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El logotipo de Entrez

El sistema de búsqueda de bases de datos globales Entrez ( IPA: [ɒnˈtreɪ] ) [1] es un motor de búsqueda federado o portal web que permite a los usuarios buscar en muchas bases de datos de ciencias de la salud discretas en el sitio web del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). [2] El NCBI es parte de la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM), que es a su vez un departamento de los Institutos Nacionales de Salud (NIH), que a su vez es parte del Departamento de Salud y Servicios Humanos de los Estados Unidos . El nombre "Entrez" (un saludo que significa "adelante" en francés) fue elegido para reflejar el espíritu de dar la bienvenida al público a la búsqueda del contenido disponible en el NLM.

Entrez Global Query es un sistema integrado de búsqueda y recuperación que brinda acceso a todas las bases de datos simultáneamente con una única cadena de consulta e interfaz de usuario. Entrez puede recuperar de manera eficiente secuencias , estructuras y referencias relacionadas. El sistema Entrez puede proporcionar vistas de secuencias de genes y proteínas y mapas de cromosomas . Algunos libros de texto también están disponibles en línea a través del sistema Entrez.

Características

La página principal de Entrez proporciona, de forma predeterminada, acceso a la consulta global. Se pueden realizar búsquedas en todas las bases de datos indexadas por Entrez mediante una única cadena de consulta, que admite operadores booleanos y etiquetas de términos de búsqueda para limitar partes de la declaración de búsqueda a campos específicos. Esto devuelve una página de resultados unificada, que muestra la cantidad de resultados de la búsqueda en cada una de las bases de datos, que también están vinculados a los resultados de búsqueda reales para esa base de datos en particular.

Entrez también ofrece una interfaz similar para buscar en cada base de datos en particular y para refinar los resultados de búsqueda. La función Límites permite al usuario limitar una búsqueda, una interfaz de formularios web. La función Historial ofrece una lista numerada de las consultas realizadas recientemente. Se puede hacer referencia a los resultados de consultas anteriores por número y combinarlos mediante operadores booleanos. Los resultados de la búsqueda se pueden guardar temporalmente en un portapapeles. Los usuarios con una cuenta MyNCBI pueden guardar consultas indefinidamente y también elegir que se les envíen por correo electrónico actualizaciones con los nuevos resultados de búsqueda de las consultas guardadas de la mayoría de las bases de datos. Se utiliza ampliamente en el campo de la biotecnología como herramienta de referencia tanto para estudiantes como para profesionales.

Bases de datos

Entrez busca en las siguientes bases de datos:

Acceso

Además de utilizar los formularios del motor de búsqueda para consultar los datos en Entrez, NCBI ofrece las utilidades de programación de Entrez [4] (eUtils) para un acceso más directo a los resultados de la consulta. Se accede a las eUtils publicando URL especialmente creadas en el servidor de NCBI y analizando la respuesta XML. También existía una interfaz SOAP de eUtils que se eliminó en julio de 2015. [5]

Historia

En 1991, Entrez se presentó en formato CD. En 1993, una versión cliente-servidor del software proporcionó conectividad con Internet. En 1994, NCBI creó un sitio web, y Entrez fue parte de este lanzamiento inicial. En 2001, se lanzó Entrez bookshelf y en 2003, se desarrolló la base de datos Entrez Gene. [6]

Referencias

  1. ^ "Definición de 'entrez'". Diccionario Collins [Internet] .
  2. ^ Coordinadores de recursos del NCBI (2012). "Recursos de la base de datos del Centro Nacional de Información Biotecnológica". Nucleic Acids Research . 41 (número de la base de datos): D8–D20. doi :10.1093/nar/gks1189. PMC 3531099 . PMID  23193264. 
  3. ^ "Inicio - Gen - NCBI".
  4. ^ Entrez Utilities. Centro Nacional de Información Biotecnológica (EE. UU.). 2010.
  5. ^ El servicio web de utilidad electrónica (SOAP). Centro Nacional de Información Biotecnológica (EE. UU.). 23 de enero de 2015.
  6. ^ Smith, Kent. "Una breve historia de la formación y el crecimiento del NCBI". The NCBI Handbook [Internet]. 2.ª edición . Consultado el 3 de mayo de 2014 .

Enlaces externos