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proteopedia

Proteopedia es una wiki , una enciclopedia 3D de proteínas y otras moléculas . [1] [2] [3] [4]

Sitio web

El sitio contiene una página para todas las entradas en el Protein Data Bank (PDB), así como páginas que son más descriptivas de las estructuras de las proteínas en general, como la acetilcolinesterasa , [5] la hemoglobina , [6] y el fotosistema II [7]. ] con una vista Jmol que resalta sitios funcionales y ligandos . Emplea una herramienta de creación de escenas para que los usuarios no tengan que aprender el lenguaje de escritura JSmol para crear escenas moleculares personalizadas. Las escenas personalizadas se adjuntan fácilmente a "enlaces verdes" en el texto descriptivo que muestra esas escenas en JSmol. Un navegador web es todo lo que se necesita para acceder al sitio y a la información 3D; no es necesario instalar visores.

Proteopedia fue la ganadora del premio 2010 al mejor sitio web de la revista The Scientist . [8]

Términos de licencia

Todo el contenido agregado por el usuario es gratuito y está cubierto por la Licencia de documentación libre GNU . Proteopedia está alojada en el Centro de Proteómica Estructural de Israel [9] en el Instituto Weizmann de Ciencias .

Referencias

  1. ^ Hodis E, Prilusky J, Martz E, Silman I, Moult J, Sussman JL (2008). "Proteopedia: una 'wiki' científica que cierra la brecha entre la estructura tridimensional y la función de las biomacromoléculas". Genoma Biol . 9 (8): R121. doi : 10.1186/gb-2008-9-8-r121 . PMC  2575511 . PMID  18673581.
  2. ^ Martz E (2009). "Proteopedia.Org: una" Wiki "científica que cierra la brecha entre la estructura 3D y la función de las biomacromoléculas". Biopolímeros . 92 (1): 76–7. doi : 10.1002/bip.21126 . PMID  19117028.
  3. ^ Hodis E, Prilusky J, Sussman JL (2010). "Proteopedia: un recurso web colaborativo y virtual en 3D para la estructura y función de proteínas y biomoléculas". Educación en Bioquímica y Biología Molecular . 38 (5): 341–2. doi :10.1002/bmb.20431. PMID  21567857.
  4. ^ Prilusky, J; Hodis, E.; Canner, D.; Decatur, Washington; Oberholser, K.; Martz, E.; Berchanski, A.; Harel, M.; Sussman, JL (agosto de 2011). "Proteopedia: un informe de estado sobre la enciclopedia web 3D colaborativa de proteínas y otras biomoléculas". Revista de biología estructural . 175 (2): 244–252. doi :10.1016/j.jsb.2011.04.011. PMID  21536137.
  5. ^ "Acetilcolinesterasa". Proteopedia.
  6. ^ "Hemoglobina". Proteopedia.
  7. ^ "Fotosistema II". Proteopedia.
  8. ^ Luiggi C (septiembre de 2010). "Web Gems Presentamos a los ganadores del primer Labbies anual, nuestros premios al mejor multimedia basado en web otorgados por laboratorios: Ganador del sitio web: Proteopedia". El científico . 24 (9): 47. Archivado desde el original el 12 de abril de 2011 . Consultado el 15 de diciembre de 2010 . Muy absorbente. Me mantuvo buscando y jugando (y aprendiendo) con él durante mucho tiempo. Muy informativo y un buen recurso.
  9. ^ "El Centro de Proteómica Estructural de Israel". 12 de noviembre de 2015.

enlaces externos