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Fuente de referencia de colocalización

La Colocalization Benchmark Source ( CBS ) es una colección gratuita de imágenes descargables para probar y validar el grado de colocalización de marcadores en cualquier estudio de microscopía de fluorescencia . La colocalización es un fenómeno visual cuando dos moléculas de interés están asociadas con las mismas estructuras en las células y potencialmente comparten características funcionales comunes. [1] [2] [3]

CBS proporciona a los investigadores herramientas de referencia para verificar los resultados de las mediciones cuantitativas de colocalización. [4] Sirve como una base de datos informática de bioimagen especializada de imágenes simuladas por computadora con valores de colocalización exactamente conocidos (predefinidos). Fueron creados utilizando un algoritmo de simulación de imágenes . Estas imágenes de referencia se pueden descargar tanto en conjuntos como por separado. Al calcular y comparar los valores de los coeficientes de sus imágenes con las imágenes de referencia, los investigadores pueden validar los resultados de los estudios cuantitativos de colocalización. El uso de imágenes CBS se describió en varios estudios. [5] [6] [7] [8]

Ejemplos

Los investigadores pueden enviar ejemplos de imágenes personalizadas cuando se utilizaron imágenes de referencia para validar la colocalización en ellas. Las imágenes enviadas luego se publican en el sitio de CBS junto con una descripción de sus propiedades y los valores de los coeficientes, como el coeficiente de correlación de Pearson (Rr) , el coeficiente de superposición (R) , y otros. La plantilla para enviar información sobre imágenes personalizadas se puede descargar desde el sitio de CBS.

Ver también

Referencias

  1. ^ Bolte S & Cordelieres FP (2006). "Una visita guiada al análisis de colocalización subcelular en microscopía óptica". J Microsc 224:213–232.
  2. ^ Comeau JW y col. (2006). "Una guía para mediciones precisas de colocalización por microscopía de fluorescencia". Biophys J 91:4611-4622.
  3. ^ Zinchuk V y Grossenbacher-Zinchuk O (2009). "Avances recientes en el análisis cuantitativo de colocalización: centrarse en la neurociencia". Prog Histochem Cytochem 44:125-172.
  4. ^ Manders E y col. (1993). "Medición de la colocalización de objetos en imágenes confocales de dos colores". J Microsc Oxford 169:375–382.
  5. ^ Wu Y y col. (2010). "Determinación cuantitativa de correlaciones espaciales proteína-proteína en microscopía confocal de fluorescencia". Biophys J 98:493-504.
  6. ^ Zinchuk V y col. (2011). "Cuantificar las correlaciones espaciales de marcadores fluorescentes utilizando una reducción de fondo mejorada con estimaciones del índice de proximidad de proteínas y del coeficiente de correlación". Protocolo Nacional 6:1554-1567.
  7. ^ Zinchuk V y Grossenbacher-Zinchuk O (2011). "Análisis cuantitativo de colocalización de imágenes de microscopía de fluorescencia confocal". Unidad de Biol Celular Curr Protoc 4.19. Archivado el 28 de noviembre de 2009 en la Wayback Machine.
  8. ^ Zinchuk V y col. (2013). "Reducir la brecha entre los resultados de colocalización cualitativos y cuantitativos en estudios de microscopía de fluorescencia". Representante científico 3:1365 doi:10.1038/srep01365.

enlaces externos