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Gary Ruvkun

Gary Bruce Ruvkun (nacido en marzo de 1952, Berkeley, California ) [1] es un biólogo molecular estadounidense del Hospital General de Massachusetts y profesor de genética en la Facultad de Medicina de Harvard en Boston . [2] Ruvkun descubrió el mecanismo por el cual lin-4 , el primer microARN (miARN) descubierto por Victor Ambros , regula la traducción de ARN mensajeros objetivo a través de apareamiento de bases imperfecto a esos objetivos, y descubrió el segundo miARN, let-7 , y que se conserva en toda la filogenia animal, incluso en humanos. Estos descubrimientos de miARN revelaron un nuevo mundo de regulación de ARN a una escala de tamaño pequeño sin precedentes, y el mecanismo de esa regulación. Ruvkun también descubrió muchas características de la señalización similar a la insulina en la regulación del envejecimiento y el metabolismo. Fue elegido miembro de la Sociedad Filosófica Estadounidense en 2019.

Educación

Ruvkun obtuvo su título universitario en 1973 en la Universidad de California, Berkeley . Realizó su trabajo de doctorado en la Universidad de Harvard en el laboratorio de Frederick M. Ausubel , donde investigó los genes de fijación de nitrógeno bacteriano . Ruvkun completó estudios posdoctorales con Robert Horvitz en el Instituto Tecnológico de Massachusetts (MIT) y Walter Gilbert de Harvard. [3]

Investigación

ARNmlin-4

La investigación de Ruvkun reveló que el miRNA lin-4 , un ARN regulador de 22 nucleótidos descubierto en 1992 por el laboratorio de Victor Ambros , regula su ARNm diana lin-14 mediante la formación de dúplex de ARN imperfectos para regular a la baja la traducción. La primera indicación de que el elemento regulador clave del gen lin-14 reconocido por el producto del gen lin-4 estaba en la región no traducida 3' de lin-14 provino del análisis de las mutaciones de ganancia de función de lin-14 que mostraron que son deleciones de elementos conservados en la región no traducida 3' de lin-14 . La eliminación de estos elementos alivia la represión normal específica de la etapa tardía de la producción de la proteína LIN-14, y lin-4 es necesario para esa represión por la región no traducida 3' normal de lin-14 . [4] [5] En un avance clave, el laboratorio de Ambros descubrió que lin-4 codifica un producto de ARN muy pequeño, que define los miRNA de 22 nucleótidos. Cuando Ambros y Ruvkun compararon la secuencia del miRNA lin-4 y la región no traducida 3' de lin-14 , descubrieron que los pares de bases de ARN lin-4 con protuberancias y bucles conservados con la región no traducida 3' del ARNm diana lin-14 , y que las mutaciones de ganancia de función de lin-14 eliminan estos sitios complementarios de lin-4 para aliviar la represión normal de la traducción por lin-4 . Además, demostraron que la región no traducida 3' de lin-14 podría conferir esta represión de la traducción dependiente de lin-4 en ARNm no relacionados mediante la creación de ARNm quiméricos que respondían a lin-4 . En 1993, Ruvkun informó en la revista Cell sobre la regulación de lin-14 por lin-4 . [6] En el mismo número de Cell , Victor Ambros describió el producto regulador de lin-4 como un ARN pequeño. [7] Estos artículos revelaron un nuevo mundo de regulación de ARN a una escala de tamaño pequeño sin precedentes, y el mecanismo de esa regulación. [8] [9] En conjunto, esta investigación ahora se reconoce como la primera descripción de microARN y el mecanismo por el cual los dúplex de miARN::ARNm parcialmente apareados con bases inhiben la traducción. [10]

microARN,dejar-7

En 2000, el laboratorio de Ruvkun informó sobre la identificación del segundo microARN de C. elegans , let-7 , que al igual que el primer microARN regula la traducción del gen diana, en este caso lin-41 , a través de un apareamiento imperfecto de bases con la región 3' no traducida de ese ARNm. [11] [12] Esto fue una indicación de que la regulación de miARN a través de la complementariedad 3' UTR puede ser una característica común, y que probablemente habría más microARN. La generalidad de la regulación de microARN a otros animales fue establecida por el laboratorio de Ruvkun más tarde en 2000, cuando informaron que la secuencia y regulación del microARN let-7 se conserva en toda la filogenia animal, incluso en los humanos. [13] En la actualidad, se han descubierto miles de miARN, lo que apunta a un mundo de regulación genética en este régimen de tamaño.

miRNAs y siRNAs

Cuando Hamilton y Baulcombe descubrieron en 1999 siRNAs del mismo tamaño de 21-22 nucleótidos que lin-4 y let-7 en plantas, [14] los campos de RNAi y miRNAs convergieron de repente. Parecía probable que los miRNAs y siRNAs de tamaño similar utilizarían mecanismos similares. En un esfuerzo colaborativo, los laboratorios de Mello y Ruvkun demostraron que los primeros componentes conocidos de interferencia de ARN y sus parálogos, Dicer y las proteínas PIWI, son utilizados tanto por miRNAs como por siRNAs. [15] El laboratorio de Ruvkun identificó en 2003 muchos más miRNAs, [16] [17] identificó miRNAs de neuronas de mamíferos, [18] y en 2007 descubrió muchos nuevos cofactores proteicos para la función de miRNA. [19] [20] [21]

Metabolismo y longevidad de C. elegans

El laboratorio de Ruvkun también ha descubierto que una vía de señalización similar a la insulina controla el metabolismo y la longevidad de C. elegans. Klass [22] Johnson [23] y Kenyon [24] demostraron que el programa de detención del desarrollo mediado por mutaciones en age-1 y daf-2 aumenta la longevidad de C. elegans. El laboratorio de Ruvkun estableció que estos genes constituyen un receptor similar a la insulina y una fosfatidilinositol quinasa dependiente que se acoplan al producto del gen daf-16 , un factor de transcripción Forkhead altamente conservado. Los homólogos de estos genes ahora se han implicado en la regulación del envejecimiento humano. [25] Estos hallazgos también son importantes para la diabetes, ya que los ortólogos mamíferos de daf-16 (conocidos como factores de transcripción FOXO) también están regulados por la insulina. El laboratorio de Ruvkun ha utilizado bibliotecas de ARNi de genoma completo para descubrir un conjunto integral de genes que regulan el envejecimiento y el metabolismo. Muchos de estos genes están ampliamente conservados en la filogenia animal y es probable que revelen el sistema neuroendocrino que evalúa y regula las reservas de energía y asigna vías metabólicas en función de ese estado.

SETG: La búsqueda de genomas extraterrestres

Desde el año 2000, el laboratorio de Ruvkun, en colaboración con Maria Zuber del MIT , Chris Carr (ahora en Georgia Tech) y Michael Finney (ahora empresario de biotecnología de San Francisco), ha estado desarrollando protocolos e instrumentos que pueden amplificar y secuenciar ADN y ARN para buscar vida en otro planeta que esté ancestralmente relacionado con el Árbol de la Vida en la Tierra. El proyecto de Búsqueda de Genomas Extraterrestres, o SETG, ha estado desarrollando un pequeño instrumento que puede determinar secuencias de ADN en Marte (o cualquier otro cuerpo planetario) y enviar la información de esos archivos de secuencias de ADN a la Tierra para compararla con la vida en la Tierra.

Vigilancia inmunitaria innata

En 2012, Ruvkun hizo una contribución original al campo de la inmunología con la publicación de un artículo destacado en la revista Cell que describe un mecanismo elegante para la vigilancia inmunológica innata en animales que se basa en el monitoreo de funciones celulares centrales en el huésped, que a menudo son saboteadas por toxinas microbianas durante el curso de la infección. [26]

Vida microbiana más allá del Sistema Solar

En 2019, Ruvkun, junto con Chris Carr, Mike Finney y Maria Zuber , [27] presentó el argumento de que la aparición de vida microbiana sofisticada en la Tierra poco después de que se enfriara, y los recientes descubrimientos de Júpiteres calientes y migraciones planetarias disruptivas en sistemas de exoplanetas favorecen la propagación de la vida microbiana basada en ADN en toda la galaxia. El proyecto SETG está trabajando para que la NASA envíe un secuenciador de ADN a Marte para buscar vida allí con la esperanza de que se descubra evidencia de que la vida no surgió originalmente en la Tierra , sino en otras partes del universo . [28]

Artículos publicados y reconocimientos

En 2018, Ruvkun ha publicado alrededor de 150 artículos científicos. Ruvkun ha recibido numerosos premios por sus contribuciones a la ciencia médica, por sus contribuciones al campo del envejecimiento [29] y por el descubrimiento de los microARN . [30] Ha recibido el Premio Lasker de Investigación Médica Básica, [31] el Premio Internacional de la Fundación Gairdner y la Medalla Benjamin Franklin en Ciencias de la Vida. [32] Ruvkun fue elegido miembro de la Academia Nacional de Ciencias en 2008.

Premios

Referencias

  1. ^ Quién es quién en Estados Unidos , 66.ª edición, vol. 2: M–Z. Marquis Who's Who, Berkeley Heights 2011, pág. 3862
  2. ^ Nair, P. (2011). "Perfil de Gary Ruvkun". Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 108 (37): 15043–5. Bibcode :2011PNAS..10815043N. doi : 10.1073/pnas.1111960108 . PMC  3174634 . PMID  21844349.
  3. ^ Página de la facultad de la Facultad de Medicina de Harvard
  4. ^ Arasu, P.; Wightman, B.; Ruvkun, G. (1991). "Regulación temporal de lin-14 por la acción antagónica de otros dos genes heterocrónicos, lin-4 y lin-28". Genes & Development . 5 (10): 1825–1833. doi : 10.1101/gad.5.10.1825 . PMID  1916265.
  5. ^ Wightman, B.; Bürglin, TR; Gatto, J.; Arasu, P.; Ruvkun, G. (1991). "Las secuencias reguladoras negativas en la región 3'-no traducida de lin-14 son necesarias para generar un cambio temporal durante el desarrollo de Caenorhabditis elegans". Genes & Development . 5 (10): 1813–1824. doi : 10.1101/gad.5.10.1813 . PMID  1916264.
  6. ^ Wightman, B.; Ha, I.; Ruvkun, G. (1993). "La regulación postranscripcional del gen heterocrónico lin-14 por lin-4 media la formación de patrones temporales en C. Elegans". Cell . 75 (5): 855–862. doi : 10.1016/0092-8674(93)90530-4 . PMID  8252622.
  7. ^ Lee, RC; Feinbaum, RL; Ambros, V. (1993). "El gen heterocrónico lin-4 de C. Elegans codifica ARN pequeños con complementariedad antisentido con lin-14". Cell . 75 (5): 843–854. doi : 10.1016/0092-8674(93)90529-Y . PMID  8252621.
  8. ^ Ruvkun, G; Wightman, B; Bürglin, T; Arasu, P (1991). "Mutaciones dominantes de ganancia de función que conducen a una mala regulación del gen heterocrónico lin-14 de C. Elegans y las implicaciones evolutivas de las mutaciones dominantes en los genes de formación de patrones". Desarrollo. Suplemento . 1 : 47–54. PMID  1742500.
  9. ^ Ruvkun, G.; Ambros, V.; Coulson, A.; Waterston, R.; Sulston, J.; Horvitz, HR (1989). "Genética molecular del gen heterocrónico Lin-14 de Caenorhabditis elegans". Genética . 121 (3): 501–516. doi :10.1093/genetics/121.3.501. PMC 1203636 . PMID  2565854. 
  10. ^ Ruvkun, G.; Wightman, B.; Ha, I. (2004). "Los 20 años que se necesitaron para reconocer la importancia de los ARN diminutos". Cell . 116 (2 Suppl): S93–S96, 2 S96 después de S96. doi : 10.1016/S0092-8674(04)00034-0 . PMID  15055593. S2CID  17490257.
  11. ^ Reinhart, BJ; Slack, FJ; Basson, M.; Pasquinelli, AE; Bettinger, JC; Rougvie, AE; Horvitz, HR; Ruvkun, G. (2000). "El ARN let-7 de 21 nucleótidos regula el tiempo de desarrollo en Caenorhabditis elegans". Nature . 403 (6772): 901–906. Bibcode :2000Natur.403..901R. doi :10.1038/35002607. PMID  10706289. S2CID  4384503.
  12. ^ Slack, FJ; Basson, M.; Liu, Z.; Ambros, V.; Horvitz, HR; Ruvkun, G. (2000). "El gen lin-41 RBCC actúa en la vía heterocrónica de C. Elegans entre el ARN regulador let-7 y el factor de transcripción LIN-29". Molecular Cell . 5 (4): 659–669. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80245-2 . PMID  10882102.
  13. ^ Pasquinelli, AE; Reinhart, BJ; Slack, F.; Martindale, MQ; Kuroda, MI; Maller, B.; Hayward, DC; Ball, EE; Degnan, B.; Müller, B.; Spring, P.; Srinivasan, JR; Fishman, A.; Finnerty, M.; Corbo, J.; Levine, J.; Leahy, M.; Davidson, P.; Ruvkun, E. (2000). "Conservación de la secuencia y expresión temporal del ARN regulador heterocrónico let-7". Nature . 408 (6808): 86–89. Bibcode :2000Natur.408...86P. doi :10.1038/35040556. PMID  11081512. S2CID  4401732.
  14. ^ Hamilton, AJ; Baulcombe, DC (1999). "Una especie de ARN antisentido pequeño en el silenciamiento génico postranscripcional en plantas". Science . 286 (5441): 950–952. doi :10.1126/science.286.5441.950. PMID  10542148.
  15. ^ Grishok, A.; Pasquinelli, AE; Conte, D.; Li, N.; Parrish, S.; Ha, I.; Baillie, DL; Fire, A.; Ruvkun, G.; Mello, CC (2001). "Los genes y mecanismos relacionados con la interferencia del ARN regulan la expresión de los ARN temporales pequeños que controlan el ritmo de desarrollo de C. Elegans". Cell . 106 (1): 23–34. doi : 10.1016/S0092-8674(01)00431-7 . PMID  11461699. S2CID  6649604.
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  27. ^ Ruvkun, Gary (17 de abril de 2019). "Video de YouTube (24:32) – Breakthrough Discuss 2019 – Lo que es cierto para E. coli en la Tierra será cierto para la vida en Proxima Centauri b". Universidad de Berkeley . Consultado el 9 de julio de 2019 .
  28. ^ Chotiner, Isaac (8 de julio de 2019). «¿Qué pasaría si la vida no se originara en la Tierra?». The New Yorker . ISSN  0028-792X . Consultado el 9 de julio de 2019 .
  29. ^ "Se anuncian los ganadores del décimo aniversario del premio Dan David 2011: los hermanos Coen, por Cine; Marcus Feldman, por Evolución; Cynthia Kenyon y Gary Ruvkun, por Envejecimiento". www.newswire.ca . Consultado el 25 de abril de 2018 .
  30. ^ "Gary Ruvkun" Archivado el 12 de mayo de 2008 en Wayback MachineThe Gairdner Foundation (Consultado el 25 de mayo de 2008)
  31. ^ "Gary Ruvkun" Archivado el 16 de julio de 2010 en Wayback MachineThe Lasker Foundation (Consultado el 15 de septiembre de 2008)
  32. ^ "Premio Franklin". Archivado desde el original el 15 de mayo de 2008. Consultado el 14 de diciembre de 2021 .
  33. ^ "Victor Ambros recibió el premio March of Dimes 2016 por el descubrimiento conjunto de los microARN". Facultad de Medicina de la Universidad de Massachusetts. 3 de mayo de 2016. Consultado el 9 de septiembre de 2016 .

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