La temporada 2012-13 de los Houston Rockets fue la 46.ª temporada de la franquicia en la Asociación Nacional de Baloncesto (NBA) y la 42.ª con sede en Houston .
La temporada es más recordada por haber adquirido al All-Star y Sexto Hombre del Año James Harden de Oklahoma City Thunder en un canje. Junto con Harden, el equipo incorporó al base Jeremy Lin después de una temporada mágica con los New York Knicks el año anterior y al pívot Omer Asik .
A pesar de una temporada estelar de los nuevos capitanes del equipo Harden y Lin, los Rockets solo lograron jugar un baloncesto mediocre durante toda la temporada, terminando con un récord de 45-37, asegurando el puesto número 8 en el Oeste. La temporada de los Rockets terminó con una derrota en la primera ronda ante el ex equipo de Harden, el Oklahoma City Thunder , en seis juegos. Como Houston fue sede del Juego de las Estrellas de la NBA de 2013 , Harden fue el único representante.