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Pegivirus

Dibujo esquemático de un virión de Pegivirus (sección transversal y vista lateral)

Pegivirus es el nombre aprobado para un género de virus de ARN monocatenario positivode la familia Flaviviridae . [1] [2] [3] [4] El nombre es derivado: "Pe" significa "persistente" y "g" es una referencia a Hepatitis G , un nombre anterior de laespecie C.

Genoma del pegivirus

Taxonomía

Once especies nombradas están dentro del género Pegivirus . [2] Los aislados que pertenecen a la especie Pegivirus C son monofiléticos y muestran < 50% de divergencia de secuencia de nucleótidos (55% de aminoácidos) entre secuencias alineadas de la poliproteína entre sí. Sin embargo, todos difieren en >50% de divergencia de nucleótidos (>55% de aminoácidos) de otros miembros de este género. Los pegivirus asignados a esta especie ( Pegivirus A ) se originan de especies hospedadoras de primates (humanos, chimpancés y varias especies de monos del Nuevo Mundo). La secuencia U22303 ha sido asignada como el miembro tipo de la especie, ya que este fue el primer pegivirus que se describió para esta especie. La terminología para describir virus con diferentes hospedadores no ha sido aprobada por el Comité Internacional de Taxonomía de Virus; sin embargo, los virus Pegivirus A han sido llamados HPgV para pegivirus humanos, SPgV para pegivirus de simios del nuevo mundo y SPgVcpz para virus de simios de chimpancés. [ cita requerida ]

Una segunda especie dentro de los pegivirus se denomina Pegivirus B. Solo se incluyó un virus en la propuesta de denominación, que era un genoma completo de un virus encontrado en la especie de murciélago Pteropus giganteus . Esta secuencia difiere en una divergencia de >50% de nucleótidos (>55% de aminoácidos) de todos los miembros propuestos de la especie Pegivirus C derivada de primates que se originan de especies hospedadoras primates (humanos, chimpancés y varias especies de monos del Nuevo Mundo). La secuencia GU566734 ha sido asignada como el miembro tipo de la especie, ya que este fue el primer pegivirus que se describió para esta especie. [ cita requerida ]

El uso de tecnologías de secuenciación profunda ha identificado virus adicionales que difieren de las especies de Pegivirus B en >50% de nucleótidos (>55% de aminoácidos) y Pegivirus C en roedores, caballos y en diferentes especies de murciélagos y monos del Viejo Mundo, y el número de especies de Pegivirus se ha ampliado a once. [5]

Taxonomía revisada

Las especies conocidas en 2016 se han clasificado desde entonces en 11 especies: Pegivirus A–K. [2] [5]

Historia

Notas

Referencias

  1. ^ Simmonds, Peter; Becher, Paul; Bukh, Jens; Gould, Ernest A; Meyers, Gregor; Monath, Tom; Muerhoff, Scott; Pletnev, Alexander; Rico-Hesse, Rebecca; Smith, Donald B; Stapleton, Jack T; Ictv Report, Consortium (2017). "Perfil de taxonomía del virus ICTV: Flaviviridae". Revista de virología general . 98 (1): 2–3. doi :10.1099/jgv.0.000672. PMC  5370391 . PMID  28218572.
  2. ^ abcde "Informe ICTV Flaviviridae".
  3. ^ ab Stapleton, J. T; Foung, S; Muerhoff, A. S; Bukh, J; Simmonds, P (2010). "Los virus GB: una revisión y una clasificación propuesta de GBV-A, GBV-C (HGV) y GBV-D en el género Pegivirus dentro de la familia Flaviviridae". Revista de Virología General . 92 (2): 233–46. doi :10.1099/vir.0.027490-0. PMC 3081076 . PMID  21084497. 
  4. ^ Adams, M. J; Lefkowitz, E. J; King, AM Q; Carstens, E. B (2013). "Cambios recientemente acordados al Código Internacional de Clasificación y Nomenclatura de Virus". Archivos de Virología . 158 (12): 2633–9. doi : 10.1007/s00705-013-1749-9 . PMID  23836393.
  5. ^ abc Smith, Donald B; Becher, Paul; Bukh, Jens; Gould, Ernest A; Meyers, Gregor; Monath, Thomas; Muerhoff, A. Scott; Pletnev, Alexander; Rico-Hesse, Rebecca; Stapleton, Jack T; Simmonds, Peter (2016). "Actualización propuesta a la taxonomía de los géneros Hepacivirus y Pegivirus dentro de la familia Flaviviridae". Revista de Virología General . 97 (11): 2894–2907. doi :10.1099/jgv.0.000612. PMC 5770844 . PMID  27692039. 
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  7. ^ Epstein, Jonathan H; Quan, Phenix-Lan; Briese, Thomas; Street, Craig; Jabado, Omar; Conlan, Sean; Ali Khan, Shahneaz; Verdugo, Dawn; Hossain, M. Jahangir; Hutchison, Stephen K; Egholm, Michael; Luby, Stephen P; Daszak, Peter; Lipkin, W. Ian (2010). "Identificación de GBV-D, un nuevo flavivirus similar a GB de murciélagos frugívoros del Viejo Mundo (Pteropus giganteus) en Bangladesh". PLOS Pathogens . 6 (7): e1000972. doi : 10.1371/journal.ppat.1000972 . PMC 2895649 . PMID  20617167. 
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  10. ^ Shi, Mang; Lin, Xian-Dan; Vasilakis, Nikos; Tian, ​​Jun-Hua; Li, Ci-Xiu; Chen, Liang-Jun; Eastwood, Gillian; Diao, Xiu-Nian; Chen, Ming-Hui; Chen, Xiao; Qin, Xin-Cheng; Widen, Steven G; Wood, Thomas G; Tesh, Robert B; Xu, Jianguo; Holmes, Edward C ; Zhang, Yong-Zhen (2016). "Virus divergentes descubiertos en artrópodos y vertebrados revisan la historia evolutiva de los flaviviridae y virus relacionados". Revista de Virología . 90 (2): 659–69. doi :10.1128/JVI.02036-15. PMC 4702705 . PMID  26491167. 
  11. ^ Thézé, Julien; Lowes, Sophia; Parker, Joe; Pybus, Oliver G (2015). "Análisis evolutivo y filogenético de los hepacivirus y los pegivirus". Genome Biology and Evolution . 7 (11): 2996–3008. doi :10.1093/gbe/evv202. PMC 5635594 . PMID  26494702. 
  12. ^ "Los científicos descubren una causa oculta de la encefalitis".
  13. ^ Kapoor, A; Simmonds, P; Scheel, TK H; Hjelle, B; Cullen, JM; Burbelo, PD; Chauhan, LV; Duraisamy, R; Sánchez León, M; Jainista, K; Vandegrift, KJ; Calisher, CH ; Arroz, CM; Lipkin, WI (2013). "Identificación de homólogos en roedores del virus de la hepatitis C y pegivirus". mBio . 4 (2): e00216–13. doi :10.1128/mBio.00216-13. PMC 3622934 . PMID  23572554. 
  14. ^ Kapoor, A; Simmonds, P; Cullen, JM; Scheel, TK H; Medina, JL; Giannitti, F; Nishiuchi, E; Brock, KV; Burbelo, PD; Arroz, CM; Lipkin, WI (2013). "Identificación de un pegivirus (virus similar al virus GB) que infecta a los caballos". Revista de Virología . 87 (12): 7185–90. doi :10.1128/JVI.00324-13. PMC 3676142 . PMID  23596285.