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Familia de glucósido hidrolasa 97

En biología molecular, la familia glucósido hidrolasa 97 es una familia de glucósido hidrolasas .

Glucósido hidrolasas EC 3.2.1. son un grupo muy extendido de enzimas que hidrolizan el enlace glicosídico entre dos o más carbohidratos, o entre un carbohidrato y un resto no carbohidrato. Un sistema de clasificación de las glucósido hidrolasas, basado en la similitud de secuencia, ha llevado a la definición de más de 100 familias diferentes. [1] [2] [3] Esta clasificación está disponible en el sitio web de CAZy , [4] [5] y también se analiza en CAZypedia, una enciclopedia en línea de enzimas activas de carbohidratos. [6] [7]

La familia glucósido hidrolasa 97 (GH97) es una familia bacteriana . La parte central de las secuencias de proteínas de la familia GH97 representa un dominio típico y completo (beta/alfa) de 8 barriles o de tipo TIM-barril catalítico . Las partes N y C-terminales de las secuencias, que consisten principalmente en cadenas beta , probablemente forman dos dominios no catalíticos adicionales con funciones aún desconocidas. Los dominios no catalíticos de las glicosidasas de las superfamilias de alfa-galactosidasa y alfa-glucosidasa también están compuestos predominantemente de cadenas beta, y al menos algunos de estos dominios están implicados en la oligomerización y la unión a carbohidratos. En todas las glicosidasas conocidas con el pliegue en barril (beta-alfa)8, los residuos de aminoácidos en el sitio activo se encuentran en los extremos C terminales de las cadenas beta. [8]

enlaces externos

Referencias

  1. ^ Henrissat B, Callebaut I, Mornon JP, Fábrega S, Lehn P, Davies G (1995). "Maquinaria catalítica conservada y predicción de un pliegue común para varias familias de glicosilhidrolasas". Proc. Nacional. Acad. Ciencia. EE.UU . 92 (15): 7090–7094. Código bibliográfico : 1995PNAS...92.7090H. doi : 10.1073/pnas.92.15.7090 . PMC  41477 . PMID  7624375.
  2. ^ Henrissat B, Davies G (1995). "Estructuras y mecanismos de las glicosilhidrolasas". Estructura . 3 (9): 853–859. doi : 10.1016/S0969-2126(01)00220-9 . PMID  8535779.
  3. ^ "Bairoch, A." Clasificación de familias de glicosil hidrolasas e índice de entradas de glicosil hidrolasas en SWISS-PROT ". 1999". Archivado desde el original el 25 de mayo de 2011 . Consultado el 4 de octubre de 2011 .
  4. ^ "Inicio". CAZy.org . Consultado el 6 de marzo de 2018 .
  5. ^ Lombard, Vicente; Golaconda Ramulu, Hemalatha; Dráula, Elodie; Coutinho, Pedro M.; Henrissat, Bernard (1 de enero de 2014). "La base de datos de enzimas activas sobre carbohidratos (CAZy) en 2013". Investigación de ácidos nucleicos . 42 (D1): D490–D495. doi : 10.1093/nar/gkt1178. ISSN  0305-1048. PMC 3965031 . PMID  24270786. 
  6. ^ "Familia glucósido hidrolasa 97". CAZypedia.org . Consultado el 6 de marzo de 2018 .
  7. ^ Consorcio CAZypedia (1 de diciembre de 2018). "Diez años de CAZypedia: una enciclopedia viviente de enzimas activas sobre carbohidratos". Glicobiología . 28 (1): 3–8. doi : 10.1093/glicob/cwx089 . hdl : 21.11116/0000-0003-B7EB-6 . ISSN  1460-2423. PMID  29040563.
  8. ^ Director General Naumoff (2005). "GH97 es una nueva familia de glucósido hidrolasas, relacionada con la superfamilia de alfa-galactosidasa". Genómica BMC . 6 : 112. doi : 10.1186/1471-2164-6-112 . PMC 1249566 . PMID  16131397. 
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