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Kiyoshi Nagai

Kiyoshi Nagai FRS (25 de junio de 1949 – 27 de septiembre de 2019) fue un biólogo estructural japonés del Laboratorio de Biología Molecular del MRC de Cambridge, Reino Unido. Era conocido por su trabajo sobre el mecanismo de empalme del ARN y las estructuras del espliceosoma .

Educación

Nagai estudió en la Universidad de Osaka y obtuvo un Doctorado en Filosofía bajo la supervisión de Hideki Morimoto trabajando en el efecto alostérico en la hemoglobina . [1]

Carrera e investigación

En 1981, Nagai se trasladó al Laboratorio de Biología Molecular del MRC , donde trabajó como posdoctorado con Max Perutz sobre la sobreproducción de proteínas eucariotas en E. coli . [1] Produjo hemoglobina recombinante y estudió sus propiedades y evolución mediante cristalografía y mutagénesis. [2] [3] En 1987 se convirtió en líder de grupo titular en el LMB y fue codirector de la División de Estudios Estructurales de 2000 a 2010. Fue nombrado miembro del Darwin College, Cambridge en 1993. [4]

En 1990 su grupo resolvió la primera estructura de una proteína RRM (motivo de reconocimiento de ARN), U1A , [5] y en 1994 mostró cómo se une específicamente al ARN. [6] El trabajo posterior incluyó estudios cristalográficos de otros componentes del espliceosoma , una gran máquina macromolecular que cataliza el empalme del ARN en eucariotas , incluidos los componentes del snRNP U2 [7] y las proteínas Sm [8] y que culminaron en las estructuras cristalinas del snRNP U1 completo [9] [10] y los componentes del snRNP U5 Prp8 [11] y Brr2. [12]

A partir de 2014, el grupo de Nagai utilizó la criomicroscopía electrónica para estudiar el espliceosoma. Las estructuras del tri-snRNP U5.U4/U6 proporcionaron los primeros conocimientos estructurales sobre el ensamblaje del espliceosoma. [13] [14] Las estructuras posteriores de Nagai de los espliceosomas en varias etapas de ensamblaje y catálisis [15] [16] combinadas con las estructuras de los grupos de Reinhard Lührmann, Yigong Shi y otros han proporcionado información crucial sobre el mecanismo catalítico del empalme del pre-ARNm.

Premios

Referencias

  1. ^ ab Galej, Wojciech P.; Toor, Navtej; Newman, Andrew J.; Nagai, Kiyoshi (25 de abril de 2018). "Mecanismo molecular y evolución del empalme de intrones del grupo II y pre-ARNm nuclear: perspectivas a partir de estructuras de criomicroscopía electrónica". Chemical Reviews . 118 (8): 4156–4176. doi :10.1021/acs.chemrev.7b00499. ISSN  1520-6890. PMID  29377672.
  2. ^ Nagai, K.; Thøgersen, HC (1984). "Generación de beta-globina mediante proteólisis específica de secuencia de una proteína híbrida producida en Escherichia coli". Nature . 309 (5971): 810–812. Bibcode :1984Natur.309..810N. doi :10.1038/309810a0. ISSN  0028-0836. PMID  6330564. S2CID  4307749.
  3. ^ Nagai, K.; Perutz, MF; Poyart, C. (1985). "Propiedades de unión al oxígeno de las hemoglobinas mutantes humanas sintetizadas en Escherichia coli". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 82 (21): 7252–7255. Bibcode :1985PNAS...82.7252N. doi : 10.1073/pnas.82.21.7252 . ISSN  0027-8424. PMC 390827 . PMID  3903751. 
  4. ^ "Master & fellows | www.darwin.cam.ac.uk". www.darwin.cam.ac.uk . Consultado el 9 de diciembre de 2018 .
  5. ^ Nagai, K.; Oubridge, C.; Jessen, TH; Li, J.; Evans, PR (6 de diciembre de 1990). "Estructura cristalina del dominio de unión al ARN de la ribonucleoproteína A nuclear pequeña U1". Nature . 348 (6301): 515–520. Bibcode :1990Natur.348..515N. doi :10.1038/348515a0. ISSN  0028-0836. PMID  2147232. S2CID  4336326.
  6. ^ Oubridge, C.; Ito, N.; Evans, PR; Teo, CH; Nagai, K. (1994-12-01). "Estructura cristalina a una resolución de 1,92 A del dominio de unión al ARN de la proteína espliceosómica U1A complejada con una horquilla de ARN". Nature . 372 (6505): 432–438. Bibcode :1994Natur.372..432O. doi :10.1038/372432a0. ISSN  0028-0836. PMID  7984237. S2CID  9404488.
  7. ^ Price, SR; Evans, PR; Nagai, K. (13 de agosto de 1998). "Estructura cristalina del complejo proteico espliceosómico U2B"-U2A' unido a un fragmento de ARN nuclear pequeño U2". Nature . 394 (6694): 645–650. Bibcode :1998Natur.394..645P. doi :10.1038/29234. ISSN  0028-0836. PMID  9716128. S2CID  204999419.
  8. ^ Kambach, C.; Walke, S.; Young, R.; Avis, JM; de la Fortelle, E.; Raker, VA; Lührmann, R.; Li, J.; Nagai, K. (5 de febrero de 1999). "Estructuras cristalinas de dos complejos proteicos Sm y sus implicaciones para el ensamblaje de los snRNP espliceosomales". Cell . 96 (3): 375–387. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80550-4 . ISSN  0092-8674. PMID  10025403. S2CID  17379935.
  9. ^ Pomeranz Krummel, Daniel A.; Oubridge, Chris; Leung, Adelaine KW; Li, Jade; Nagai, Kiyoshi (26 de marzo de 2009). "Estructura cristalina de la snRNP U1 espliceosómica humana a una resolución de 5,5 A". Nature . 458 (7237): 475–480. Bibcode :2009Natur.458..475P. doi :10.1038/nature07851. ISSN  1476-4687. PMC 2673513 . PMID  19325628. 
  10. ^ Kondo, Yasushi; Oubridge, Chris; van Roon, Anne-Marie M.; Nagai, Kiyoshi (2015-01-02). "La estructura cristalina de la snRNP U1 humana, una pequeña partícula de ribonucleoproteína nuclear, revela el mecanismo de reconocimiento del sitio de empalme 5'". eLife . 4 . doi : 10.7554/eLife.04986 . ISSN  2050-084X. PMC 4383343 . PMID  25555158. 
  11. ^ Galej, Wojciech P.; Oubridge, Chris; Newman, Andrew J.; Nagai, Kiyoshi (31 de enero de 2013). "La estructura cristalina de Prp8 revela la cavidad del sitio activo del espliceosoma". Nature . 493 (7434): 638–643. Bibcode :2013Natur.493..638G. doi :10.1038/nature11843. ISSN  1476-4687. PMC 3672837 . PMID  23354046. 
  12. ^ Nguyen, Thi Hoang Duong; Li, Jade; Galej, Wojciech P.; Oshikane, Hiroyuki; Newman, Andrew J.; Nagai, Kiyoshi (4 de junio de 2013). "Base estructural de las interacciones Brr2-Prp8 e implicaciones para la biogénesis de snRNP U5 y el sitio activo del espliceosoma". Estructura . 21 (6): 910–919. doi :10.1016/j.str.2013.04.017. ISSN  1878-4186. PMC 3677097 . PMID  23727230. 
  13. ^ Nguyen, Thi Hoang Duong; Galej, Wojciech P.; Bai, Xiao-chen; Savva, Christos G.; Newman, Andrew J.; Scheres, Sjors HW; Nagai, Kiyoshi (2 de julio de 2015). "La arquitectura del tri-snRNP spliceosomal U4 / U6.U5". Naturaleza . 523 (7558): 47–52. Código Bib :2015Natur.523...47N. doi : 10.1038/naturaleza14548. ISSN  1476-4687. PMC 4536768 . PMID  26106855. 
  14. ^ Nguyen, Thi Hoang Duong; Galej, Wojciech P.; Bai, Xiao-Chen; Oubridge, Chris; Newman, Andrew J.; Scheres, Sjors HW; Nagai, Kiyoshi (18 de febrero de 2016). "Estructura crio-EM del tri-snRNP U4/U6.U5 de levadura a una resolución de 3,7 Å". Nature . 530 (7590): 298–302. Bibcode :2016Natur.530..298N. doi :10.1038/nature16940. ISSN  1476-4687. PMC 4762201 . PMID  26829225. 
  15. ^ Fica, Sebastian M.; Nagai, Kiyoshi (5 de octubre de 2017). "Instantáneas del espliceosoma mediante criomicroscopía electrónica: perspectivas estructurales de una máquina dinámica de ribonucleoproteínas". Nature Structural & Molecular Biology . 24 (10): 791–799. doi :10.1038/nsmb.3463. ISSN  1545-9985. PMC 6386135 . PMID  28981077. 
  16. ^ Scheres, Sjors Hw; Nagai, Kiyoshi (2017). "Las estructuras crioelectrónicas de complejos espliceosomales revelan el mecanismo molecular del empalme del pre-ARNm". Current Opinion in Structural Biology . 46 : 130–139. doi :10.1016/j.sbi.2017.08.001. ISSN  1879-033X. PMID  28888105.
  17. ^ "Kiyoshi Nagai | Sociedad de la Realeza". royalsociety.org . Consultado el 9 de diciembre de 2018 .
  18. ^ Newman, Andy; Luisi, Ben (2022). "Kiyoshi Nagai. 25 de junio de 1949-27 de septiembre de 2019". Memorias biográficas de miembros de la Royal Society . 72 : 275–291. doi : 10.1098/rsbm.2021.0043 . S2CID  247453651.
  19. ^ "Encuentre personas en las comunidades EMBO". people.embo.org . Consultado el 9 de diciembre de 2018 .
  20. ^ Nagai, K.; Muto, Y.; Pomeranz Krummel, DA; Kambach, C.; Ignjatovic, T.; Walke, S.; Kuglstatter, A. (2001). "Estructura y ensamblaje de las snRNP espliceosomales. Conferencia de la Medalla Novartis". Biochemical Society Transactions . 29 (Pt 2): 15–26. doi :10.1042/bst0290015. ISSN  0300-5127. PMID  11356120.