Joaquín Ernesto de Anhalt (21 de octubre de 1536 - 6 de diciembre de 1586) fue un príncipe alemán de la Casa de Ascania , gobernante del principado de Anhalt-Zerbst desde 1551 y desde 1570 gobernante único de todas las tierras de Anhalt .
Joaquín Ernesto nació en Dessau el 21 de octubre de 1536 como segundo hijo del príncipe Juan V de Anhalt-Zerbst y de su esposa Margarita , hija del elector Joaquín I Néstor de Brandeburgo . Recibió una educación exhaustiva bajo la supervisión de su padre. El 1 de febrero de 1549, con tan solo trece años de edad, fue admitido oficialmente en la Universidad de Wittenberg , donde, entre otros, estudió con el teólogo Georg Helt.
En 1550, tras la muerte de su padre, heredó Anhalt-Zerbst junto con su hermano mayor Carlos I y su hermano menor Bernardo VII .
La muerte de su tío Jorge III sin herederos varones le permitió a él y a sus hermanos, Carlos I y Bernardo VII, heredar Anhalt-Plötzkau en 1553, mientras que la muerte de su tío Joaquín I le permitió a él y a su hermano superviviente Bernardo VII heredar Anhalt-Dessau en 1561. En 1562 su primo Wolfgang abdicó Anhalt-Köthen en su favor.
El 3 de marzo de 1560, Joaquín Ernesto se casó en Barby con Inés de Barby-Mühlingen (n. Barby, 23 de junio de 1540 - m. Bernburg , 27 de noviembre de 1569), hija de Wolfgang I, conde de Barby-Mühlingen (1502-1564) y su esposa, la condesa Inés de Mansfeld (1511-1558). Tuvieron seis hijos.
El 9 de enero de 1571, en Stuttgart, Joaquín Ernesto se casó por segunda vez con Leonor (n. Tubinga , 22 de marzo de 1552 - m. Schloss Lichtenberg , 12 de enero de 1618), hija del duque Cristóbal de Wurtemberg y su esposa, la princesa Ana María de Brandeburgo-Ansbach . Tuvieron diez hijos.
En 1570, la muerte de su último hermano superviviente, Bernardo VII, lo dejó como único gobernante de todos los estados de Anhalt, que finalmente se unificaron por primera vez desde su primera partición en 1252. Joachim Ernest hizo de Dessau la sede de su gobierno.
Joaquín Ernesto fue un típico monarca renacentista que apoyó generosamente las artes y la cultura. Envió a sus hijos con sus tutores en viajes educativos por toda Europa. Además, encargó al hijo de su canciller, Tobias Hübner, que creara una descripción de los famosos juegos de caballeros (en alemán: Ritterspiele ) que tenían lugar en la corte de Dessau.
En 1572 creó el Código Jurídico Regional de Anhalt (en alemán: Landesverordnung Anhalts ) y en 1582 fundó el Instituto Francisceum (en alemán: Gymnasium Francisceum ) en Zerbst . Fue un ferviente partidario de la Reforma y de los hugonotes .
El príncipe Joaquín Ernesto murió en Dessau el 6 de diciembre de 1586. Dado que la sucesión en los territorios de Anhalt no estaba regida por las reglas de primogenitura , los siete hijos de Joaquín Ernesto compartieron el gobierno de los territorios de Anhalt hasta 1603, cuando los cinco hijos supervivientes se dividieron sus tierras entre ellos.