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Emma Schymanski

Emma Schymanski, 2022

Emma Schymanski (nacida Emma Craven ) es una química conocida por su trabajo en la identificación de compuestos orgánicos desconocidos, en particular contaminantes, y defensora de la ciencia abierta.

Educación y carrera

Schymanski se graduó con una licenciatura. en Química y una Licenciatura en Ingeniería Ambiental de la Universidad de Australia Occidental en 2003. [1] Mientras estaba en la Universidad de Australia Occidental, Schymanski combinó química e ingeniería ambiental para estudiar sitios contaminados que requerían evaluación y remediación. [1] Como estudiante, participó en la conferencia del Premio Nobel de 2002 que reúne a premios Nobel y jóvenes científicos; Schymanski y Pia Sappl fueron los primeros estudiantes de la Universidad de Australia Occidental en recibir esta invitación y posiblemente los primeros australianos. [2]

Después de la universidad, Schymanski pasó tres años en Golder Associates en Perth como ingeniera ambiental [3] y luego se unió al Centro Helmholtz de Investigación Ambiental en Leipzig, Alemania, donde terminó su doctorado. en 2011. [3] El puesto postdoctoral posterior de Schymanski fue en el Instituto Federal Suizo de Ciencia y Tecnología Acuáticas (Eawag), incluida una beca postdoctoral intraeuropea Marie Curie. [3] Schymanski es actualmente profesora asociada en la Universidad de Luxemburgo , donde dirige el Grupo de Química Ambiental. [4]

En 2021, Schymanski fue entrevistada por el artículo de la Metabolomics Society en MetaboNews y durante la entrevista describe su introducción al campo de la metabolómica , las fortalezas actuales del campo y las posibles aplicaciones futuras de la investigación en metabolómica. [5]

Investigación

Las primeras publicaciones de investigación de Schymanski fueron de su trabajo universitario cuando trabajó en el desarrollo de nuevos polímeros que contienen metales, lo que resultó en tres publicaciones de autor principal. [6] [7] [8]

Como estudiante de posgrado, Schymanski comenzó a utilizar información sobre el patrón de fragmentación de compuestos orgánicos como medio para ampliar la identificación de compuestos desconocidos. [9] Schymanski aplicó estos nuevos métodos a la identificación de compuestos orgánicos desconocidos que se encuentran en aguas residuales, [10] y utilizó datos recopilados colectivamente por la Asociación NORMAN para definir barreras para la identificación de compuestos orgánicos desconocidos en el agua. [11] La identificación y el seguimiento de compuestos orgánicos desconocidos sigue siendo una vía de investigación seguida por Schymanski [12] y es coautora de un libro de texto de 2014 que describe estos métodos. [13]

En 2012, Schymanski y Steffen Neumann iniciaron el concurso de Evaluación Crítica de Identificación de Moléculas Pequeñas (CASMI), que proporcionó a los investigadores información sobre compuestos orgánicos desconocidos y los desafió a utilizar herramientas computacionales automatizadas para identificar los compuestos desconocidos. [14] [15] La Sociedad de Metabolómica destacó el concurso de 2012 en su boletín. [16] Ha habido múltiples iteraciones del concurso, y Schymanski examinó los resultados del concurso de 2016. [17]

La investigación de Schymanski se centra en la caracterización de los compuestos orgánicos que se encuentran en las aguas residuales [10] [18] y la exposómica, o la ciencia de los compuestos a los que las personas están expuestas a lo largo de su vida. [19] Schymanski ha desarrollado un subconjunto de PubChem para exposómica, PubChemLite, que puede anotarse para aumentar la capacidad de los investigadores para identificar compuestos ambientales desconocidos. [20] Dentro de este campo, Schymanski está trabajando para automatizar la identificación de un grupo de compuestos fluorados llamados ' sustancias perfluoroalquiladas y polifluoroalquiladas ' (PFAS) con el fin de aumentar la capacidad de los investigadores para encontrar PFAS desconocidos en el medio ambiente. [21]

Schymanski es un defensor de la ciencia abierta y el intercambio de datos. Dentro de la red NORMAN, una actividad de colaboración en Europa, América del Norte y Asia, Schymanski trabajó en 2011 con el equipo que estableció NORMAN MassBank, [22] [23], que era un proyecto impulsado por la comunidad para recopilar información sobre moléculas pequeñas. En 2015, Schymanski amplió este tipo de datos con NORMAN Suspect List Exchange. [24] Schymanski también ha trabajado para desarrollar herramientas computacionales que permitan el procesamiento de datos complejos de espectrometría de masas de alta resolución [25] y buscó establecer estándares para considerar la calidad de los datos de espectrometría de masas. [26] La publicación de Schymanski de 2014 en Environmental Science & Technology [27] establece un medio para estimar la confianza en la calidad de las identificaciones de compuestos orgánicos desconocidos y, a partir de 2021, tiene más de 1000 citas. En 2018, Schymanski consideró este artículo su mayor logro porque estableció el estándar para la identificación de compuestos en metabolómica y alentó la conversación comunitaria sobre el futuro de estas herramientas. [28]

Publicaciones destacadas

Premios

Vida personal

Schymanski está casada con Stan Schymanski, un ecohidrólogo. [34] y ha compartido su visión sobre las parejas con doble carrera y su camino hacia puestos en Luxemburgo. [35] Son la primera pareja de doble carrera en recibir el premio FNR ATTRACT. [32]

Publicaciones

  1. ^ ab "Carreras físicas de vida y ciencias" (PDF) . Universidad de Australia Occidental .
  2. «Dos de nuestros mejores se unen a los mejores del mundo» (PDF) . UWAnoticias . vol. 21, núm. 10. 29 de julio de 2002.
  3. ^ abc "¿Qué hay en nuestra agua? Identificación de contaminantes orgánicos" conocidos "y" desconocidos " - EPFL". recuerdo.epfl.ch . Consultado el 21 de mayo de 2021 .
  4. ^ Luxemburgo, Université du. "Emma Schymanski". Universidad de Luxemburgo . Consultado el 21 de mayo de 2021 .
  5. ^ "Entrevista Metabo | Dra. Emma Schymanski" (PDF) . MetaboNoticias . vol. 11, núm. 3. marzo de 2021.
  6. ^ Cobarde, Emma; Abu-Shandi, Khalid; Janiak, Christoph (2003). "Correlación entre la solución y el estado sólido: la composición dependiente del pH en el sistema ternario [Co (H2O) 6] 2+ o [Ni (H2O) 6] 2+/piperazina/fosfato". Zeitschrift für anorganische und allgemeine Chemie . 629 (2): 195-201. doi :10.1002/zaac.200390031. ISSN  1521-3749.
  7. ^ Cobarde, Emma; Zhang, Cungen; Janiak, Christoph; Rheinwald, Gerd; Lang, Heinrich (2003). "Síntesis, estructura y química de la solución de (5, 5′-dimetil-2, 2′-bipiridina) (IDA) cobre (II) y comparación estructural con Aqua (IDA) (1, 10-fenantrolina) cobre (II) ( IDA = iminodiacetato)". Zeitschrift für anorganische und allgemeine Chemie (en alemán). 629 (1213): 2282–2290. doi :10.1002/zaac.200300223. ISSN  0044-2313.
  8. ^ Cobarde, Emma; Mutlu, Esra; Lundberg, Daniel; Temizdemir, Savaş; Dechert, Sebastián; Brombacher, Horst; Janiak, Christoph (2002). "Complejos de talio (I) con ligandos de poli (pirazolil) borato modificado: coordinación metal-ligando y empaquetamiento de cristales". Poliedro . 21 (5–6): 553–562. doi :10.1016/S0277-5387(01)01026-9.
  9. ^ Schymanski, EL; Meinert, C.; Meringer, M.; Brack, W. (19 de mayo de 2008). "El uso de clasificadores de MS y generación de estructuras para ayudar en la identificación de incógnitas en el análisis dirigido a efectos". Analytica Chimica Acta . 615 (2): 136-147. Código Bib : 2008AcAC..615..136S. doi :10.1016/j.aca.2008.03.060. ISSN  0003-2670. PMID  18442519.
  10. ^ ab Schymanski, Emma L.; Cantante, Heinz P.; Longrée, Philipp; Loos, Martín; Ruff, Matías; Stravs, Michael A.; Ripollés Vidal, Cristina; Hollender, Juliane (4 de febrero de 2014). "Estrategias para caracterizar la contaminación orgánica polar en aguas residuales: exploración de la capacidad de la espectrometría de masas de alta resolución". Ciencia y tecnología ambientales . 48 (3): 1811–1818. Código Bib : 2014EnST...48.1811S. doi :10.1021/es4044374. ISSN  0013-936X. PMID  24417318.
  11. ^ Schymanski, Emma L.; Cantante, Heinz P.; Slobodnik, Jaroslav; Ipolyi, Ildiko M.; Osvaldo, Peter; Krauss, Martín; Schulze, Tobías; Haglund, Peter; Letzel, Thomas; Grosse, Sylvia; Thomaidis, Nikolaos S. (1 de agosto de 2015). "Cribado de objetos no objetivo con espectrometría de masas de alta resolución: revisión crítica mediante un ensayo colaborativo sobre análisis de agua". Química Analítica y Bioanalítica . 407 (21): 6237–6255. doi :10.1007/s00216-015-8681-7. hdl : 10234/147867 . ISSN  1618-2650. PMID  25976391. S2CID  29696368.
  12. ^ Escher, Beate I.; Stapleton, Heather M.; Schymanski, Emma L. (24 de enero de 2020). "Seguimiento de mezclas complejas de sustancias químicas en nuestro entorno cambiante". Ciencia . 367 (6476): 388–392. Código Bib : 2020 Ciencia... 367.. 388E. doi : 10.1126/ciencia.aay6636. ISSN  0036-8075. PMC 7153918 . PMID  31974244. 
  13. ^ Kerber, Adalberto (2014). Química matemática y quimioinformática: generación de estructuras, elucidación y relaciones cuantitativas estructura-propiedad. Reinhard Laue, Markus Meringer, Christoph Rücker, Emma Schymanski. Berlina. ISBN 978-3-11-025407-5. OCLC  865012006.{{cite book}}: Mantenimiento CS1: falta el editor de la ubicación ( enlace )
  14. ^ Schymanski, Emma; Neumann, Steffen (25 de junio de 2013). "La evaluación crítica de la identificación de moléculas pequeñas (CASMI): desafíos y soluciones". Metabolitos . 3 (3): 517–538. doi : 10.3390/metabo3030517 . ISSN  2218-1989. PMC 3901296 . PMID  24958137. 
  15. ^ Schymanski, Emma; Neumann, Steffen (24 de mayo de 2013). «CASMI: Y el Ganador es. .». Metabolitos . 3 (2): 412–439. doi : 10.3390/metabo3020412 . ISSN  2218-1989. PMC 3901266 . PMID  24957999. 
  16. ^ Forsythe, Ian (octubre de 2012). "Evaluación crítica de la identificación de moléculas pequeñas: una nueva serie de concursos". www.metabonews.ca . Consultado el 23 de mayo de 2021 .
  17. ^ Schymanski, Emma L.; Ruttkies, Christoph; Krauss, Martín; Brouard, Céline; Amable, Tobías; Dührkop, Kai; Allen, Felicidad; Vaniya, Arpana; Verdegem, seco; Böcker, Sebastián; Rousu, Juho (2017). "Evaluación crítica de la identificación de moléculas pequeñas 2016: métodos automatizados". Revista de quimioinformática . 9 (1): 22. doi : 10.1186/s13321-017-0207-1 . ISSN  1758-2946. PMC 5368104 . PMID  29086042. 
  18. ^ Gago-Ferrero, Pablo; Schymanski, Emma L.; Bletsou, Anna A.; Aalizadeh, Reza; Hollender, Juliane; Thomaidis, Nikolaos S. (20 de octubre de 2015). "Estrategias ampliadas sospechosas y no objetivo para caracterizar contaminantes orgánicos polares emergentes en aguas residuales sin tratar con LC-HRMS/MS". Ciencia y tecnología ambientales . 49 (20): 12333–12341. Código Bib : 2015EnST...4912333G. doi : 10.1021/acs.est.5b03454. hdl : 10795/3064 . ISSN  0013-936X. PMID  26418421.
  19. ^ Vermeulen, Roel; Schymanski, Emma L.; Barabási, Albert-László; Miller, Gary W. (24 de enero de 2020). "El exposoma y la salud: donde la química se encuentra con la biología". Ciencia . 367 (6476): 392–396. Código Bib : 2020 Ciencia... 367.. 392V. doi : 10.1126/ciencia.aay3164. ISSN  0036-8075. PMC 7227413 . PMID  31974245. 
  20. ^ Schymanski, Emma L.; Kondić, Todor; Neumann, Steffen; Thiessen, Paul A.; Zhang, Jian; Bolton, Evan E. (8 de marzo de 2021). "Potenciar grandes bases de conocimientos químicos para la exposómica: PubChemLite se encuentra con MetFrag". Revista de quimioinformática . 13 (1): 19. doi : 10.1186/s13321-021-00489-0 . ISSN  1758-2946. PMC 7938590 . PMID  33685519. 
  21. ^ Lim, XiaoZhi (6 de febrero de 2019). "Agua contaminada: los científicos rastrean miles de sustancias químicas fluoradas en nuestro medio ambiente". Naturaleza . 566 (7742): 26–29. Código Bib :2019Natur.566...26L. doi : 10.1038/d41586-019-00441-1 . PMID  30728524. S2CID  59615914.
  22. ^ Schulze, Tobías; Schymanski, Emma; Stravs, Michael; Neumann, Steffen; Krauss, Martín; Cantante, Heinz; Abrazo, Cristina; Gallampois, Christine; Hollender, Juliane; Slobodnik, Jaroslav; Brack, Werner (abril de 2011), NORMAN MassBank Hacia una base de datos espectral de masas precisa, de acceso abierto, impulsada por la comunidad para la identificación de contaminantes emergentes (PDF) , NORMAN Network Bulletin, págs.
  23. ^ "Informe Anual 2016 de la Junta de ETH". 2016.
  24. ^ Red NORMAN; Aalizadeh, Reza; Alygizakis, Nikiforos; Schymanski, Emma; Slobodnik, Jaroslav; Fischer, Stellan; Cirka, Lubos (23 de febrero de 2021), "Detección de sospechosos", S0 | SUSDAT | Lista de sospechosos de NORMAN fusionada: SusDat , doi :10.5281/zenodo.2664077 , consultado el 22 de mayo de 2021
  25. ^ Stravs, Michael A.; Schymanski, Emma L.; Cantante, Heinz P.; Hollender, Juliane (2013). "Recalibración y procesamiento automático de espectros de masas en tándem mediante anotación de fórmulas". Revista de espectrometría de masas . 48 (1): 89–99. Código Bib : 2013JMSp...48...89S. doi :10.1002/jms.3131. ISSN  1096-9888. PMID  23303751.
  26. ^ Oberacher, Herbert; Sasse, Michael; Antignac, Jean-Philippe; Guitton, Yann; Debrauwer, Laurent; Jamin, Emilien L.; Schulze, Tobías; Krauss, Martín; Covaci, Adrián; Caballero-Casero, Noelia; Rousseau, Kathleen; Damont, Annelaure; Fenaille, François; Lamoree, Marja; Schymanski, Emma L. (2020). "Una propuesta europea para el control y garantía de calidad de bibliotecas de espectros de masas en tándem". Ciencias Ambientales Europa . 32 (1): 43. doi : 10.1186/s12302-020-00314-9 . hdl : 10067/1676870151162165141 . ISSN  2190-4707. S2CID  212691912.
  27. ^ Schymanski, Emma L.; Jeon, Junho; Gulde, Rebekka; Fenner, Kathrin; Ruff, Matías; Cantante, Heinz P.; Hollender, Juliane (18 de febrero de 2014). "Identificación de moléculas pequeñas mediante espectrometría de masas de alta resolución: comunicar confianza". Ciencia y tecnología ambientales . 48 (4): 2097–2098. Código Bib : 2014EnST...48.2097S. doi :10.1021/es5002105. ISSN  0013-936X. PMID  24476540.
  28. ^ ab "La lista de poder 2018: Emma Schymanski". El científico analítico . 2018 . Consultado el 21 de mayo de 2021 .
  29. ^ https://www.rswa.org.au/awards/student%20medalists/Student%20Medallists%201998%20to%202006.pdf. {{cite web}}: Falta o está vacío |title=( ayuda )
  30. ^ administrador (19 de noviembre de 2019). "Ganadores anteriores de premios de Europa". Premios SETAC . Consultado el 21 de mayo de 2021 .
  31. ^ "Quimioinformática ambiental para identificar sustancias químicas desconocidas y sus efectos". FNR – Fondo Nacional de Investigación de Luxemburgo . 13 de diciembre de 2018 . Consultado el 21 de mayo de 2021 .
  32. ^ ab Luxemburgo, Université du. "Emma Schymanski recibió la beca FNR ATTRACT". Universidad de Luxemburgo . Consultado el 21 de mayo de 2021 .
  33. ^ "Emma Schymanski recibió la beca FNR ATTRACT". FNR – Fondo Nacional de Investigación de Luxemburgo . 17 de octubre de 2018 . Consultado el 20 de mayo de 2021 .
  34. ^ "CONOCE UNA HOJA: STAN Schymanski". Ecohidrología AGU . Consultado el 21 de mayo de 2021 .
  35. ^ "Becarios FNR ATTRACT: las personas detrás de la ciencia: Stan Schymanski". FNR – Fondo Nacional de Investigación de Luxemburgo . 22 de noviembre de 2018 . Consultado el 22 de mayo de 2021 .

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