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MAPAS DE LIPIDOS

LIPID MAPS (Estrategia de vías y metabolitos lipídicos) es un portal web diseñado para ser una puerta de acceso a recursos de lipidómica . El recurso ha encabezado una clasificación de lípidos biológicos , dividiéndolos en ocho categorías generales. [1] LIPID MAPS proporciona metodologías estandarizadas para el análisis de lípidos mediante espectrometría de masas, por ejemplo, [2] [3] [4]

Los MAPAS LIPÍDICOS se han citado como evidencia de una creciente apreciación del estudio del metabolismo lipídico [5] y del rápido desarrollo y estandarización del campo de la lipidómica [6] [7]

Los recursos clave de LIPID MAPS incluyen:

Las herramientas disponibles en LIPID MAPS permiten a los científicos identificar los lípidos probables en sus muestras a partir de datos de espectrometría de masas , un método común para analizar lípidos en especímenes biológicos. En particular, LipidFinder [10] permite el análisis de datos de espectrometría de masas. También hay tutoriales y material educativo sobre lípidos disponibles en el sitio. [11]

En enero de 2020, LIPID MAPS se convirtió en un servicio ELIXIR [12] y, en 2024, en un recurso de datos central. Además, se unió a la Coalición Global de Biodatos como recurso central de biodatos [13] .

Historia

LIPID MAPS se fundó en 2003 con financiación del NIH . [14] LIPID MAPS se financió anteriormente mediante una subvención multiinstitucional de Wellcome , y ahora se financia mediante un premio de la Asociación MRC , organizado conjuntamente por la Universidad de Cardiff dirigida por la profesora Valerie O'Donnell, el Instituto Babraham , la UCSD y la Universidad de Swansea , y la Universidad de Edimburgo . El obituario de Wakelam describe a LIPID MAPS como unificador del campo de la lipidómica. [15]

LIPID MAPS está patrocinado por Cayman Chemical y Avanti Polar Lipid

Referencias

  1. ^ Fahy E, Subramaniam S, Murphy RC, Nishijima M, Raetz CR, Shimizu T, Spener F, van Meer G, Wakelam MJ, Dennis EA (abril de 2009). "Actualización del sistema de clasificación integral LIPID MAPS para lípidos". Journal of Lipid Research . 50 Suppl (S1): S9-14. doi : 10.1194/jlr.R800095-JLR200 . PMC 2674711 . PMID  19098281. 
  2. ^ Valeria Pereira Serafim P, Figueiredo JR, de Adiel G, Vitor Felipe A, Guimaraes Lo Turco E, Silva, Manoukian Forones N (2019). "ESTUDIO DE BIOMARCADORES LÍPIDOS DE PACIENTES CON PÓLIPOS Y CÁNCER COLORRECTAL". Arquivos de Gastroenterología . 56 (4): 399–404. doi : 10.1590/S0004-2803.201900000-80 . PMID  31800736.
  3. ^ Zheng H, Yang R, Wang Z, Wang J, Zhang J, Sun H (2020). "Caracterización de triacilgliceroles estructurados farmacéuticos mediante cromatografía líquida de alto rendimiento/espectrometría de masas de alta resolución en tándem y su aplicación a la inyección de emulsiones de grasa estructurada". Comunicaciones rápidas en espectrometría de masas . 34 (1): e8557. doi :10.1002/rcm.8557. PMID  31429125.
  4. ^ Sasaki H, White SH (2008). "Comportamiento de agregación de un lipopolisacárido ultrapuro que estimula los receptores TLR-4". Revista biofísica . 95 (2): 986–993. Código Bibliográfico :2008BpJ....95..986S. doi :10.1529/biophysj.108.129197. PMC 2440428 . PMID  18375521. 
  5. ^ Muralikrishna Adibhatla R, Hatcher JF (2007). "El papel de los lípidos en las lesiones y enfermedades cerebrales". Future Lipidology . 2 (4): 403–422. doi :10.2217/17460875.2.4.403. PMC 2174836 . PMID  18176634. 
  6. ^ "Potencialmente bueno, la lipidómica está ganando peso". Eureka Alert . 10 de enero de 2019 . Consultado el 10 de junio de 2020 .
  7. ^ "Lipidomía: un campo de nicho pero en rápido crecimiento". Technology Networks . 11 de septiembre de 2019 . Consultado el 10 de junio de 2020 .
  8. ^ Sud M, Fahy E, Cotter D, et al. (enero de 2007). "LMSD: base de datos de estructura de LIPID MAPS". Nucleic Acids Res . 35 (número de la base de datos): D527–32. doi :10.1093/nar/gkl838. PMC 1669719 . PMID  17098933. 
  9. ^ Cotter D, Maer A, Guda C, Saunders B, Subramaniam S (enero de 2006). "LMPD: base de datos del proteoma LIPID MAPS". Nucleic Acids Res . 34 (90001): D507–10. doi :10.1093/nar/gkj122. PMC 1347484. PMID  16381922 . 
  10. ^ Fahy E, Alvarez-Jarreta J, Brasher CJ, Nguyen A, Hawksworth JI, Rodrigues P, Meckelmann S, Allen SM, O'Donnell VB (2019). "LipidFinder en LIPID MAPS: filtrado de picos, búsqueda de MS y análisis estadístico para lipidómica". Bioinformática . 35 (4): 685–687. doi :10.1093/bioinformatics/bty679. PMC 6378932 . PMID  30101336. 
  11. ^ Sud M, Fahy E, Cotter D, Dennis EA, Subramaniam S (diciembre de 2011). "LIPID MAPS-Nature Lipidomics Gateway: un recurso en línea para estudiantes y educadores interesados ​​en lípidos". Journal of Chemical Education . 89 (2): 291–292. doi :10.1021/ed200088u. PMC 3995124 . PMID  24764601. 
  12. ^ "Lista de servicios". elixir-europe.org . Consultado el 10 de junio de 2020 .
  13. ^ "El recurso de datos global LIPID MAPS recibió dos insignias internacionales de excelencia" . Consultado el 25 de julio de 2024 .
  14. ^ Conroy, Matthew J; Andrews, Robert M; Andrews, Simon; Cockayne, Lauren; Dennis, Edward A; Fahy, Eoin; Gaud, Caroline; Griffiths, William J; Jukes, Geoff; Kolchin, Maksim; Mendivelso, Karla; Lopez-Clavijo, Andrea F; Ready, Caroline; Subramaniam, Shankar; O'Donnell, Valerie B (19 de octubre de 2023). "MAPAS LIPÍDICOS: actualización de bases de datos y herramientas para la comunidad de lipidómica". Nucleic Acids Research . doi : 10.1093/nar/gkad896 . PMC 10767878 . 
  15. ^ Ferry, Georgina (24 de abril de 2020). «Obituario de Michael Wakelam». The Guardian . Manchester . Consultado el 10 de junio de 2020 .