La Revolución de Emden del 18 de marzo de 1595 marcó el comienzo del estatus de Emden como ciudad-estado cuasi autónoma .
En 1595, después de que el conde Edzard II aumentara varias veces la carga fiscal y aprobara nuevas leyes, sin tener en cuenta su efecto sobre los ciudadanos de Emden, los ciudadanos se rebelaron. Destituyeron al ayuntamiento, que Edzard II había nombrado, y ocuparon el castillo del conde. Edzard II se vio obligado a trasladar su residencia a Aurich . Según los términos del Tratado de Delfzijl del 15 de julio de 1595, Edzard tuvo que renunciar a la mayoría de sus derechos en Emden.
A finales del siglo XVI, Emden acogió a muchos refugiados calvinistas de los Países Bajos españoles y se convirtió en una importante ciudad portuaria de importancia europea, principalmente porque las fuerzas beligerantes holandesas y españolas bloquearon los puertos de la otra. Emden se convirtió en un importante punto de transbordo para las importaciones de grano a Westfalia . Al mismo tiempo, la integración de los refugiados calvinistas marcó económica y religiosamente a la sociedad de Frisia Oriental.
Tras la tregua de 1609 entre España y los Países Bajos rebeldes, se levantaron los bloqueos portuarios y muchos refugiados regresaron a sus hogares, lo que provocó una depresión económica en Emden.
Al mismo tiempo, surgieron tensiones entre la ciudad frisia oriental de Emden y el conde Edzard II . La verdadera razón fue la imposición de impuestos arbitrarios por parte del conde. Como sucede a menudo en la historia, las tensiones estallaron en un verdadero conflicto religioso. La madre de Edzard, Anna, había abolido la primogenitura en 1558 y decretó que el gobierno del condado debía ser dirigido conjuntamente por sus tres hijos, Edzard, Christopher y John. El objetivo de este decreto era probablemente frenar la influencia de la Casa de Vasa en el condado. Esta influencia se basaba en el matrimonio entre su hijo mayor, Edzard, y Catalina Vasa , la hija mayor del rey Gustavo I de Suecia . Esto llevó a una división religiosa en el condado, ya que John, como su madre y la mayoría de los ciudadanos de Emden, era calvinista , mientras que Edzard era luterano .
El conde Juan era muy popular en la ciudad, porque era un destacado defensor de la Iglesia Reformada en la familia Countly. Las cosas cambiaron después de la muerte de Juan en 1591. Menso Alting , el vicario reformado de la Gran Iglesia de Emden, se convirtió en uno de los principales oponentes de las ambiciones de poder del conde Edzard II. Menso Alting tuvo una gran influencia en la implantación del calvinismo en Emden. Trató de crear una Unión Protestante en el espíritu del calvinismo militante como defensa contra la Contrarrevolución . Esto lo involucró en el conflicto entre los Países Bajos y España, así como en el conflicto entre los Estados de Frisia Oriental y los condes luteranos Edzard II y Enno III . Menso Alting utilizó astutamente un aumento de impuestos por parte de Edzard II para incitar a la población de Emden a la acción contra Edzard II. Edzard II entonces pidió ayuda al Emperador. El 21 de enero de 1594, el Emperador emitió un decreto contra los Estados de Frisia Oriental y contra algunos ciudadanos de Emden, en el que se les pedía:
Este llamamiento del emperador animó a los ciudadanos de Emden a rechazar la autoridad del conde, que evidentemente había perdido su autoridad, y esto desencadenó la revolución.
El 18 de marzo de 1595, se reunió mucha gente en la Gran Iglesia de Emden. El Menso Alting los animó con un sermón. A continuación, Gerhard Bolardus, miembro del colegio de los cuarenta, pronunció un apasionado discurso en el que pidió el derrocamiento del conde. Se repartieron armas y la multitud se dirigió al ayuntamiento. Ocuparon las murallas de la ciudad y varios puntos estratégicos de la misma. Siguiendo el ejemplo de otras ciudades, se crearon 21 compañías civiles (que luego se convirtieron en 23). Cada compañía estaba dirigida por un capitán, un teniente y un alférez. Estos 21 capitanes y los cuatro intendentes del distrito de Emden formaron la "Cámara de la Guerra Civil". Así nació la milicia de Emden.
Alarmado por las noticias de Emden, Edzard II envió a su secretario a la ciudad para tantear el terreno. Alentados por la aparente falta de poder de Edzard, los ciudadanos destituyeron al alcalde del conde el 24 de marzo de 1595. El colegio de cuarenta elegidos por los ciudadanos tomó el poder y nombró a cuatro nuevos alcaldes y ocho concejales. Edzard envió entonces a su canciller a La Haya para preguntar a las autoridades holandesas cuál era su postura en el conflicto. El 2 de abril de 1595, los holandeses se ofrecieron a mediar. Mientras tanto, el conflicto se intensificó en la península de Frisia Oriental. El 2 de abril, los ciudadanos asaltaron el castillo de Emden y demolieron parte del castillo del lado de la ciudad. Esto obligó a Edzard a trasladar su residencia a Aurich . Los barcos de Emden recibieron órdenes de vigilar los movimientos de tropas en la zona y atacar los barcos de Edzard si era necesario. La reacción de Edzard mostró su falta de poder. Ofreció a los Estados Generales unirse a los Países Bajos como su octava provincia a cambio de apoyo militar. Estacionó tropas en la península de Knock, al oeste de Emden, y les ordenó disparar a los barcos que pasaran.
Los ciudadanos de Emden pidieron ayuda a los Estados Generales, que enviaron un refuerzo de 1.000 hombres a la ciudad. El conde no vio otra opción que iniciar negociaciones con la ciudad. El 7 de noviembre de 1595, la ciudad, el conde y los Estados firmaron un tratado de paz en Delfzijl .
Esta paz no duró mucho tiempo. Las tensiones volvieron a aumentar y en 1600 estalló la guerra civil entre la ciudad de Emden y los Estados Generales por un lado, y el conde Enno III y las zonas rurales del condado por el otro. El 4 de octubre de 1602 comenzó una batalla cerca del cantero de Logum, que Enno había construido. La batalla duró hasta el 14 de octubre y la ganó la ciudad. Como la batalla había demostrado claramente las relaciones de poder en Frisia Oriental , Enno III se escondió hasta febrero de 1603. Mientras estuvo escondido, la ciudad mantuvo la soberanía sobre Frisia Oriental y recaudó impuestos.
En febrero de 1603, Enno III se presentó en La Haya. La ciudad de Emden envió entonces representantes a los Estados Generales para llevar a cabo negociaciones, que condujeron al Acuerdo de La Haya del 8 de abril de 1603. El acuerdo confirmó la anexión por parte de Emden de sus suburbios. La ciudad recibió soberanía fiscal con los límites de la ciudad, y el magistrado de la ciudad pasó a ser soberano en asuntos militares. Esto significó que la ciudad se convirtió de facto en una ciudad imperial libre . La ciudad tendría una guarnición permanente de 600 a 700 hombres, financiada por los estados de Frisia Oriental. El comandante de esta guarnición sería un holandés, que no había servido anteriormente ni al conde ni a la ciudad de Emden.
Se trataba de negociaciones desiguales. Enno III sólo participó porque los Estados Generales amenazaron con la guerra si no lo hacía. Tras dudar un tiempo, firmó el acuerdo el 8 de abril de 1603.
La revolución liberó a Emden del reinado de la familia Cirksena . Emden se convirtió en un "satélite" de los Países Bajos y, de hecho, en una ciudad imperial libre. La ciudad estaba orgullosa de este estatus y, a partir de entonces, firmó todas sus publicaciones oficiales con SPQE ("Senado y Pueblo de Emden"), según el modelo romano . La ciudad y la parte suroccidental reformada de Frisia Oriental establecieron estrechos vínculos con la iglesia calvinista de los Países Bajos. Durante el siglo XVII, el holandés fue la lengua elegida por los ciudadanos principales de Emden.
Sin embargo, la ciudad ya había comenzado a decaer. La tolerancia en materia de fe había desaparecido y el Tratado de Greetsiel estipulaba que en Emden sólo se podía enseñar la religión reformada. La actividad en el puerto había decaído y sólo en 1800 volvería a alcanzar niveles comparables a los de la década de 1670.