Juan V de Anhalt-Zerbst ( Dessau , 4 de septiembre de 1504 - Zerbst , 4 de febrero de 1551) fue un príncipe alemán de la Casa de Ascania y gobernante del principado de Anhalt-Dessau . A partir de 1544 asumió el gobierno del re-creado principado de Anhalt-Zerbst .
Juan era el segundo hijo (pero el mayor sobreviviente) de Ernesto I, príncipe de Anhalt-Dessau , con su esposa Margarita , hija de Enrique I, duque de Münsterberg-Oels , y nieta de Jorge de Poděbrady , rey de Bohemia .
Tras la muerte de su padre en 1516, Juan y sus hermanos Jorge III y Joaquín I heredaron Anhalt-Dessau como cogobernantes según la ley de familia de la Casa de Ascania. Durante sus primeros años de gobierno, su madre Margarita ejerció de regente.
Los hermanos se repartieron el gobierno del principado durante casi veintiocho años, hasta que en 1544 decidieron repartirse sus territorios. Juan recibió Zerbst , reviviendo así el antiguo principado de Anhalt-Zerbst que se extinguió en 1396 con la creación de Anhalt-Dessau y Anhalt-Köthen.
El 15 de febrero de 1534, Juan se casó en Dessau con Margarita (n. 29 de septiembre de 1511 - f. después del 3 de diciembre de 1577), hija de Joaquín I Néstor, elector de Brandeburgo , y viuda de Jorge I, duque de Pomerania . El hijastro de Margarita, el nuevo duque de Pomerania, Felipe I , tuvo que pagarle una renta vitalicia de 1200 florines de su tesoro personal para cubrir el coste de su dote.
De su matrimonio con Jorge I, Margarita tuvo una hija póstuma, Georgia, que siguió a su madre a Anhalt; sin embargo, se decidió que cuando cumpliera ocho años (en 1539) debía ser devuelta a Pomerania bajo la custodia de su medio hermano Felipe I. A pesar de esto, Margarita pudo mantener a su hija con ella hasta mayo de 1543, cuando finalmente fue enviada a su tierra natal.
La unión con la hija viuda del elector de Brandeburgo fue un gran honor para Juan, que decidió celebrar la boda con gran pompa. Pero en ese momento su salud era delicada y, finalmente, en 1544, sufrió un derrame cerebral. Sus relaciones con Margarita empeoraron durante los años siguientes y, en 1550, Juan ordenó el arresto temporal de su esposa, pero ella huyó.
John y Margarete tuvieron seis hijos: