El dos veces campeón defensor Novak Djokovic derrotó a Milos Raonic en la final, 6-2, 6-0 para ganar el título de tenis individual masculino en el Masters de Indian Wells 2016. Fue su quinto título en Indian Wells , que entonces batía un récord, antes de que Roger Federer empatara el récord al año siguiente .
Todos los cabezas de serie reciben un pase a la segunda ronda.
Novak Djokovic (campeón)
Andy Murray (tercera ronda).svg/1280px-Flag_of_Switzerland_(Pantone).svg.png){kind=small}
Stan Wawrinka (cuarta ronda)
Rafael Nadal (semifinales)
Kei Nishikori (cuartos de final)
Tomáš Berdych (cuarta ronda)
Jo-Wilfried Tsonga (cuartos de final) Richard Gasquet (cuarta ronda)
John Isner (cuarta ronda)
Marin Čilić (cuartos de final)
Dominic Thiem (cuarta ronda).svg/1280px-Flag_of_Canada_(Pantone).svg.png){kind=small}
Milos Raonic (final) Gaël Monfils (cuartos de final) Roberto Bautista Agut (tercera ronda).svg/1280px-Flag_of_Belgium_(civil).svg.png){kind=small}
David Goffin (semifinales) Gilles Simon (tercera ronda).svg/1280px-Flag_of_Australia_(converted).svg.png){kind=small}
Bernard Tomic (tercera ronda, retirado) Feliciano López (cuarta ronda) Benoît Paire (segunda ronda) Viktor Troicki (segunda ronda) Jack Sock (tercera ronda)
Pablo Cuevas (segunda vuelta)
Grigor Dimitrov (segunda vuelta) Nick Kyrgios (segunda ronda)
Martin Kližan (segunda ronda, retirado)
Alexandr Dolgopolov (tercera ronda)
Philipp Kohlschreiber (tercera ronda) Jérémy Chardy (segunda ronda)
Thomaz Bellucci (segunda ronda) Steve Johnson (tercera ronda) Sam Querrey (tercera ronda)
João Sousa (segunda ronda)Haga clic en el número de semilla de un jugador para ir a su sección de sorteo.
Yūichi Sugita (competencia clasificatoria) Austin Krajicek (competición clasificatoria) Pierre-Hugues Herbert (calificado) Michael Berrer (calificado) Tim Smyczek (clasificado) John-Patrick Smith (primera ronda) Go Soeda (primera ronda) Daniel Brands (primera ronda) Édouard Roger-Vasselin (competición de clasificación)
Alejandro González (primera ronda) Bjorn Fratangelo (clasificado) Dennis Novikov (competición de clasificación)
Andrey Rublev (competición de clasificación) Mischa Zverev (competición de clasificación) Radek Štěpánek (competición de clasificación) Vicente Millot (clasificado)
Renzo Olivo (clasificado) Ryan Harrison (calificado) Alejandro Sarkissian (clasificado) Jozef Kovalík (clasificado) Marco Trungelliti (calificado)
James McGee (primera ronda) Noah Rubin (clasificado) Tommy Paul (competencia clasificatoria)