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Ordenación (estadísticas)

El análisis de ordenación o gradiente , en el análisis multivariado , es un método complementario al agrupamiento de datos y se utiliza principalmente en el análisis exploratorio de datos (más que en la prueba de hipótesis ). A diferencia del análisis de conglomerados, la ordenación ordena cantidades en un espacio latente (generalmente de dimensiones inferiores). En el espacio de ordenación, las cantidades cercanas entre sí comparten atributos (es decir, son similares hasta cierto punto) y los objetos diferentes están más alejados entre sí. Estas relaciones entre los objetos, en cada uno de varios ejes o variables latentes , se caracterizan luego numérica y/o gráficamente en un biplot .

El primer método de ordenación, el análisis de componentes principales , fue sugerido por Karl Pearson en 1901.

Métodos

Los métodos de ordenación se pueden clasificar en términos generales en métodos basados ​​en vectores propios, algoritmos o modelos. Muchas técnicas de ordenación clásicas, incluido el análisis de componentes principales, el análisis de correspondencia (CA) y sus derivados ( análisis de correspondencia sin tendencia , análisis de correspondencia canónica y análisis de redundancia , pertenecen al primer grupo).

El segundo grupo incluye algunos métodos basados ​​en la distancia, como el escalado multidimensional no métrico , y métodos de aprendizaje automático, como la incrustación de vecinos estocásticos distribuidos en T y la reducción de dimensionalidad no lineal .

El tercer grupo incluye métodos de ordenación basados ​​en modelos, que pueden considerarse como extensiones multivariadas de los modelos lineales generalizados . [1] [2] [3] [4] Los métodos de ordenación basados ​​en modelos son más flexibles en su aplicación que los métodos de ordenación clásicos, de modo que es posible, por ejemplo, incluir efectos aleatorios. [5] A diferencia de los dos grupos antes mencionados, no existe una medida de distancia (implícita o explícita) en la ordenación. En cambio, es necesario especificar una distribución para las respuestas, como es típico en los modelos estadísticos. Estos y otros supuestos, como la supuesta relación media-varianza, pueden validarse con el uso de diagnósticos residuales, a diferencia de otros métodos de ordenación.

Aplicaciones

La ordenación se puede utilizar en el análisis de cualquier conjunto de objetos multivariados. Se utiliza con frecuencia en varias ciencias ambientales o ecológicas, particularmente en ecología de comunidades vegetales . También se utiliza en genética y biología de sistemas para análisis de datos de microarrays y en psicometría .

Ver también

Referencias

  1. ^ Hui, Francisco KC; Taskinen, Sara; Promesa, Shirley; Foster, Scott D.; Warton, David I. (2015). O'Hara, Robert B. (ed.). "Enfoques basados ​​en modelos para la ordenación sin restricciones". Métodos en Ecología y Evolución . 6 (4): 399–411. doi : 10.1111/2041-210X.12236 . ISSN  2041-210X. S2CID  62624917.
  2. ^ Warton, David I.; Blanchet, F. Guillaume; O'Hara, Robert B.; Ovaskainen, Otso; Taskinen, Sara; Walker, Steven C.; Hui, Francis KC (1 de diciembre de 2015). "Tantas variables: modelado conjunto en ecología comunitaria". Tendencias en ecología y evolución . 30 (12): 766–779. doi : 10.1016/j.tree.2015.09.007. ISSN  0169-5347. PMID  26519235.
  3. ^ Sí, Thomas W. (2004). "Una nueva técnica para la ordenación gaussiana canónica de máxima verosimilitud". Monografías Ecológicas . 74 (4): 685–701. doi :10.1890/03-0078. ISSN  0012-9615.
  4. ^ Hawinkel, Stijn; Kerckhof, Frederiek-Maarten; Bijnens, Luc; Así, Olivier (13 de febrero de 2019). "Un marco unificado para la ordenación restringida y sin restricciones de datos de recuento de lecturas de microbiomas". MÁS UNO . 14 (2): e0205474. doi : 10.1371/journal.pone.0205474 . ISSN  1932-6203. PMC 6373939 . PMID  30759084. 
  5. ^ van der Veen, Bert; Hui, Francisco KC; Hovstad, Knut A.; O'Hara, Robert B. (2023). "Ordenación concurrente: modelado de variables latentes restringidas y sin restricciones simultáneamente". Métodos en Ecología y Evolución . 14 (2): 683–695. doi : 10.1111/2041-210X.14035 . hdl : 11250/3050891 . ISSN  2041-210X.

Otras lecturas

enlaces externos

  1. General
    • http://ordination.okstate.edu/ La página web de ordenación: métodos de ordenación para ecologistas
    • https://www.davidzeleny.net/anadat-r/doku.php/es:start
    • https://link.springer.com/article/10.1007/s11192-015-1744-x
  2. Técnicas específicas
    • http://www.statsoft.com/textbook/stcoran.html
    • http://www.statsoft.com/textbook/stmulsca.html
    • http://www.statsoft.com/textbook/glosfra.html
    • https://link.springer.com/article/10.1007/s11192-015-1744-x Método de ordenación de artículos, utilizando año de publicación, factor de impacto y número de citas.
  3. Software
    • http://home.centurytel.net/~mjm/pcordwin.htm
    • http://www.microcomputerpower.com/catalog/canoco.html
    • http://www.brodgar.com
    • http://www.VisuMap.com
    • https://cran.r-project.org/web/packages/vegan/vegan.pdf Paquete R para métodos de ordenación clásicos
    • https://cran.r-project.org/package=seriation Paquete R para ordenar objetos
    • https://cran.r-project.org/web/packages/gllvm/index.html Paquete R para ordenación basada en modelos
    • https://cran.r-project.org/web/packages/VGAM/index.html Paquete R para ordenación basada en modelos
    • https://cran.r-project.org/web/packages/boral/index.html Paquete R para ordenación basada en modelos