John Lewis Thomas Jr. (20 de mayo de 1835 - 15 de octubre de 1893) fue un político estadounidense.
Nacido en Baltimore, Maryland , Thomas estudió derecho y fue admitido en el colegio de abogados en 1856, comenzando a ejercer poco después en Cumberland, Maryland . También se desempeñó como consejero municipal de Cumberland en 1856 y 1857. Se mudó a Baltimore en 1857, continuó ejerciendo la abogacía y también se desempeñó como procurador municipal de Baltimore de 1860 a 1862. Fue delegado de la convención constitucional estatal de 1863 y fiscal estatal de 1863 a 1865.
En 1865, Thomas fue elegido como unionista incondicional para el 39.° Congreso para llenar la vacante causada por la renuncia de Edwin H. Webster y sirvió desde el 4 de diciembre de 1865 hasta el 3 de marzo de 1867. Fue candidato republicano sin éxito para la reelección en 1866 para el 40.° Congreso. Después del Congreso, sirvió como recaudador del puerto de Baltimore desde 1869 hasta 1873 y nuevamente desde 1877 hasta 1882. Murió en Baltimore y está enterrado en el cementerio de Greenmount .