, ofrece una alternativa al complemento Chime , [3] que ya no se encuentra en desarrollo activo. Si bien Jmol tiene muchas funciones de las que carece Chime, no pretende reproducir todas las funciones de Chime, en particular, el modo Sculpt . Chime requiere la instalación del complemento e Internet Explorer 6.0 o Firefox 2.0 en Microsoft Windows , o Netscape Communicator 4.8 en Mac OS 9. Jmol requiere la instalación de Java y funciona en una amplia variedad de plataformas. Por ejemplo, Jmol es completamente funcional en Mozilla Firefox , Internet Explorer , Opera , Google Chrome y Safari .
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