Lista de software de neuroimagen

El software de neuroimagen se utiliza para estudiar la estructura y el funcionamiento del cerebro. Para ver un centro de intercambio de información financiado por el NIH Blueprint for Neuroscience Research que contiene muchas de estas aplicaciones de software, así como hardware, etc., visite el sitio web del NITRC.

• 3D Slicer Software multipropósito, extensible, gratuito y de código abierto para visualización y análisis.
• Software de análisis y visualización 3D Amira
• Análisis de imágenes neurológicas funcionales (AFNI)
• Análisis desarrollado por el Recurso de Imágenes Biomédicas (BIR) de Mayo Clinic .
• Paquete de análisis de imágenes cerebrales
• CamBA
• Laboratorio Caret Van Essen, Universidad de Washington en St. Louis
• CONN (caja de herramientas de conectividad funcional)
• Imágenes de difusión en Python (DIPY) ^[1]
• DL+Directo ^[2]
• Laboratorio de electroencefalografía
• Biblioteca de software FMRIB (FSL)
• Surfista libre
• Caja de herramientas de anatomía computacional
• Imaris Imaris para neurocientíficos
• ISAS (Análisis SPECT ictal-interictal por SPM)
• LONI Pipeline , Laboratorio de imágenes neurológicas, USC
• Líder-DBS
• Mango ^[3]
• NITRC The Neuroimaging Informatics Tools and Resources Clearinghouse. Una base de datos financiada por el NIH sobre herramientas de neuroimagen
• NeuroKit , una caja de herramientas de código abierto de Python para el procesamiento de señales fisiológicas
• Caja de herramientas de biomarcadores neurofisiológicos
• PyNets: un flujo de trabajo reproducible para el aprendizaje de conjuntos de connectomas estructurales y funcionales (PyNets)
• Mapeo diferencial basado en semillas (anteriormente mapeo diferencial firmado, SDM): un método para realizar metanálisis de estudios de neuroimagen basados ​​en vóxeles.
• Spinal Cord Toolbox (SCT) es el primer software integral y de código abierto para procesar imágenes de resonancia magnética de la médula espinal. ^[4]
• Mapeo paramétrico estadístico (SPM)

Referencias

1. Garyfallidis, Eleftherios; Brett, Matthew; Amirbekian, Bagrat; Rokem, Ariel; van der Walt, Stefan; Descoteaux, Maxime; Nimmo-Smith, Ian; Dipy, colaboradores (2014). "Dipy, una biblioteca para el análisis de datos de resonancia magnética de difusión". Frontiers in Neuroinformatics . 8 : 8. doi : 10.3389/fninf.2014.00008 . ISSN  1662-5196. PMC  3931231 . PMID  24600385. {{cite journal}}: |first8=tiene nombre genérico ( ayuda )
2. Rebsamen, Michael; Rummel, Christian; Reyes, Mauricio; Wiest, Roland; McKinley, Richard (diciembre de 2020). "Estimación directa del grosor cortical mediante segmentación anatómica basada en aprendizaje profundo y parcelación de la corteza". Mapeo cerebral humano . 41 (17): 4804–4814. doi :10.1002/hbm.25159. PMC 7643371 . PMID  32786059. 
3. Sadigh-Eteghad S, Majdi A, Farhoudi M, Talebi M, Mahmoudi J (2014). "Diferentes patrones de activación cerebral en el envejecimiento normal y la enfermedad de Alzheimer desde la perspectiva cognitiva: metanálisis utilizando la estimación de la probabilidad de activación". Revista de Ciencias Neurológicas . 343 (1): 159–66. doi :10.1016/j.jns.2014.05.066. PMID  24950901. S2CID  24359894.
4. Cohen-Adad J, De Leener B, Benhamou M, Cadotte D, Fleet D, Cadotte A, Fehlings MG, Pelletier Paquette JP, Thong W, Taso M, Collins DL, Callot V, Fonov V. Spinal Cord Toolbox: un marco de código abierto para procesar datos de resonancia magnética de la médula espinal. Actas de la 20.ª reunión anual de la OHBM, Hamburgo, Alemania, 2014:3633