Familia de glucósido hidrolasa 15

En biología molecular, la familia glucósido hidrolasa 15 es una familia de glucósido hidrolasas .

Glucósido hidrolasas EC 3.2.1. son un grupo muy extendido de enzimas que hidrolizan el enlace glicosídico entre dos o más carbohidratos, o entre un carbohidrato y un resto no carbohidrato. Un sistema de clasificación de las glucósido hidrolasas, basado en la similitud de secuencia, ha llevado a la definición de más de 100 familias diferentes. ^{[1] [2] [3]} Esta clasificación está disponible en el sitio web de CAZy , ^{[4] [5]} y también se analiza en CAZypedia, una enciclopedia en línea de enzimas activas de carbohidratos. ^{[6] [7]} y[_]9

La familia de glucósido hidrolasa 15 CAZY GH_15 comprende enzimas con varias actividades conocidas; glucoamilasa ( EC 3.2.1.3); alfa-glucosidasa ( EC 3.2.1.20); glucodextranasa ( EC 3.2.1.70).

La glucoamilasa (GA) cataliza la liberación de D-glucosa de los extremos no reductores del almidón y otros oligo o polisacáridos. Los estudios de GA fúngicos han indicado tres residuos ácidos muy agrupados que desempeñan un papel en el mecanismo catalítico. ^[8] Esta región también se conserva en un GA bacteriano recientemente secuenciado. ^[9]

La estructura tridimensional del pseudotetrasacárido acarbosa forma un complejo con la glucoamilasa II (471) de Aspergillus awamori var. X100 se ha determinado con una resolución de 2,4 A. ^[10] La proteína pertenece principalmente a la clase alfa y contiene 19 hélices y 9 hebras .

Referencias

1. Henrissat B, Callebaut I, Fábrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (julio de 1995). "Maquinaria catalítica conservada y predicción de un pliegue común para varias familias de glicosilhidrolasas". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 92 (15): 7090–4. Código bibliográfico : 1995PNAS...92.7090H. doi : 10.1073/pnas.92.15.7090 . PMC  41477 . PMID  7624375.
2. Davies G, Henrissat B (septiembre de 1995). "Estructuras y mecanismos de las glicosilhidrolasas". Estructura . 3 (9): 853–9. doi : 10.1016/S0969-2126(01)00220-9 . PMID  8535779.
3. Henrissat B, Bairoch A (junio de 1996). "Actualización de la clasificación basada en secuencias de glicosilhidrolasas". La revista bioquímica . 316 (Parte 2) (Parte 2): 695–6. doi :10.1042/bj3160695. PMC 1217404 . PMID  8687420. 
4. "Inicio". CAZy.org . Consultado el 6 de marzo de 2018 .
5. Lombard V, Golaconda Ramulu H, Drula E, Coutinho PM, Henrissat B (enero de 2014). "La base de datos de enzimas activas sobre carbohidratos (CAZy) en 2013". Investigación de ácidos nucleicos . 42 (Problema de base de datos): D490-5. doi : 10.1093/nar/gkt1178. PMC 3965031 . PMID  24270786. 
6. "Familia glucósido hidrolasa 15". CAZypedia.org . Consultado el 6 de marzo de 2018 .
7. Consorcio CAZypedia (diciembre de 2018). "Diez años de CAZypedia: una enciclopedia viviente de enzimas activas en carbohidratos" (PDF) . Glicobiología . 28 (1): 3–8. doi : 10.1093/glicob/cwx089 . hdl :21.11116/0000-0003-B7EB-6. PMID  29040563.
8. Sierks MR, Ford C, Reilly PJ, Svensson B (enero de 1990). "Mecanismo catalítico de la glucoamilasa fúngica definido por mutagénesis de Asp176, Glu179 y Glu180 en la enzima de Aspergillus awamori". Ingeniería de proteínas . 3 (3): 193–8. doi : 10.1093/proteína/3.3.193. PMID  1970434.
9. Ohnishi H, Kitamura H, Minowa T, Sakai H, Ohta T (julio de 1992). "Clonación molecular de un gen de glucoamilasa de un Clostridium termófilo y cinética de la enzima clonada". Revista europea de bioquímica . 207 (2): 413–8. doi :10.1111/j.1432-1033.1992.tb17064.x. PMID  1633799.
10. Aleshin AE, Firsov LM, Honzatko RB (junio de 1994). "Estructura refinada para el complejo de acarbosa con glucoamilasa de Aspergillus awamori var. X100 a resolución 2,4-A". La Revista de Química Biológica . 269 ​​(22): 15631–9. doi : 10.1016/S0021-9258(17)40728-9 . PMID  8195212.