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Michael P. Snyder

Michael Paul Snyder es un genómico estadounidense y profesor de la cátedra Stanford B. Ascherman [2] [3] y, desde 2009, presidente de genética y director de genómica y medicina personalizada en la Universidad de Stanford . [2] Es el exdirector del Centro de Genómica y Proteómica de Yale . [1] Fue elegido miembro de la Academia Estadounidense de las Artes y las Ciencias en 2015. [4] Durante su mandato como presidente del departamento en Stanford, US News & World Report ha clasificado a la Universidad de Stanford en primer lugar o empatado en el primer lugar en genética, genómica y bioinformática. [5]

Snyder ha cofundado empresas en genética , genómica y medicina personalizada, entre ellas Personalis, [6] una empresa que desarrolla software para interpretar genomas después de la secuenciación; January AI, [7] una startup de salud; Protometrix; [8] Affomix; [9] y Q Bio. [10]

Snyder ha sido investigador principal del proyecto ENCODE desde su inicio en 2003, [11] y codirector del Centro de Genómica de Células Madre del CIRM [12] y director del Centro de Genoma de Regulación Génica. [13]

Snyder fue pionero en el uso de perfiles longitudinales multiómicos para el seguimiento de la salud. [14] [15]

Vida temprana y educación

Snyder nació en 1955 y creció en las afueras de Pottstown, Pensilvania . [16] [17] Su padre, Kermit Snyder, era contador y su madre, Phyllis Snyder, era maestra de escuela primaria. Snyder asistió a la escuela secundaria Owen J Roberts en Pottstown. Recibió una licenciatura en química y biología de la Universidad de Rochester , Nueva York, con una beca. [18] Luego recibió un doctorado en biología del Instituto de Tecnología de California , donde se formó en el laboratorio de Norman Davidson . [19] Snyder completó su formación postdoctoral en la Facultad de Medicina de la Universidad de Stanford en el laboratorio de Ronald W. Davis . [19] Allí participó en varios proyectos, incluido el establecimiento de la clonación exitosa de genes utilizando anticuerpos. [4]

Carrera

Snyder trabajó en la Universidad de Yale en 1986 como profesor asistente en el departamento de biología, [18] y se le concedió la titularidad en 1994. En 1998, el departamento de biología se dividió y Snyder sirvió como presidente del nuevo departamento de biología molecular, celular y del desarrollo (MCDB) hasta 2004. [19] Su laboratorio trabajó en la segregación cromosómica y la polaridad celular, y descubrió una serie de genes involucrados en estos procesos. [20] [21]

Su laboratorio propuso los primeros modelos mediante los cuales los eucariotas seleccionan sitios de crecimiento celular. [22] [21]

En 2009, Snyder presidió el departamento de genética de la Universidad de Stanford y dirigió el Centro de Genómica y Medicina Personalizada. [3] [19] Snyder fue investigador principal del Centro de Excelencia en Ciencias del Genoma (CEGS) de 2001 a 2011, fue investigador principal de las Becas de Capacitación del NIH en Genómica y Proteómica (primero en Yale, ahora en Stanford) desde 2004, y es codirector del Centro de Genómica de Células Madre del CIRM [23] y director del Centro de Genoma de Regulación Génica. [24] Snyder fue presidente de la Organización del Proteoma Humano de EE. UU. de 2006 a 2008, y de la Organización Internacional del Proteoma Humano de 2017 a 2018. Actualmente dirige el centro de producción de la Enciclopedia de Elementos del ADN ( ENCODE ) de los Institutos Nacionales de Salud para el mapeo de las regiones reguladoras del genoma humano. [25]

Snyder ha cofundado empresas de biotecnología, entre ellas Personalis, [6] SensOmics, [26] Qbio, [10] [27] [28] January AI, [7] Filtricine, Mirvie, Protos, Protometrix [8] (ahora parte de Thermo Fisher Scientific ) y Affomix [9] (ahora parte de Illumina ). [29]

Investigación

Snyder ha hecho contribuciones a la medicina , la genómica y la biotecnología . El laboratorio de Snyder ha inventado una serie de tecnologías genómicas y de sistemas novedosas. El laboratorio de Snyder en Yale se centró inicialmente en estudiar el genoma de la levadura Saccharomyces cerevisiae , un organismo modelo eucariota de uso común en genética y biología molecular. [30] Más tarde, el laboratorio comenzó a utilizar las mismas técnicas para observar el genoma humano . [30]

En 2003, el Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano (NHGRI) de Estados Unidos puso en marcha el proyecto Enciclopedia de Elementos del ADN (ENCODE), con el objetivo de identificar todos los elementos funcionales del genoma humano. Ha sido uno de los investigadores principales del proyecto ENCODE desde su inicio en 2003 y su laboratorio ha aportado una gran cantidad de conjuntos de datos. [19]

Publicaciones seleccionadas

  1. Alavi, Arash, et al. Alavi, Arash; Bogu, Gireesh K.; Wang, Meng; Rangan, Ekanath Srihari; Brooks, Andrew W.; Wang, Qiwen; Higgs, Emily; Celli, Alessandra; Mishra, Tejaswini; Metwally, Ahmed A.; Cha, Kexin; Knowles, Peter; Alavi, Amir A.; Bhasin, Rajat; Panchamukhi, Shrinivas; Celis, Diego; Aditya, Tagore; Honkala, Alexander; Rolnik, Benjamin; Hunting, Erika; Dagan-Rosenfeld, Orit; Chauhan, Arshdeep; Li, Jessi W.; Bejikian, Caroline; Krishnan, Vandhana; McGuire, Lettie; Li, Xiao; Bahmani, Amir; Snyder, Michael P. (enero de 2022). "Sistema de alerta en tiempo real para COVID-19 y otros eventos de estrés utilizando datos portátiles | Nature Medicine". Medicina natural . 28 (1): 175–184. doi :10.1038/s41591-021-01593-2. PMC  8799466 . PMID  34845389.Medicina natural 29 de noviembre de 2021:1-0.
  2. Bahmani, Amir y otros. Bahmani, Amir; Alavi, Arash; Buergel, Thore; Upadhyayula, Sushil; Wang, Qiwen; Ananthakrishnan, Srinath Krishna; Alavi, Amir; Celis, Diego; Gillespie, Dan; Joven, Gregorio; Xing, Ziye; Nguyen, Minh Hoang Huynh; Haque, Audrey; Mathur, Ankit; Payne, Josh; Mazaheri, Ghazal; Li, Jason Kenichi; Kotipalli, Pramod; Liao, Lisa; Bhasin, Rajat; Cha, Kexin; Rolnik, Benjamín; Celli, Alessandra; Dagan-Rosenfeld, Orit; Higgs, Emily; Zhou, Wenyu; Berry, Camille Lauren; Van Winkle, Katherine Grace; Contrapois, Kevin; Ray, Utsab; Apuestas, Keith; Datta, Somalee; Li, Xiao; Snyder, Michael P. (1 de octubre de 2021). "Una plataforma escalable, segura e interoperable para la gestión de la salud basada en datos profundos". Nature Communications . 12 (1). Springer Science and Business Media LLC: 5757. Bibcode : 2021NatCo..12.5757B. doi :10.1038/s41467-021-26040-1. ISSN  2041-1723. PMC 8486823. PMID 34599181  . 
  3. Mishra, Tejaswini, et al. Mishra, Tejaswini; Wang, Meng; Metwally, Ahmed A.; Bogu, Gireesh K.; Brooks, Andrew W.; Bahmani, Amir; Alavi, Arash; Celli, Alessandra; Higgs, Emily; Dagan-Rosenfeld, Orit; Fay, Bethany; Kirkpatrick, Susan; Kellogg, Ryan; Gibson, Michelle; Wang, Tao; Hunting, Erika M.; Mamic, Petra; Ganz, Ariel B.; Rolnik, Benjamin; Li, Xiao; Snyder, Michael P. (18 de noviembre de 2020). "Detección presintomática de COVID-19 a partir de datos de relojes inteligentes". Ingeniería Biomédica de la Naturaleza . 4 (12). Springer Science and Business Media LLC: 1208–1220. doi :10.1038/s41551-020-00640-6. Código IATA :  10 ...​ ​ 
  4. Robertson G, Hirst M, Bainbridge M, Bilenky M, Zhao Y, Zeng T, Euskirchen G, Bernier B, Varhol R, Delaney A, Thiessen N, …, Snyder M y Jones S. Robertson, G.; Hirst, M.; Bainbridge, M.; Bilenky, M.; Zhao, Y.; Zeng, T.; Euskirchen, G.; Bernier, B.; Varhol, R.; Delaney, A.; Thiessen, N.; Griffith, OL; He, A.; Marra, M.; Snyder, M.; Jones, S. (2007). "Perfiles de todo el genoma de la asociación del ADN de STAT1 utilizando inmunoprecipitación de cromatina y secuenciación masiva en paralelo - PubMed". Nature Methods . 4 (8): 651–657. doi :10.1038/nmeth1068. Número de modelo: PMID  17558387. Número de modelo: S2CID  28531263.. Métodos Naturales. 2007;4:651-7.
  5. Horak, Christine E., et al. Horak, CE; Luscombe, NM; Gerstein, M.; Weissman, SM; Snyder, M. (2002). "Sitios de unión de GATA-1 mapeados en el locus de beta-globina mediante análisis de chip-chIp de mamíferos - PubMed". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 99 (5): 2924–2929. doi : 10.1073/pnas.052706999 . PMC 122449 . PMID  11867748. . Actas de la Academia Nacional de Ciencias 99.5 (2002): 2924-2929.
  6. Consorcio del Proyecto ENCODE. Consorcio del Proyecto ENCODE (2012). "Una enciclopedia integrada de elementos de ADN en el genoma humano - PubMed". Nature . 489 (7414): 57–74. Bibcode :2012Natur.489...57T. doi :10.1038/nature11247. PMC 3439153 . PMID  22955616. . Naturaleza. 2012. 489(7414): 57-74.
  7. Wang Z, Gerstein M, Snyder M. Wang, Z.; Gerstein, M.; Snyder, M. (2009). "RNA-Seq: una herramienta revolucionaria para la transcriptómica - PubMed". Nature Reviews. Genética . 10 (1): 57–63. doi :10.1038/nrg2484. PMC 2949280 . PMID  19015660. . Nat Rev Genet. Enero de 2009;10(1):57-63. PMID 19015660.
  8. Hudson ME, Pozdnyakova I, Haines K, Mor G, Snyder M. Hudson, ME; Pozdnyakova, I.; Haines, K.; Mor, G.; Snyder, M. (2007). "Identificación de proteínas expresadas diferencialmente en cáncer de ovario utilizando microarreglos de proteínas de alta densidad - PubMed". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 104 (44): 17494–17499. Bibcode :2007PNAS..10417494H. doi : 10.1073/pnas.0708572104 . PMC 2077284 . PMID  17954908. . Proc Natl Acad Sci Estados Unidos. 2007;104: 17494-9.
  9. Kasowski M, Grubert F, Heffelfinger C, Hariharan M, Asabere A, Waszak SM, Habegger L, Rozowsky J, Shi M, Urban AE, … Weissman SM, Gerstein MB, Korbel JO, Snyder M. Kasowski, M.; Grubert, F.; Heffelfinger, C.; Hariharan, M.; Asabere, A.; Waszak, SM; Habegger, L.; Rozowsky, J.; Shi, M.; Urban, AE; Hong, MY; Karczewski, KJ; Huber, W.; Weissman, SM; Gerstein, MB; Korbel, JO; Snyder, M. (2010). "Variación en la unión del factor de transcripción entre humanos - PubMed". Science . 328 (5975): 232–235. doi  : 10.1126 / science.1183621.PMC 2938768.PMID 20299548 . . Ciencia. 2010. 328(5975): 232-5. Publicación electrónica 2010. PMID 20299548.
  10. Borneman AR, Gianoulis TA, Zhang ZD, Yu H, Rozowsky J, Seringhaus MR, Wang LY, Gerstein M, Snyder M. Borneman, AR; Gianoulis, TA; Zhang, ZD; Yu, H.; Rozowsky, J.; Seringhaus, MR; Wang, LY; Gerstein, M.; Snyder, M. (2007). "Divergencia de los sitios de unión de factores de transcripción en especies de levaduras relacionadas - PubMed". Science . 317 (5839): 815–819. doi :10.1126/science.1140748. PMID  17690298. S2CID  21535866.. Ciencia. 2007;317: 815-19.
  11. Chen R, Mias GI, Li-Pook-Than J, Jiang L, … Snyder M. Chen, R.; et al. (2012). "El perfil ómico personal revela fenotipos moleculares y médicos dinámicos - PubMed". Cell . 148 (6): 1293–1507. doi :10.1016/j.cell.2012.02.009. PMC 3341616 . PMID  22424236. . Célula. 2012;148:1293-307.
  12. Li X, Dunn J, Salins D, Zhou G, Zhou W, Schüssler-Fiorenza Rose SM, Perelman D, Colbert E, Runge R, Rego S, Sonecha R, Datta S, McLaughlin T, Snyder M. Li, X.; Dunn, J.; Salins, D.; Zhou, G.; Zhou, W.; Schüssler-Fiorenza Rose, SM; Perelman, D.; Colbert, E.; Runge, R.; Rego, S.; Sonecha, R.; Datta, S.; McLaughlin, T.; Snyder, MP (2017). "Salud digital: el seguimiento de los fisiomas y la actividad mediante biosensores portátiles revela información útil relacionada con la salud - PubMed". PLOS Biology . 15 (1): e2001402. doi : 10.1371/journal.pbio.2001402 . PMC 5230763 . PMID  28081144. 12 de enero de 2017;15(1):e2001402. doi: 10.1371/journal.pbio.2001402. PMID 28081144

Libro

Premios y honores

Referencias

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  30. ^ ab Bechard, Deni Ellis (diciembre de 2021). «Body Count: How Michael Snyder's self-monitoring project could transform human health» (Recuento de cadáveres: cómo el proyecto de automonitoreo de Michael Snyder podría transformar la salud humana). Stanford Magazine . Consultado el 2 de diciembre de 2021 .
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