Ómnibus de expresión genética

Gene Expression Omnibus ( GEO ) es una base de datos para perfiles de expresión genética y perfiles de metilación de ARN gestionados por el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). ^[1] Estos datos genómicos de detección de alto rendimiento se derivan de datos experimentales de microarrays o RNA-Seq . ^[2] Estos datos deben ajustarse a la información mínima sobre el formato de un experimento de microarrays (MIAME). ^[3]

Glosario

Referencias

1. Edgar, R; Domrachev, M; Lash, AE (1 de enero de 2002). "Gene Expression Omnibus: repositorio de datos de matriz de hibridación y expresión genética de NCBI". Investigación de ácidos nucleicos . 30 (1): 207–10. doi : 10.1093/nar/30.1.207 . PMC  99122 . PMID  11752295.
2. Barrett, T; Wilhite, SE; Ledoux, P; Evangelista, C; Kim, SI; Tomashevsky, M; Marshall, KA; Phillippy, KH; Sherman, primer ministro; Holko, M; Yefanov, A; Lee, H; Zhang, N; Robertson, CL; Serova, N; Davis, S; Soboleva, A (enero de 2013). "NCBI GEO: archivo de conjuntos de datos de genómica funcional - actualización". Investigación de ácidos nucleicos . 41 (Problema de base de datos): D991-5. doi : 10.1093/nar/gks1193 . PMC 3531084 . PMID  23193258. 
3. Brazma, A; Hingamp, P; Quackenbush, J; Sherlock, G; Spellman, P; Stoeckert, C; Aach, J; Ansorge, W; Bola, California; Causton, HC; Gaasterland, T; Glenisson, P; Holstege, FC; Kim, SI; Markowitz, V; Matese, JC; Parkinson, H; Robinson, A; Sarkans, U; Schulze-Kremer, S; Stewart, J; Taylor, R; Vilo, J; Vingron, M (diciembre de 2001). "Información mínima sobre un experimento de microarrays (MIAME): hacia estándares para datos de microarrays". Genética de la Naturaleza . 29 (4): 365–71. doi : 10.1038/ng1201-365 . PMID  11726920. S2CID  6994467.