GenMAPP (Gene Map Annotator and Pathway Profiler) es una herramienta de software bioinformático de código abierto y gratuita diseñada para visualizar y analizar datos genómicos en el contexto de vías ( metabólicas , de señalización ), conectando conjuntos de datos a nivel genético con procesos biológicos y enfermedades. [1] Creado por primera vez en 2000, GenMAPP es desarrollado por un equipo de código abierto con sede en un laboratorio de investigación académica. GenMAPP mantiene bases de datos de identificadores de genes y colecciones de mapas de rutas, además de herramientas de visualización y análisis. Junto con otros recursos públicos, GenMAPP tiene como objetivo proporcionar a la comunidad de investigación herramientas para obtener conocimientos sobre la biología mediante la integración de tipos de datos que van desde genes hasta proteínas y vías de transmisión de enfermedades.
GenMAPP se creó por primera vez en 2000 como un prototipo de herramienta de software en el laboratorio de Bruce Conklin en los Institutos J. David Gladstone en San Francisco y continúa desarrollándose en el mismo entorno de investigación académica sin fines de lucro. La primera versión de GenMAPP 1.0 estuvo disponible en 2002 y admitió el análisis de datos de microarrays de ADN de humanos , ratones , ratas y levaduras . En 2004, se lanzó GenMAPP 2.0, que combina los programas anteriormente accesorios MAPPFinder y MAPPBuilder, y amplía el soporte a especies adicionales. GenMAPP 2.1 se lanzó en 2006 con nuevas funciones de visualización y soporte para un total de once especies.
GenMAPP fue desarrollado por biólogos y se centra en la visualización de rutas para biólogos de laboratorio. A diferencia de muchas otras herramientas de biología de sistemas computacionales , GenMAPP no está diseñado para el modelado de células/sistemas; se centra en las necesidades inmediatas de los biólogos de laboratorio permitiéndoles interpretar rápidamente datos genómicos con una interfaz intuitiva y fácil de usar. GenMAPP se implementa en Visual Basic 6.0 y está disponible como una aplicación independiente para los sistemas operativos Microsoft Windows , incluidos Boot Camp o Parallels Workstation en una Mac.
GenMAPP crea y mantiene bases de datos de genes para una variedad de organismos modelo clave :
GenMAPP proporciona herramientas para crear, editar y anotar mapas de vías biológicas.
GenMAPP permite a los usuarios visualizar y analizar sus datos en el contexto de colecciones de vías y Gene Ontology .
.svg/1280px-Free_and_open-source_software_logo_(2009).svg.png){kind=logo}
