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Erez Liberman Aiden

Erez Lieberman Aiden (nacido en 1980, né Erez Lieberman) es un científico investigador estadounidense activo en múltiples campos relacionados con las matemáticas aplicadas . [1] Es profesor asociado en la Facultad de Medicina de Baylor y anteriormente miembro de la Sociedad de becarios de Harvard y miembro visitante del cuerpo docente de Google . Es profesor asistente adjunto de informática en la Universidad Rice . Utilizando enfoques matemáticos y computacionales, ha estudiado la evolución en una variedad de contextos, incluido el de redes a través de la teoría de grafos evolutivos y lenguajes en el campo de la culturómica . Ha publicado artículos científicos en diversas disciplinas.

Lieberman Aiden ha ganado premios como el Premio Estudiantil Lemelson-MIT y el Premio de la Sociedad Estadounidense de Física a la Investigación Destacada de Tesis Doctoral en Física Biológica. En 2009, Lieberman Aiden fue nombrado uno de los 35 principales innovadores menores de 35 años por Technology Review y en 2011 fue uno de los ganadores del Premio Presidencial de Carrera Temprana para Científicos e Ingenieros .

Temprana edad y educación

Lieberman creció en Brooklyn con tres hermanos. Comenzó a programar computadoras a la edad de siete años. [3] Su padre, Aharon Lieberman, era un empresario tecnológico y era dueño de una fábrica en Nueva Jersey . [4] [5] Cuando era niño, Lieberman Aiden hablaba hebreo y húngaro , haciendo del inglés su tercer idioma. [5]

Lieberman Aiden estudió matemáticas, física y filosofía en Princeton y obtuvo una maestría en Historia en la Universidad Yeshiva . Procedió a completar un doctorado conjunto en matemáticas y bioingeniería en la División de Ciencias y Tecnología de la Salud de Harvard-MIT , donde fue asesorado por [2] Eric Lander y Martin Nowak . [6]

Investigación y carrera

Lieberman Aiden contribuyó a la fundación de la teoría de grafos evolutivos junto con su director de doctorado, Martin Nowak . [7] [8] Desde entonces ha estado involucrado en la investigación de la estructura tridimensional del genoma humano y el campo de la culturómica .

El modelo de glóbulo fractal ( izquierda ) de la estructura del genoma tridimensional sugerido por Lieberman Aiden y sus compañeros de trabajo se contrasta con un modelo de equilibrio ( derecha ) (Las imágenes pequeñas muestran secciones transversales)

Estructura del genoma 3D

Lieberman Aiden formó parte de un equipo de científicos de la Facultad de Medicina de la Universidad de Massachusetts y del MIT que sugirió por primera vez que el ADN humano se pliega en un glóbulo fractal en lugar de un glóbulo en equilibrio. [4] Este hallazgo explica cómo el genoma de cada célula puede compactarse fuertemente sin formar un nudo . Lieberman Aiden y sus compañeros inventaron una variante de captura de conformación cromosómica llamada "Hi-C" que produce una medida de probabilidades de contacto en todo el genoma que apunta a una estructura genómica tridimensional. Esta técnica combina la metodología de captura de cromosomas existente con la secuenciación de próxima generación , lo que permite una medición todos contra todos de los contactos de cromatina. [9]

En 2009, este trabajo se publicó en la revista Science y apareció como ilustración de portada. [10] Después de la publicación, se citó a Lieberman Aiden diciendo: [11]

Hace tiempo que sabemos que, a pequeña escala, el ADN es una doble hélice... Pero si la doble hélice no se plegara más, el genoma de cada célula tendría dos metros de largo. Los científicos no han comprendido realmente cómo se pliega la doble hélice para encajar en el núcleo de una célula humana, que tiene sólo una centésima de milímetro de diámetro. Este nuevo enfoque nos permitió sondear exactamente esa cuestión. [11]

En 2014, fue autor principal de un artículo en Cell que describía un método refinado de Hi-C que su equipo utilizó para describir la organización fundamental del ADN. [12]

Erez Lieberman Aiden dando una conferencia sobre culturómica en la Universidad de Harvard en 2011

Culturómica

Lieberman Aiden participó en el análisis de un corpus de alrededor de 5 millones de libros digitalizados, aplicando técnicas de minería de datos para avanzar en el nuevo campo de la culturómica. [13] [14] Leiberman Aiden participó en un proyecto para digitalizar textos anglosajones en 2004, cuyo análisis proporcionó evidencia que respalda la regularización de los verbos, un proceso mediante el cual los verbos irregulares se vuelven cada vez más regulares con el tiempo. [15]

Después del anuncio de Google Books , Lieberman Aiden se acercó al director de investigación de Google, Peter Norvig, y le permitió analizar estadísticamente sus datos. [16] Su trabajo contribuyó a Google Ngram Viewer , lanzado en diciembre de 2010, que utiliza ideas culturómicas para producir tendencias históricas normalizadas para cualquier secuencia de letras. [13] Este proyecto publicó una serie de hallazgos en la revista Science , incluida la dinámica cambiante de la fama y los casos de censura literaria durante la Segunda Guerra Mundial . [17]

Premios y honores

En 2008, Lieberman Aiden recibió el Premio Estudiantil Lemelson-MIT por su trabajo en el iShoe, destinado a ayudar a las personas mayores con problemas de equilibrio y prevenir caídas que podrían causar lesiones. [18] [19] Al año siguiente, Popular Mechanics incluyó el iShoe como uno de los "20 nuevos avances biotecnológicos que cambiarán la medicina" . [20] Un año después, Lieberman Aiden fue nombrado uno de los 35 principales innovadores menores de 35 años ( TR35 ) por la revista Technology Review del MIT . [21]

En 2010, la Sociedad Estadounidense de Física otorgó a Lieberman Aiden el Premio a la Investigación de Tesis Doctoral Sobresaliente en Física Biológica por su tesis titulada "Evolución y surgimiento de la estructura". [22] Su tesis doctoral también recibió el Premio Hertz de Tesis. [23] Lieberman Aiden también recibió el Premio al Nuevo Innovador del Director de los NIH y fue nombrado, junto con otros 95 investigadores estadounidenses , ganador del Premio Presidencial de Carrera Temprana para Científicos e Ingenieros en 2011. [24]

Vida personal

Erez Lieberman se casó con Aviva Presser en 2005; Después del matrimonio, tanto el marido como la mujer añadieron a sus apellidos "Aiden", que significa Edén en hebreo y, en gaélico, pequeño fuego. [13] Tienen un hijo llamado Gabriel Galileo, una hija llamada Maayan Amara y otro niño llamado Judah Avraham. [4] [10] Fuera de los intereses científicos, Lieberman Aiden participó en una colaboración de arte moderno con Nicholas Kahn y Richard Selesnick que se exhibió en galerías de Estados Unidos y Europa. [18]

Lieberman Aiden y su esposa fundaron Bears Without Borders, una organización sin fines de lucro que distribuye juguetes de peluche en el mundo en desarrollo. [6] [13]

Referencias

  1. ^ ab Publicaciones de Erez Lieberman Aiden indexadas por Google Scholar
  2. ^ ab Erez Lieberman Aiden en el Proyecto de Genealogía de Matemáticas
  3. ^ Karagianis, Liz (2010). "Celebrando la innovación". Espectro . MIT . Consultado el 4 de enero de 2013 .
  4. ^ abc Yong, Ed (8 de junio de 2011). "El hombre del Renacimiento: cómo convertirse en científico una y otra vez". "No es exactamente ciencia espacial" . Revista Descubre . Consultado el 3 de enero de 2013 .
  5. ^ ab Kaiser, Jocelyn (6 de junio de 2012). "Hombre del Renacimiento". Semanal de antiguos alumnos de Princeton . Princeton . Consultado el 4 de enero de 2013 .
  6. ^ ab Barth, Amy (24 de marzo de 2010). "Cinco preguntas para el hombre que puso las tres D en el ADN". Revista Descubre . Consultado el 4 de enero de 2013 .
  7. ^ Forrest, Sara. "El pionero computacional Erez Lieberman explica cómo evoluciona la Web y el spam". Mundo de la informática . Archivado desde el original el 2 de marzo de 2007 . Consultado el 4 de enero de 2013 .
  8. ^ Liberman, E.; Hauert, C.; Nowak, MA (2005). "Dinámica evolutiva en gráficos". Naturaleza . 433 (7023): 312–316. Código Bib :2005Natur.433..312L. CiteSeerX 10.1.1.398.4515 . doi : 10.1038/naturaleza03204. PMID  15662424. S2CID  4386820. 
  9. ^ Lieberman-Aiden, E.; Van Berkum, Países Bajos; Williams, L.; Imakaev, M.; Ragoczy, T.; Contando, A.; Amit, yo; Lajoie, BR; Sabo, PJ; Dorschner, MO; Sandstrom, R.; Bernstein, B.; Bender, MA; Groudine, M.; Gnürke, A.; Stamatoyannopoulos, J .; Mirny, Luisiana; Lander, ES; Dekker, J. (2009). "El mapeo completo de interacciones de largo alcance revela principios plegables del genoma humano". Ciencia . 326 (5950): 289–293. Código Bib : 2009 Ciencia... 326.. 289L. doi : 10.1126/ciencia.1181369. PMC 2858594 . PMID  19815776. 
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  11. ^ ab "Un científico de la UMMS ayuda a descifrar la estructura tridimensional del genoma humano". Enfoque UMMS . 12 (4). Noviembre de 2009. Archivado desde el original el 26 de enero de 2013 . Consultado el 29 de enero de 2013 .
  12. ^ Rao, SSP; Huntley, MH; Durand, Carolina del Norte; Stamenova, EK; Bochkov, ID; Robinson, JT; Sanborn, AL; Machol, I.; Omer, AD; Lander, ES; Aiden, EL (2014). "Un mapa 3D del genoma humano con una resolución de kilobase revela los principios del bucle de cromatina". Celúla . 159 (7): 1665-1680. doi :10.1016/j.cell.2014.11.021. PMC 5635824 . PMID  25497547. 
  13. ^ Mano abcd, Eric (2011). "Culturómica: juegos de palabras". Naturaleza . 474 (7352): 436–440. doi : 10.1038/474436a . PMID  21697925.
  14. ^ Michel, J.-B.; Shen, YK; Aiden, AP; Veres, A.; Gris, MK; Libros de Google, JP; Pickett, D.; Hoiberg, D.; Clancy, P.; Norvig, J.; Orwant, S.; Pinker, MA; Nowak, EL; Aiden, EL (2011). "Análisis cuantitativo de la cultura utilizando millones de libros digitalizados". Ciencia . 331 (6014): 176–182. Código Bib : 2011 Ciencia... 331.. 176M. doi : 10.1126/ciencia.1199644. PMC 3279742 . PMID  21163965.  {{cite journal}}: |last6=tiene nombre genérico ( ayuda )
  15. ^ Holmes, Bob (11 de octubre de 2007). "Las 'mutaciones' del lenguaje afectan las palabras menos utilizadas". Científico nuevo . Consultado el 4 de enero de 2013 .
  16. ^ Cohen, Patricia (16 de diciembre de 2010). "En 500 mil millones de palabras, una nueva ventana a la cultura". New York Times . Consultado el 7 de enero de 2013 .
  17. ^ Hotz, Robert Lee (17 de diciembre de 2010). "Lanzamientos de Word-Wide Web". El periodico de Wall Street . Consultado el 29 de enero de 2013 .
  18. ^ ab "Erez Lieberman-Aiden: ganador del premio para estudiantes Lemelson-MIT 2010". Lemelson-MIT. 2010. Archivado desde el original el 10 de marzo de 2010 . Consultado el 4 de enero de 2013 .
  19. ^ ScienceDaily (24 de julio de 2008). ¿Problemas de equilibrio? Ponte el IShoe, Science Daily .
  20. ^ Wenner, Melinda (18 de diciembre de 2009). "20 nuevos avances biotecnológicos que cambiarán la medicina". Mecánica Popular . Consultado el 4 de enero de 2013 .
  21. ^ MIT (10 de septiembre de 2009). 2009 Jóvenes innovadores menores de 35 años, Erez Lieberman-Aiden, 29, Universidad de Harvard/MIT., Technology Review .
  22. ^ "Premio a la Investigación Destacada de Tesis Doctoral en Física Biológica". Sociedad Americana de Física. 2010 . Consultado el 4 de enero de 2013 .
  23. ^ Fundación Hertz. "Becarios de la Fundación Hertz: Erez Lieberman Aiden" . Consultado el 23 de enero de 2013 .
  24. Secretaría de Prensa (23 de julio de 2012). "El presidente Obama honra a científicos destacados que inician su carrera". casablanca.gov . Consultado el 29 de enero de 2013 a través de Archivos Nacionales .