La novena temporada de NYPD Blue se estrenó en ABC el 6 de noviembre de 2001 y concluyó el 21 de mayo de 2002.
El cuerpo de Danny Sorenson se encuentra en una tumba poco profunda. Sipowicz consigue un nuevo socio, el hijo de su antiguo enemigo. Juntos rastrean a los miembros de la mafia que mataron a Sorenson. Valerie queda embarazada de Baldwin, pero pierde al bebé y Baldwin tiene dudas sobre si fue un aborto espontáneo o un aborto.