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BPIFB3

La familia B que contiene pliegues BPI, miembro 3 (BPIFB3) es una proteína que en los humanos está codificada por el gen BPIFB3 . [5] Se han detectado dos variantes en humanos. [6] [7]

Superfamilia

BPIFB3 es un miembro de una superfamilia de proteínas plegadas BPI definida por la presencia del pliegue proteico bactericida/que aumenta la permeabilidad (pliegue BPI) que está formado por dos dominios similares en forma de "bumerán". [8] Esta superfamilia también se conoce como la familia BPI/LBP/PLUNC o la familia BPI / LPB / CETP . [9] El pliegue BPI crea bolsillos de unión apolares que pueden interactuar con moléculas hidrófobas y anfipáticas , como las cadenas de carbono acilo del lipopolisacárido que se encuentran en las bacterias Gram-negativas , pero los miembros de esta familia pueden tener muchas otras funciones.

BPIFB3 es un miembro de la familia de genes de pliegue BPI y de la superfamilia de proteínas BPI/LBP/PLUN

Los genes de la superfamilia BPI/LBP/PLUNC se encuentran en todas las especies de vertebrados, incluidos homólogos distantes en especies no vertebradas como insectos, moluscos y lombrices intestinales. [10] [11] Dentro de esa amplia agrupación se encuentra la familia de genes BPIF cuyos miembros codifican el motivo estructural del pliegue BPI y se encuentran agrupados en un solo cromosoma, por ejemplo, el cromosoma 20 en humanos, el cromosoma 2 en ratones, el cromosoma 3 en ratas, el cromosoma 17 en cerdos y el cromosoma 13 en vacas. La familia de genes BPIF se divide en dos agrupaciones, BPIFA y BPIFB. En humanos, BIPFA consta de 3 genes que codifican proteínas BPIFA1 , BPIFA2 , BPIFA3 y 1 pseudogén BPIFA4P ; mientras que BPIFB consta de 5 genes que codifican proteínas BPIFB1 , BPIFB2 , BPIFB3 , BPIFB4 , BPIFB6 y 2 pseudogenes BPIFB5P , BPIFB9P . Lo que aparecen como pseudogenes en humanos pueden aparecer como genes completamente funcionales en otras especies.

BPIFB3 se identificó por primera vez directamente en un análisis del epitelio olfativo de ratas como RYA3 [12] y se reconoció que era un miembro de la superfamilia de pliegues BPI. [13] [11] En humanos, anteriormente se conocía como "proteína 3 asociada al carcinoma del epitelio nasal, pulmonar y del paladar largo", codificada por el gen LPLUNC3 . El gen BPIFB3 se encuentra con otros miembros de la familia de genes BPIF en un grupo en el cromosoma 20.

Función

BPIFB3/RYA3 se expresa en gran medida en el epitelio olfativo y la lengua, [12] [13] dentro del citoplasma de las células, y se cree que es similar a una proteína de unión a olores que presenta moléculas de olores a las moléculas receptoras de olores químicos. [14]

Al igual que otros miembros de la familia de pliegues BPI involucrados en la defensa contra infecciones, BPIFB3 puede estar involucrado en respuestas a infecciones virales como los enterovirus coxsackievirus B y poliovirus en tejido epitelial y endotelial. [15] [16] Su ubicación citoplasmática parece estar localizada en el retículo endoplasmático (RE) e influye en la replicación del coxsackievirus B; cuando BPIFB3 es eliminado en sistemas experimentales, la replicación del coxsackievirus B aumenta drásticamente. Se ha observado en el RE que está físicamente asociado con otro miembro de la familia, BPIFB6, y la modulación de cualquiera de estas dos proteínas puede mejorar o suprimir la liberación de enterovirus de las células. [17]

Referencias

  1. ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000186190 – Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000068008 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
  5. ^ "Pliegue BPIFB3 BPI que contiene al miembro 3 de la familia B [Homo sapiens (humano)] - Gen - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov .
  6. ^ "Pliegue de BPI del Homo sapiens que contiene al miembro 3 de la familia B (BPIFB3), variante de transcripción 1, ARNm". 31 de diciembre de 2022.
  7. ^ "Pliegue de BPI del Homo sapiens que contiene miembro 3 de la familia B (BPIFB3), variante de transcripción 2, ARNm". 31 de diciembre de 2022.
  8. ^ Beamer LJ, Carroll SF, Eisenberg D (abril de 1998). "La familia de proteínas BPI/LBP: un análisis estructural de regiones conservadas". Protein Science . 7 (4): 906–914. doi :10.1002/pro.5560070408. PMC 2143972 . PMID  9568897. 
  9. ^ "Familia de dominios proteicos conservados CDD: BPI". www.ncbi.nlm.nih.gov .
  10. ^ Beamer LJ, Fischer D, Eisenberg D (julio de 1998). "Detección de parientes lejanos de proteínas de unión a LPS y de transporte de lípidos en mamíferos". Protein Science . 7 (7): 1643–1646. doi :10.1002/pro.5560070721. PMC 2144061 . PMID  9684900. 
  11. ^ ab Bingle CD, Seal RL, Craven CJ (agosto de 2011). "Nomenclatura sistemática para las proteínas PLUNC/PSP/BSP30/SMGB como una subfamilia de la superfamilia que contiene plegamientos BPI". Biochemical Society Transactions . 39 (4): 977–983. doi :10.1042/BST0390977. PMC 3196848 . PMID  21787333. 
  12. ^ ab Dear, TN; Boehm, T; Keverne, EB; Rabbitts, TH (octubre de 1991). "Nuevos genes para proteínas de unión a ligandos potenciales en subregiones de la mucosa olfativa". The EMBO Journal . 10 (10): 2813–9. doi :10.1002/j.1460-2075.1991.tb07830.x. PMC 452990 . PMID  1915264. 
  13. ^ ab Andrault, JB; Gaillard, I; Giorgi, D; Rouquier, S (agosto de 2003). "Expansión de la familia BPI por duplicación en el cromosoma humano 20: caracterización del grupo de genes RY en 20q11.21 que codifica transportadores olfativos/péptidos similares a antimicrobianos". Genómica . 82 (2): 172–84. doi :10.1016/s0888-7543(03)00102-2. PMID  12837268.
  14. ^ Rihani, Karen; Ferveur, Jean-François; Briand, Loïc (30 de marzo de 2021). "El misterio de 40 años de las proteínas que se unen a los olores de los insectos". Biomolecules . 11 (4): 509. doi : 10.3390/biom11040509 . PMC 8067015 . PMID  33808208. 
  15. ^ Coyne, CB; Bozym, R; Morosky, SA; Hanna, SL; Mukherjee, A; Tudor, M; Kim, KS; Cherry, S (20 de enero de 2011). "El cribado comparativo de ARNi revela factores del huésped implicados en la infección por enterovirus de monocapas endoteliales polarizadas". Cell Host & Microbe . 9 (1): 70–82. doi :10.1016/j.chom.2011.01.001. PMC 3048761 . PMID  21238948. 
  16. ^ Delorme-Axford, E; Morosky, S; Bomberger, J; Stolz, DB; Jackson, WT; Coyne, CB (9 de diciembre de 2014). "BPIFB3 regula la autofagia y la replicación del virus Coxsackie B a través de una vía no canónica independiente de la maquinaria de iniciación central". mBio . 5 (6): e02147. doi :10.1128/mBio.02147-14. PMC 4324245 . PMID  25491355. 
  17. ^ Morosky S, Lennemann NJ, Coyne CB (mayo de 2016). "BPIFB6 regula el tráfico de la vía secretora y la replicación de enterovirus". Journal of Virology . 90 (10): 5098–5107. doi :10.1128/JVI.00170-16. PMC 4859712 . PMID  26962226. 

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