VIRAR

TACK es un grupo de arqueas , su nombre es un acrónimo de Thaumarchaeota (ahora Nitrososphaerota ), Aigarchaeota , Crenarchaeota (ahora Thermoproteota ) y Korarchaeota , los primeros grupos descubiertos. Se encuentran en diferentes ambientes que van desde termófilos acidófilos hasta mesófilos y psicrófilos y con diferentes tipos de metabolismo , predominantemente anaeróbico y quimiosintético. ^[4] TACK es un clado hermano de la rama Asgard que dio origen a los eucariotas . Se ha propuesto que el clado TACK se clasifique como Crenarchaeota y que el tradicional "Crenarchaeota" (Thermoproteota) se clasifique como una clase llamada "Sulfolobia", junto con los otros filos con rango u orden de clase. ^[5] Después de incluir la categoría de reino en la ICNP , el nombre propuesto para este grupo es reino Thermoproteati (Guy y Ettema 2024). ^[6]

Clasificación

Thermoproteota (antes Crenarchaeota). Es la arquea más conocida y la más abundante en el ecosistema marino. Anteriormente se les llamaba sulfobacterias por su dependencia del azufre y son importantes como fijadoras de carbono. Existen hipertermófilas en fuentes hidrotermales y otros grupos son los más abundantes a profundidades inferiores a los 100 m.
" Aigarchaeota ". Es un filo propuesto a partir del genoma de la especie candidata Caldiarchaeum subterraneum hallado en las profundidades de una mina de oro en Japón . También se han encontrado secuencias genómicas de este grupo en ambientes geotermales, tanto terrestres como marinos.
" Geoarchaeota ". Incluye organismos termófilos que viven en ambientes ácidos que reducen el hierro férrico. Alternativamente, se ha propuesto que este grupo y otros anteriores pertenecen en realidad al filo Nitrososphaerota.
Nitrososphaerota (antes Thaumarchaeota). Incluye organismos mesófilos o psicrófilos (temperaturas medias y bajas), de metabolismo quimiolitoautotrófico amoniaco-oxidante (nitrificantes) y que pueden jugar un papel importante en ciclos bioquímicos, como el del nitrógeno y el del carbono.
" Bathyarchaeota ". Abundante en los sedimentos del fondo marino con escasez de nutrientes. Al menos algunos linajes se desarrollan mediante homoacetogénesis, un tipo de metabolismo que hasta ahora se creía exclusivo de las bacterias.
" Korarchaeota ". Se han encontrado únicamente en ambientes hidrotermales y en baja abundancia. Parecen diversificados en diferentes niveles filogenéticos según la temperatura, la salinidad (agua dulce o marina) y la geografía.

Filogenia

Las relaciones son aproximadamente las siguientes:

Hipótesis del eocito

La hipótesis del eocitos propuesta en la década de 1980 por James Lake sugiere que los eucariotas surgieron dentro de los eocitos procariotas . ^[15]

Una evidencia que apoya una relación estrecha entre TACK y eucariotas es la presencia de un homólogo de la subunidad Rbp-8 de la ARN polimerasa en Thermoproteota pero no en Euryarchaea. ^[16]

Véase también

Lista de géneros de Archaea

Referencias

^ Castelle, CJ; Banfield, JF (2018). "Nuevos grupos microbianos importantes amplían la diversidad y alteran nuestra comprensión del árbol de la vida". Cell . 172 (6): 1181–1197. doi : 10.1016/j.cell.2018.02.016 . PMID 29522741.
^ Lake, JA; Henderson, E.; Oakes, M. (Clark, MW) (1984). "Eocitos: una nueva estructura de ribosoma indica un reino con una relación cercana con los eucariotas". PNAS . 81 (12): 3786–3790. Bibcode :1984PNAS...81.3786L. doi : 10.1073/pnas.81.12.3786 . PMC 345305 . PMID 6587394. {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
^ Lake, JA (2015). "Orígenes eucariotas". Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci . 370 (1678): 20140321. doi :10.1098/rstb.2014.0321. PMC 4571561 . PMID 26323753.
^ Guy, Lionel; Ettema, Thijs JG (2011). "El superfilo arqueológico 'TACK' y el origen de los eucariotas". Tendencias en microbiología . 19 (12): 580–587. doi :10.1016/j.tim.2011.09.002. PMID 22018741.
^ Cavalier-Smith, Thomas ; Chao, Ema E-Yung (2020). "Árboles proteicos ribosomales multidominio y el origen planctobacteriano de neomura (eucariotas, arqueobacterias)". Protoplasma . 257 (3): 621–753. doi :10.1007/s00709-019-01442-7. PMC 7203096 . PMID 31900730.
^ Göker, Markus; Oren, Aharon (22 de enero de 2024). "Publicación válida de nombres de dos dominios y siete reinos de procariotas". Revista internacional de microbiología sistemática y evolutiva . 74 (1). doi :10.1099/ijsem.0.006242. ISSN 1466-5026. PMID 38252124.
^ McKay, LJ, Dlakić, M., Fields, MW et al. Capacidad genómica concurrente para el metabolismo anaeróbico del metano y del azufre disimilatorio descubierto en Korarchaeota. Nat Microbiol 4, 614–622 (2019) doi:10.1038/s41564-019-0362-4
^ "El LTP". Proyecto de árboles vivos de todas las especies . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
^ "LTP_all tree in newick format" (Árbol LTP_all en formato newick). The All-Species Living Tree Project (Proyecto de árboles vivos de todas las especies ). Consultado el 10 de mayo de 2023 .
^ "Notas de la versión LTP_06_2022" (PDF) . The All-Species Living Tree Project . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
^ "GTDB release 08-RS214". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
^ "ar53_r214.sp_label". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
^ "Historia del taxón". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
^ Cox, CJ; Foster, PG; Hirt, RP; Harris, SR; Embley, TM (2008). "El origen arqueobacteriano de los eucariotas". Proc Natl Acad Sci USA . 105 (51): 20356–61. Bibcode :2008PNAS..10520356C. doi : 10.1073/pnas.0810647105 . PMC 2629343 . PMID 19073919.
^ (UCLA) El origen del núcleo y el árbol de la vida Archivado el 7 de febrero de 2003 en archive.today
^ Kwapisz, M.; Beckouët, F.; Thuriaux, P. (2008). "Evolución temprana de las ARN polimerasas dependientes de ADN eucariotas". Trends Genet . 24 (5): 211–5. doi :10.1016/j.tig.2008.02.002. PMID 18384908.