El riboswitch SAM-SAH es una estructura de ARN conservada en ciertas bacterias que se une a S -adenosilmetionina (SAM) y S -adenosilhomocisteína (SAH) y, por lo tanto, se presume que es un riboswitch . [1] Los riboswitches SAM-SAH no comparten ningún parecido estructural aparente con los riboswitches conocidos que se unen a SAM o SAH. Las afinidades de unión para ambos compuestos son similares, pero la unión para SAH es al menos algo más fuerte. Los ribointerruptores SAM-SAH se encuentran exclusivamente en Rhodobacterales , un orden de alfaproteobacterias . Siempre se encuentran en las regiones 5' aparentes no traducidas de los genes metK , que codifican la enzima ( metionina adenosiltransferasa ) que sintetiza SAM.
Dada esta asociación genética, se propuso que los riboswitches SAM-SAH probablemente funcionen como ARN sensores de SAM. Los riboswitches SAM-SAH son relativamente pequeños entre los riboswitches conocidos, lo que podría estar relacionado con su incapacidad para discriminar contra SAH. Sin embargo, la capacidad de rechazar SAH como ligando podría no ser importante en condiciones fisiológicas, porque la concentración celular de SAM es mayor. [2]
Una región de la estructura conservada de los riboswitches SAM-SAH incluye una secuencia Shine-Dalgarno predicha ( sitio de unión al ribosoma ) de los genes metK posteriores . Estos nucleótidos son necesarios para una unión óptima al ligando y pueden formar un pseudonudo con el bucle terminal dentro de la estructura principal de bucle de tallo . La oclusión de la secuencia Shine-Dalgarno podría ser el mecanismo por el cual los ribointerruptores SAM-SAH regulan la expresión de los genes posteriores.
La estructura tridimensional de un riboswitch SAM-SAH ha sido determinada por dos grupos que trabajan de forma independiente. [3] [4]