La glicerol-3-fosfato deshidrogenasa ( GPDH ) es una enzima que cataliza la conversión redox reversible de fosfato de dihidroxiacetona (también conocido como fosfato de glicerina, obsoleto) a sn- glicerol 3-fosfato . [2]
Los términos más antiguos para la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa incluyen alfa-glicerol-3-fosfato deshidrogenasa (alfaGPDH) y glicerol-fosfato deshidrogenasa (GPDH). Sin embargo, la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa no es lo mismo que la gliceraldehído-3-fosfato deshidrogenasa (GAPDH), cuyo sustrato es un aldehído , no un alcohol .
La pareja de coenzimas NAD+ / NADH actúa como un reservorio de electrones para las reacciones redox metabólicas , transportando electrones de una reacción a otra. [5] La mayoría de estas reacciones metabólicas ocurren en las mitocondrias . Para regenerar el NAD+ para su uso posterior, los depósitos de NADH en el citosol deben reoxidarse. Dado que la membrana interna mitocondrial es impermeable tanto al NADH como al NAD+ , estos no pueden intercambiarse libremente entre el citosol y la matriz mitocondrial . [4]
Una forma de transportar este equivalente reductor a través de la membrana es a través de la lanzadera de glicerol-3-fosfato , que emplea las dos formas de GPDH:
Como resultado, el NAD+ se regenera para una mayor actividad metabólica.
GPD1 consta de dos subunidades, [9] y reacciona con fosfato de dihidroxiacetona y NAD+ a través de la siguiente interacción:
Figura 4. El supuesto sitio activo. El grupo fosfato de la DHAP está rodeado por la mitad por la cadena lateral de Arg269 e interactúa con Arg269 y Gly268 directamente mediante enlaces de hidrógeno (no se muestra). Los residuos conservados Lys204, Asn205, Asp260 y Thr264 forman una red estable de enlaces de hidrógeno. La otra red de enlaces de hidrógeno incluye los residuos Lys120 y Asp260, así como una molécula de agua ordenada (con un factor B de 16,4 Å2), que se une mediante enlaces de hidrógeno a Gly149 y Asn151 (no se muestra). En estas dos redes electrostáticas, solo el grupo ε-NH 3 + de Lys204 es el más cercano al átomo C2 de la DHAP (3,4 Å). [1]
Los estudios indican que GPDH en su mayor parte no se ve afectado por los cambios de pH : ni GPD1 ni GPD2 se ven favorecidos en ciertas condiciones de pH .
En altas concentraciones de sal (por ejemplo, NaCl ), la actividad de GPD1 aumenta con respecto a GPD2, ya que un aumento en la salinidad del medio conduce a una acumulación de glicerol en respuesta.
Los cambios de temperatura no parecen favorecer ni a GPD1 ni a GPD2. [11]
Lanzadera de glicerol-3-fosfato
La enzima citosólica y la mitocondrial glicerol-3-fosfato deshidrogenasa trabajan en conjunto. La oxidación del NADH citoplasmático por la forma citosólica de la enzima crea glicerol-3-fosfato a partir de fosfato de dihidroxiacetona. Una vez que el glicerol-3-fosfato ha atravesado la membrana mitocondrial externa, puede ser oxidado por una isoforma separada de la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa que utiliza quinona como oxidante y FAD como cofactor. Como resultado, hay una pérdida neta de energía, comparable a una molécula de ATP. [7]
La acción combinada de estas enzimas mantiene la relación NAD+ / NADH que permite el funcionamiento continuo del metabolismo.
Papel en la enfermedad
El papel fundamental del GPDH en el mantenimiento del potencial NAD+ / NADH , así como su papel en el metabolismo lipídico , hace del GPDH un factor en enfermedades de desequilibrio lipídico, como la obesidad .
La actividad aumentada de GPDH, particularmente GPD2, conduce a un aumento en la producción de glicerol . Dado que el glicerol es una subunidad principal en el metabolismo lipídico , su abundancia puede conducir fácilmente a un aumento en la acumulación de triglicéridos a nivel celular. Como resultado, existe una tendencia a formar tejido adiposo que conduce a una acumulación de grasa que favorece la obesidad . [12]
Se cree que la isoforma mitocondrial de la G3P deshidrogenasa es inhibida por la metformina , un fármaco de primera línea para la diabetes tipo 2. [14]
Investigación biológica
Se utilizó Sarcophaga barbata para estudiar la oxidación del L-3-glicerofosfato en las mitocondrias. Se descubrió que el L-3-glicerofosfato no ingresa a la matriz mitocondrial, a diferencia del piruvato. Esto ayuda a localizar la L-3-glicerofosfato-flavoproteína oxidorreductasa, que se encuentra en la membrana interna de las mitocondrias.
Estructura
La glicerol-3-fosfato deshidrogenasa consta de dos dominios proteicos . El dominio N-terminal es un dominio de unión de NAD y el C-terminal actúa como un dominio de unión al sustrato. [15] Sin embargo, los residuos de la interfaz dímeros y tetrámeros están involucrados en la unión de GAPDH-ARN, ya que GAPDH puede exhibir varias actividades de iluminación lateral, incluida la modulación de la unión y/o estabilidad del ARN. [16]
^ ab PDB : 1X0V ; Ou X, Ji C, Han X, Zhao X, Li X, Mao Y, Wong LL, Bartlam M, Rao Z (marzo de 2006). "Estructuras cristalinas de la glicerol 3-fosfato deshidrogenasa 1 humana (GPD1)". Revista de biología molecular . 357 (3): 858–69. doi :10.1016/j.jmb.2005.12.074. PMID 16460752.
^ Ou X, Ji C, Han X, Zhao X, Li X, Mao Y, Wong LL, Bartlam M, Rao Z (marzo de 2006). "Estructuras cristalinas de la glicerol 3-fosfato deshidrogenasa 1 humana (GPD1)". Revista de biología molecular . 357 (3): 858–69. doi :10.1016/j.jmb.2005.12.074. PMID 16460752.
^ ab Harding JW, Pyeritz EA, Copeland ES, White HB (enero de 1975). "Función de la glicerol 3-fosfato deshidrogenasa en el metabolismo de los glicéridos. Efecto de la dieta en las actividades enzimáticas en el hígado de pollo". The Biochemical Journal . 146 (1): 223–9. doi :10.1042/bj1460223. PMC 1165291 . PMID 167714.
^ ab Geertman JM, van Maris AJ, van Dijken JP, Pronk JT (noviembre de 2006). "Ingeniería fisiológica y genética del metabolismo redox citosólico en Saccharomyces cerevisiae para mejorar la producción de glicerol". Ingeniería metabólica . 8 (6): 532–42. doi :10.1016/j.ymben.2006.06.004. PMID 16891140.
^ Ansell R, Granath K, Hohmann S, Thevelein JM, Adler L (mayo de 1997). "Las dos isoenzimas de la glicerol 3-fosfato deshidrogenasa dependiente de NAD+ de levadura codificadas por GPD1 y GPD2 tienen funciones distintas en la osmoadaptación y la regulación redox". The EMBO Journal . 16 (9): 2179–87. doi :10.1093/emboj/16.9.2179. PMC 1169820 . PMID 9171333.
^ Kota V, Rai P, Weitzel JM, Middendorff R, Bhande SS, Shivaji S (septiembre de 2010). "Papel de la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa 2 en la capacitación de los espermatozoides de ratón". Reproducción molecular y desarrollo . 77 (9): 773–83. doi :10.1002/mrd.21218. PMID 20602492. S2CID 19691537.
^ ab Stryer, Lubert; Berg, Jeremy Mark; Tymoczko, John L. (2002). "Capítulo 18.5: Lanzadera de glicerol 3-fosfato". Bioquímica . San Francisco: WH Freeman. ISBN0-7167-4684-0.
^ Guindalini C, Lee KS, Andersen ML, Santos-Silva R, Bittencourt LR, Tufik S (enero de 2010). "La influencia de la apnea obstructiva del sueño en la expresión del gen de la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa 1". Experimental Biology and Medicine . 235 (1): 52–6. doi :10.1258/ebm.2009.009150. PMID 20404019. S2CID 207194967. Archivado desde el original el 24 de julio de 2011. Consultado el 16 de mayo de 2011 .
^ Bunoust O, Devin A, Avéret N, Camougrand N, Rigoulet M (febrero de 2005). "Competencia de electrones para entrar en la cadena respiratoria: un nuevo mecanismo regulador del metabolismo oxidativo en Saccharomyces cerevisiae". The Journal of Biological Chemistry . 280 (5): 3407–13. doi : 10.1074/jbc.M407746200 . PMID 15557339.
^ Kota V, Dhople VM, Shivaji S (abril de 2009). "Fosfoproteoma de tirosina de los espermatozoides de hámster: papel de la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa 2 en la capacitación de los espermatozoides". Proteómica . 9 (7): 1809–26. doi :10.1002/pmic.200800519. PMID 19333995. S2CID 9248320.
^ Kumar S, Kalyanasundaram GT, Gummadi SN (febrero de 2011). "Respuesta diferencial de la catalasa, la superóxido dismutasa y la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa a diferentes tipos de estrés ambiental en Debaryomyces nepalensis NCYC 3413". Current Microbiology . 62 (2): 382–7. doi :10.1007/s00284-010-9717-z. PMID 20644932. S2CID 41613712.
^ Xu SP, Mao XY, Ren FZ, Che HL (febrero de 2011). "Efecto atenuante del glicomacropéptido de caseína sobre la proliferación, diferenciación y acumulación de lípidos de preadipocitos de rata Sprague-Dawley in vitro". Journal of Dairy Science . 94 (2): 676–83. doi : 10.3168/jds.2010-3827 . PMID 21257036.
^ Van Norstrand DW, Valdivia CR, Tester DJ, Ueda K, London B, Makielski JC, Ackerman MJ (noviembre de 2007). "Caracterización molecular y funcional de nuevas mutaciones del gen similar a la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa 1 (GPD1-L) en el síndrome de muerte súbita del lactante". Circulation . 116 (20): 2253–9. doi :10.1161/CIRCULATIONAHA.107.704627. PMC 3332545 . PMID 17967976.
^ Ferrannini E (octubre de 2014). "El objetivo de la metformina en la diabetes tipo 2". The New England Journal of Medicine . 371 (16): 1547–8. doi :10.1056/NEJMcibr1409796. PMID 25317875.
^ Suresh S, Turley S, Opperdoes FR, Michels PA, Hol WG (mayo de 2000). "Una enzima diana potencial para fármacos tripanocidas revelada por la estructura cristalina de la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa dependiente de NAD de Leishmania mexicana". Structure . 8 (5): 541–52. doi : 10.1016/s0969-2126(00)00135-0 . PMID 10801498.
^ White MR, Khan MM, Deredge D, Ross CR, Quintyn R, Zucconi BE, Wysocki VH, Wintrode PL, Wilson GM, Garcin ED (enero de 2015). "Una mutación de la interfaz del dímero en la gliceraldehído-3-fosfato deshidrogenasa regula su unión al ARN rico en AU". The Journal of Biological Chemistry . 290 (3): 1770–85. doi : 10.1074/jbc.M114.618165 . PMC 4340419 . PMID 25451934.
Lectura adicional
Baranowski T (1963). "α-Glicerofosfato deshidrogenasa". En Boyer PD, Lardy H, Myrbäck K (eds.). The Enzymes (2.ª ed.). Nueva York: Academic Press. págs. 85–96.
Brosemer RW, Kuhn RW (mayo de 1969). "Propiedades estructurales comparativas de las alfa-glicerofosfato deshidrogenasas de abejas y conejos". Bioquímica . 8 (5): 2095–105. doi :10.1021/bi00833a047. PMID 4307630.
O'Brien SJ, MacIntyre RJ (octubre de 1972). "El ciclo del β-glicerofosfato en Drosophila melanogaster. I. Aspectos bioquímicos y de desarrollo". Genética bioquímica . 7 (2): 141–61. doi :10.1007/BF00486085. PMID 4340553. S2CID 22009695.
Warkentin DL, Fondy TP (julio de 1973). "Aislamiento y caracterización de la L-glicerol-3-fosfato deshidrogenasa citoplasmática del tejido adiposo renal de conejo y su comparación con la enzima del músculo esquelético". Revista Europea de Bioquímica . 36 (1): 97–109. doi : 10.1111/j.1432-1033.1973.tb02889.x . PMID 4200180.
Albertyn J, van Tonder A, Prior BA (agosto de 1992). "Purificación y caracterización de la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa de Saccharomyces cerevisiae". FEBS Letters . 308 (2): 130–2. doi : 10.1016/0014-5793(92)81259-O . PMID 1499720. S2CID 39643279.
Koekemoer TC, Litthauer D, Oelofsen W (junio de 1995). "Aislamiento y caracterización de la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa del tejido adiposo". Revista internacional de bioquímica y biología celular . 27 (6): 625–32. doi :10.1016/1357-2725(95)00012-E. PMID 7671141.
Påhlman IL, Larsson C, Averét N, Bunoust O, Boubekeur S, Gustafsson L, Rigoulet M (agosto de 2002). "Regulación cinética de la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa mitocondrial por la NADH deshidrogenasa externa en Saccharomyces cerevisiae". Revista de química biológica . 277 (31): 27991–5. doi : 10.1074/jbc.M204079200 . PMID 12032156.
Overkamp KM, Bakker BM, Kötter P, van Tuijl A, de Vries S, van Dijken JP, Pronk JT (mayo de 2000). "Análisis in vivo de los mecanismos de oxidación del NADH citosólico por las mitocondrias de Saccharomyces cerevisiae". Revista de Bacteriología . 182 (10): 2823–30. CiteSeerX 10.1.1.335.5313 . doi :10.1128/JB.182.10.2823-2830.2000. PMC 101991 . PMID 10781551.
Dawson AG, Cooney GJ (julio de 1978). "Reconstrucción de la lanzadera de fosfato de alfa-glicerol utilizando mitocondrias de riñón de rata". FEBS Letters . 91 (2): 169–72. doi : 10.1016/0014-5793(78)81164-8 . PMID 210038.
Opperdoes FR, Borst P, Bakker S, Leene W (junio de 1977). "Localización de la glicerol-3-fosfato oxidasa en la mitocondria y de la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa ligada a NAD+ en partículas en los microcuerpos del torrente sanguíneo de Trypanosoma brucei". Revista Europea de Bioquímica . 76 (1): 29–39. doi : 10.1111/j.1432-1033.1977.tb11567.x . PMID 142010.
Eswaramoorthy S, Bonanno JB, Burley SK, Swaminathan S (junio de 2006). "Mecanismo de acción de una monooxigenasa que contiene flavina". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 103 (26): 9832–7. Bibcode :2006PNAS..103.9832E. doi : 10.1073/pnas.0602398103 . PMC 1502539 . PMID 16777962.