Cuando el Ingeniero presenta a Kim a sus compañeras, son hostiles con ella, pues, siendo virgen, tiene más posibilidades de ser nombrada Miss Saigón, porque, de acuerdo al Ingeniero, "pagarían la luna por carne fresca".
En el club, están dos sargentos, John y Chris, clientes preferidos del Ingeniero.
Sin embargo, se fija en Kim, la única que no presenta un acto provocativo.
Finalmente, el título de Miss Saigón es otorgado a otra bailarina, Gigi.
John se prepara para tener una aventura con ella, hasta que le pide que la saque de Vietnam, y se la lleve a Estados Unidos, solo para ser rechazada hostilmente (The Heat is On in Saigon).
Mientras tanto, John habla con el Ingeniero y compra, a un precio elevado, la virginidad de Kim.
Sin embargo, Chris rechaza la oferta, pues no quiere marcar a Kim de por vida (The Transaction).
Kim lo convence para ir a un lugar más privado, una habitación anexa al club, donde terminan teniendo relaciones sexuales (The Dance).
Chris llama a John para pedirle permiso para llegar a la base con un día de retraso, sin embargo, John le recrimina que, por el caos que se está desatando en Saigón, no es el mejor momento para enamorarse.
Chris se niega, y amenaza al Ingeniero a punta de pistola.
Las bailarinas del club preparan la ceremonia para Kim y Chris, quien desconoce que se está casando.
Justo después de brindar por "Miss Saigón", entra al club Thuy, primo y ex prometido de Kim, quien al saber que ella ya no es virgen, y que se ha unido a Chris, los amenaza con un arma, a él y a las bailarinas, pero se va al saber que Kim no cambiará de opinión respecto a Chris, y que no cumplirá con la promesa de sus padres (Thuy's Arrival).
Una vez solos, Chris y Kim hablan de lo que les depara el futuro.
Él le hace saber a Kim que nunca la dejará sola, y ella promete serle fiel.
Pero se da cuentamde que le hace falta algo importante para llegar a América: una visa (If You Want to Die in Bed).
Entre el público, está Chris, con su esposa Ellen, que ha asistido por insistencia de John.
El Ingeniero lo lleva con ella, pero les advierte que es mejor hablar en donde nadie los oiga (What a Waste).
Mientras John va a por Chris, Kim se prepara para recibirlo, cuando siente la presciencia del espíritu de Thuy, declarando que nunca podrá olvidarlo.
Kim revive el último día que vio a Chris, la caída de Saigón.
Kim despierta en el suelo del vestidor, y primero se pregunta si todo será como antes una vez de Chris esté con ella una vez más, pero llega a la conclusión de que tanto ella como Chris y Tam serán una familia, y que Chris ha mantenido el voto que hizo años atrás (Sun and Moon (Reprise)).
El Ingeniero llega y le da un papel que contiene la dirección del hotel de Chris, pues no confía en que John volverá como había prometido, y con él, se irá su oportunidad de obtener una visa americana.
John llega, y aunque se alegra por ellos, les recuerda que tienen otro problema: Tam.
Mientras tanto, de vuelta con el Ingeniero, Kim le anuncia que todo está listo para su última actuación.
Kim muere en brazos de Chris, mientras el llora abatido sobre su cuerpo (Little God of My Heart/ Finale).