líder yybP-ykoY

elemento de ARN

El elemento de ARN líder yybP-ykoY se descubrió originalmente en E. coli durante un análisis a gran escala y se denominó SraF. ^[1] Más tarde se descubrió que esta familia existía aguas arriba de familias relacionadas de genes de proteínas en muchas bacterias, incluidos los genes yybP y ykoY en B. subtilis . Se desconocen las funciones específicas de estas proteínas, pero este elemento estructurado de ARN puede estar implicado en su regulación genética a modo de riboswitch . ^[2] Posteriormente se propuso que el elemento yybP-ykoY respondía al manganeso después de que se demostró que otra familia asociada de genes, YebN/MntP , codificaba bombas de eflujo de Mn ²⁺ en varias bacterias. ^{[3] [4] [5]} Los datos genéticos y una estructura cristalina confirmaron que yybp-ykoY es un riboswitch de manganeso que se une directamente a Mn ^{2+ [6] [7]}

Referencias

1. Argaman L, Hershberg R, Vogel J, Bejerano G, Wagner EG, Margalit H, Altuvia S (junio de 2001). "Nuevos genes pequeños que codifican ARN en las regiones intergénicas de Escherichia coli". Biología actual . 11 (12): 941–950. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00270-6 . PMID  11448770.
2. Barrick JE, Corbino KA, Winkler WC, Nahvi A, Mandal M, Collins J, Lee M, Roth A, Sudarsan N, Jona I, Wickiser JK, Breaker RR (abril de 2004). "Los nuevos motivos de ARN sugieren un alcance ampliado para los ribointerruptores en el control genético bacteriano". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 101 (17): 6421–6426. Código Bib : 2004PNAS..101.6421B. doi : 10.1073/pnas.0308014101 . PMC 404060 . PMID  15096624. 
3. Waters LS, Sandoval M, Storz G (noviembre de 2011). "El minirregulon de Escherichia coli MntR incluye genes que codifican una pequeña proteína y una bomba de eflujo necesaria para la homeostasis del manganeso". Revista de Bacteriología . 193 (21): 5887–5897. doi :10.1128/jb.05872-11. PMC 3194919 . PMID  21908668. 
4. Li C, Tao J, Mao D, He C (2011). "Se requiere un nuevo sistema de eflujo de manganeso, YebN, para la virulencia de Xanthomonas oryzae pv. Oryzae". MÁS UNO . 6 (7): e21983. Código Bib : 2011PLoSO...621983L. doi : 10.1371/journal.pone.0021983 . PMC 3136493 . PMID  21789199. 
5. Veyrier FJ, Boneca IG, Cellier MF, Taha MK (septiembre de 2011). "Un nuevo transportador de metal que media en la exportación de manganeso (MntX) regula la relación intracelular de Mn a Fe y la virulencia de Neisseria meningitidis". Más patógenos . 7 (9): e1002261. doi : 10.1371/journal.ppat.1002261 . PMC 3182930 . PMID  21980287. 
6. Price IR, Gaballa A, Ding F, Helmann JD, Ke A (marzo de 2015). "Mecanismos de detección de Mn (2+) de riboswitches huérfanos yybP-ykoY". Célula molecular . 57 (6): 1110-1123. doi :10.1016/j.molcel.2015.02.016. PMC 4703321 . PMID  25794619. 
7. Dambach M, Sandoval M, Updegrove TB, Anantharaman V, Aravind L, Waters LS, Storz G (marzo de 2015). "El omnipresente riboswitch yybP-ykoY es un elemento regulador que responde al manganeso". Célula molecular . 57 (6): 1099-1109. doi :10.1016/j.molcel.2015.01.035. PMC 4376352 . PMID  25794618. 

enlaces externos

• Página para el líder yybP-ykoY en Rfam