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Erez Lieberman Aiden

Erez Lieberman Aiden (nacido en 1980, de soltera Erez Lieberman) es un científico investigador estadounidense activo en múltiples campos relacionados con las matemáticas aplicadas . [1] Es profesor de genética molecular y humana y académico emérito McNair en el Baylor College of Medicine , y anteriormente miembro de la Harvard Society of Fellows y miembro del profesorado visitante en Google . Es profesor adjunto de informática en la Rice University . Utilizando enfoques matemáticos y computacionales, ha estudiado la evolución en una variedad de contextos, incluido el de las redes a través de la teoría de grafos evolutivos y los lenguajes en el campo de la culturómica . Ha publicado artículos científicos en una variedad de disciplinas.

Lieberman Aiden ha ganado premios, entre ellos el Premio para estudiantes Lemelson-MIT y el Premio de la Sociedad Estadounidense de Física a la investigación de tesis doctoral destacada en física biológica. En 2009, Lieberman Aiden fue nombrado uno de los 35 principales innovadores menores de 35 años por Technology Review y en 2011 fue uno de los destinatarios del Premio Presidencial de Carrera Temprana para Científicos e Ingenieros .

Vida temprana y educación

Lieberman creció en Brooklyn con tres hermanos. Comenzó a programar computadoras a la edad de siete años. [3] Su padre, Aharon Lieberman, era un empresario tecnológico y era dueño de una fábrica en Nueva Jersey . [4] [5] Cuando era niño, Lieberman Aiden hablaba hebreo y húngaro , por lo que el inglés era su tercer idioma. [5]

Lieberman Aiden estudió matemáticas, física y filosofía en Princeton y obtuvo una maestría en Historia en la Universidad Yeshiva . Luego completó un doctorado conjunto en matemáticas y bioingeniería en la División de Ciencias de la Salud y Tecnología de Harvard-MIT , donde fue asesorado por [2] Eric Lander y Martin Nowak . [6]

Investigación y carrera

Lieberman Aiden contribuyó a la fundación de la teoría de grafos evolutivos junto con su supervisor de doctorado Martin Nowak . [7] [8] Desde entonces ha estado involucrado en la investigación de la estructura tridimensional del genoma humano y en el campo de la culturómica .

El modelo de glóbulo fractal ( izquierda ) de la estructura tridimensional del genoma sugerido por Lieberman Aiden y colaboradores contrastado con un modelo de equilibrio ( derecha ) (las imágenes pequeñas muestran secciones transversales)

Estructura del genoma en 3D

Lieberman Aiden formó parte de un equipo de científicos de la Facultad de Medicina de la Universidad de Massachusetts y del MIT que fue el primero en sugerir que el ADN humano se pliega en un glóbulo fractal en lugar de un glóbulo de equilibrio. [4] Este hallazgo explica cómo el genoma de cada célula puede compactarse en gran medida sin formar un nudo . Lieberman Aiden y sus colaboradores inventaron una variante de captura de conformación cromosómica llamada "Hi-C", que produce una medida de probabilidades de contacto en todo el genoma que apunta a una estructura tridimensional del genoma. Esta técnica combina la metodología de captura cromosómica existente con la secuenciación de próxima generación , lo que permite una medida de todos contra todos de los contactos de cromatina. [9]

En 2009, este trabajo se publicó en la revista Science y apareció como ilustración de portada. [10] Después de la publicación, se citó a Lieberman Aiden diciendo: [11]

Sabemos desde hace tiempo que, a pequeña escala, el ADN es una doble hélice… Pero si la doble hélice no se plegara más, el genoma de cada célula mediría dos metros de largo. Los científicos no han entendido bien cómo se pliega la doble hélice para encajar en el núcleo de una célula humana, que tiene sólo una centésima de milímetro de diámetro. Este nuevo enfoque nos ha permitido investigar exactamente esa cuestión. [11]

En 2014, se desempeñó como autor principal de un artículo en Cell que describía un método refinado de Hi-C que su equipo utilizó para describir la organización fundamental del ADN. [12]

Erez Lieberman Aiden dando una conferencia sobre culturómica en la Universidad de Harvard en 2011

Culturómica

Lieberman Aiden participó en el análisis de un corpus de alrededor de 5 millones de libros digitalizados, aplicando técnicas de minería de datos para avanzar en el nuevo campo de la culturómica. [13] [14] Leiberman Aiden participó en un proyecto para digitalizar textos anglosajones en 2004, cuyo análisis proporcionó evidencia de apoyo a la regularización verbal, un proceso por el cual los verbos irregulares se vuelven cada vez más regulares con el tiempo. [15]

Tras el anuncio de Google Books , Lieberman Aiden se puso en contacto con el director de investigación de Google, Peter Norvig , y se le permitió analizar estadísticamente sus datos. [16] Su trabajo contribuyó al Google Ngram Viewer , lanzado en diciembre de 2010, que utiliza ideas de culturómica para producir tendencias históricas normalizadas para cualquier secuencia de letras. [13] Este proyecto publicó una serie de hallazgos en la revista Science , incluida la dinámica cambiante de la fama y los casos de censura literaria durante la Segunda Guerra Mundial . [17]

Premios y honores

En 2008, Lieberman Aiden recibió el Premio Estudiantil Lemelson-MIT por su trabajo en el iShoe, destinado a ayudar a las personas mayores con problemas de equilibrio y prevenir caídas que podrían causar lesiones. [18] [19] Al año siguiente, el iShoe fue catalogado como uno de los "20 nuevos avances biotecnológicos que cambiarán la medicina" por Popular Mechanics . [20] Un año después, Lieberman Aiden fue nombrado como uno de los 35 principales innovadores menores de 35 años ( TR35 ) por la revista Technology Review del MIT . [21]

En 2010, la Sociedad Estadounidense de Física le otorgó a Lieberman Aiden el Premio a la Investigación de Tesis Doctoral Destacada en Física Biológica por su tesis titulada "Evolución y el surgimiento de la estructura". [22] Su tesis doctoral también recibió el Premio Hertz a la Tesis. [23] Lieberman Aiden también recibió el Premio al Nuevo Innovador del Director del NIH y fue nombrado, junto con otros 95 investigadores estadounidenses , como destinatario del Premio Presidencial a la Carrera Temprana para Científicos e Ingenieros en 2011. [24]

En 2014, Lieberman Aiden fue considerado académico emérito McNair en el Baylor College of Medicine.

Vida personal

Erez Lieberman se casó con Aviva Presser en 2005; después del matrimonio, tanto el marido como la mujer añadieron a sus apellidos "Aiden", que significa Edén en hebreo y, en gaélico, pequeño fuego. [13] Tienen un hijo llamado Gabriel Galileo, una hija llamada Maayan Amara y otro niño llamado Judah Avraham. [4] [10] Fuera de los intereses científicos, Lieberman Aiden participó en una colaboración de arte moderno con Nicholas Kahn y Richard Selesnick que se exhibió en galerías de Estados Unidos y Europa. [18]

Lieberman Aiden y su esposa fundaron Bears Without Borders, una organización sin fines de lucro que distribuye juguetes de peluche al mundo en desarrollo. [6] [13]

Referencias

  1. ^ ab Erez Lieberman Aiden publicaciones indexadas por Google Scholar
  2. ^ de Erez Lieberman Aiden en el Proyecto de Genealogía Matemática
  3. ^ Karagianis, Liz (2010). "Celebrando la innovación". Spectrvm . MIT . Consultado el 4 de enero de 2013 .
  4. ^ abc Yong, Ed (8 de junio de 2011). "El hombre del Renacimiento: cómo convertirse en científico una y otra vez". Not Exactly Rocket Science (No es exactamente ciencia espacial) . Revista Discover . Consultado el 3 de enero de 2013 .
  5. ^ ab Kaiser, Jocelyn (6 de junio de 2012). "Renaissance Man". Princeton Alumni Weekly . Princeton . Consultado el 4 de enero de 2013 .
  6. ^ ab Barth, Amy (24 de marzo de 2010). "Cinco preguntas para el hombre que puso tres D en el ADN". Revista Discover . Consultado el 4 de enero de 2013 .
  7. ^ Forrest, Sara. "El pionero informático Erez Lieberman explica cómo evoluciona la Web (y el spam)". Computerworld . Archivado desde el original el 2 de marzo de 2007. Consultado el 4 de enero de 2013 .
  8. ^ Lieberman, E.; Hauert, C.; Nowak, MA (2005). "Dinámica evolutiva en grafos". Nature . 433 (7023): 312–316. Bibcode :2005Natur.433..312L. CiteSeerX 10.1.1.398.4515 . doi :10.1038/nature03204. PMID  15662424. S2CID  4386820. 
  9. ^ Lieberman-Aiden, E.; Van Berkum, Países Bajos; Williams, L.; Imakaev, M.; Ragoczy, T.; Contando, A.; Amit, yo; Lajoie, BR; Sabo, PJ; Dorschner, MO; Sandstrom, R.; Bernstein, B.; Bender, MA; Groudine, M.; Gnürke, A.; Stamatoyannopoulos, J .; Mirny, Luisiana; Lander, ES; Dekker, J. (2009). "El mapeo completo de interacciones de largo alcance revela principios plegables del genoma humano". Ciencia . 326 (5950): 289–293. Código Bib : 2009 Ciencia... 326.. 289L. doi : 10.1126/ciencia.1181369. Número de modelo : PMID 19815776  . 
  10. ^ ab Keim, Brandom (20 de agosto de 2012). "El biofísico más conectado del mundo". Wired . Consultado el 29 de enero de 2013 .
  11. ^ ab "Un científico de la UMMS ayuda a descifrar la estructura tridimensional del genoma humano". Focus UMMS . 12 (4). Noviembre de 2009. Archivado desde el original el 26 de enero de 2013 . Consultado el 29 de enero de 2013 .
  12. ^ Rao, SSP; Huntley, MH; Durand, NC; Stamenova, EK; Bochkov, ID; Robinson, JT; Sanborn, AL; Machol, I.; Omer, AD; Lander, ES; Aiden, EL (2014). "Un mapa tridimensional del genoma humano con una resolución de kilobases revela los principios de la formación de bucles en la cromatina". Cell . 159 (7): 1665–1680. doi :10.1016/j.cell.2014.11.021. PMC 5635824 . PMID  25497547. 
  13. ^ abcd Hand, Eric (2011). "Culturomics: juego de palabras". Nature . 474 (7352): 436–440. doi : 10.1038/474436a . PMID  21697925.
  14. ^ Michel, J. -B.; Shen, YK; Aiden, AP; Veres, A.; Gray, MK; Google Books, JP; Pickett, D.; Hoiberg, D.; Clancy, P.; Norvig, J.; Orwant, S.; Pinker, MA; Nowak, EL; Aiden, EL (2011). "Análisis cuantitativo de la cultura utilizando millones de libros digitalizados". Science . 331 (6014): 176–182. Bibcode :2011Sci...331..176M. doi :10.1126/science.1199644. PMC 3279742 . PMID  21163965.  {{cite journal}}: |last6=tiene nombre genérico ( ayuda )
  15. ^ Holmes, Bob (11 de octubre de 2007). «Las 'mutaciones' del lenguaje afectan a las palabras menos utilizadas». New Scientist . Consultado el 4 de enero de 2013 .
  16. ^ Cohen, Patricia (16 de diciembre de 2010). "En 500 mil millones de palabras, una nueva ventana a la cultura". New York Times . Consultado el 7 de enero de 2013 .
  17. ^ Hotz, Robert Lee (17 de diciembre de 2010). "Word-Wide Web Launches". The Wall Street Journal . Consultado el 29 de enero de 2013 .
  18. ^ ab «Erez Lieberman-Aiden: ganador del premio estudiantil Lemelson-MIT 2010». Lemelson-MIT. 2010. Archivado desde el original el 10 de marzo de 2010. Consultado el 4 de enero de 2013 .
  19. ^ ScienceDaily (24 de julio de 2008). ¿Problemas de equilibrio? Póngase el zapato de IS, Science Daily .
  20. ^ Wenner, Melinda (18 de diciembre de 2009). «20 nuevos avances biotecnológicos que cambiarán la medicina». Popular Mechanics . Consultado el 4 de enero de 2013 .
  21. ^ MIT (10 de septiembre de 2009). 2009 Jóvenes innovadores menores de 35 años, Erez Lieberman-Aiden, 29, Universidad de Harvard/MIT., Technology Review .
  22. ^ "Premio a la investigación doctoral destacada en física biológica". American Physical Society. 2010. Consultado el 4 de enero de 2013 .
  23. ^ Fundación Hertz. «Becarios de la Fundación Hertz: Erez Lieberman Aiden». Archivado desde el original el 2 de noviembre de 2014. Consultado el 23 de enero de 2013 .
  24. ^ Oficina del Secretario de Prensa (23 de julio de 2012). "El presidente Obama honra a científicos jóvenes destacados". whitehouse.gov . Consultado el 29 de enero de 2013 , a través de Archivos Nacionales .