Molekel es un programa de visualización molecular multiplataforma de software libre . [1] Fue desarrollado originalmente en la Universidad de Ginebra por Peter F. Flükiger en la década de 1990 para Silicon Graphics Computers. En 1998, Stefan Portmann asumió la responsabilidad y lanzó la versión 3.0. La versión 4.0 fue una versión casi independiente de la plataforma. Los desarrollos posteriores llevaron a la versión 4.3, antes de que Stefan Portmann se marchara y dejara de desarrollar los códigos. En 2006, el Centro Nacional Suizo de Supercomputación (CSCS) reinició el proyecto y la versión 5.0 se lanzó el 21 de diciembre de 2006. [2]
Molekel utiliza VTK y Qwt y por tanto también Qt .