El sitio de entrada interna al ribosoma del virus de la hepatitis C , o IRES del VHC , es una estructura de ARN dentro del 5'UTR del genoma del VHC que media la iniciación de la traducción independiente del capuchón.
La traducción de proteínas de la mayoría de los ARNm eucariotas se produce por un mecanismo dependiente de la tapa y requiere la asociación de Met - ARNt i Met , varios factores de iniciación eucariotas y GTP con la subunidad ribosómica 40S, el reclutamiento a la tapa 5' y el escaneo a lo largo del UTR 5' para alcanzar el codón de inicio. Por el contrario, la traducción del ARNm del virus de la hepatitis C (VHC) se inicia mediante un mecanismo diferente del modelo habitual de unión a la tapa 5'. [1] Este mecanismo alternativo se basa en la unión directa de la subunidad ribosómica 40S por el sitio de entrada interna al ribosoma (IRES) en el UTR 5' del ARN del VHC. El IRES del VHC adopta una estructura compleja y puede diferir significativamente de los elementos IRES identificados en los picornavirus . Se ha demostrado que una pequeña cantidad de ARNm eucariotas se traducen por entrada interna al ribosoma. [2] [3]
Se cree que los nucleótidos 1 a 40 del ARNm del VHC no contribuyen a la traducción, sino que son necesarios para la replicación del ARN genómico . El resto del 5'-UTR del VHC consta de tres dominios, a saber, los dominios II a IV (el dominio I se encuentra en el extremo 5' del ARNm). [ cita requerida ]
El IRES del VHC se une de forma independiente a dos componentes de la maquinaria de iniciación de la traducción eucariota, el factor de iniciación multiproteico eIF3 y la subunidad ribosomal pequeña 40S . Además, se une a 40S de tal manera que el codón iniciador AUG se coloca en el sitio P ribosomal, por lo que no se requiere escaneo ribosomal. En consecuencia, los factores de escaneo eIF1 y eIF1A son prescindibles para la traducción del VHC, al igual que los componentes del complejo eIF4F ( eIF4A , eIF4E y eIF4G ) y eIF4B , que generalmente se requieren para la unión del ARNm y el desenrollado de 5'UTR . El ARNt iniciador es administrado por eIF2 o, en condiciones de estrés cuando eIF2 está inactivado, por eIF2A , eIF2D o posiblemente eIF5B , un homólogo de la proteína IF2 procariota . [ cita requerida ]