El recurso de información sobre Arabidopsis ( TAIR ) es un recurso comunitario y una base de datos en línea de organismos modelo con datos genéticos y de biología molecular para la planta modelo Arabidopsis thaliana , comúnmente conocida como berro oreja de ratón. [1]
TAIR integra información sobre el genoma, los genes, los productos genéticos, las variantes naturales, los alelos mutantes y los fenotipos de las plantas de Arabidopsis, así como sobre la literatura de investigación. Los datos de TAIR se pueden recuperar mediante búsquedas simples y avanzadas, herramientas de descarga y consulta masiva, y en colecciones de archivos de texto preparados. El genoma y las anotaciones de Arabidopsis se pueden visualizar mediante las herramientas interactivas SeqViewer y GBrowse. Los biocuradores de TAIR son responsables de adquirir e integrar datos de la literatura de investigación (anotación funcional) [2] , así como de ayudar a la comunidad a utilizar los datos y las herramientas de Arabidopsis. TAIR colabora con el Consorcio de Recursos Biológicos de Arabidopsis [3] (ABRC) para permitir a los investigadores buscar, explorar y solicitar semillas y reservas de ADN. La misión del ABRC es adquirir, preservar y distribuir semillas y recursos de ADN que sean útiles para la comunidad de investigación de Arabidopsis. La comunidad de TAIR incluye más de 28.000 usuarios registrados [4] y el sitio web atrae a unos 60.000 visitantes únicos por mes. [5]
TAIR está ubicado en Phoenix Bioinformatics, [6] y se financia mediante suscripciones. [7]
Desde su creación en 1999 hasta 2013, TAIR fue financiado principalmente por la National Science Foundation (subvención n.º DBI-0850219). En respuesta al fin de la financiación de la NSF, un grupo central del personal de TAIR fundó la organización sin fines de lucro Phoenix Bioinformatics [6] con el objetivo de encontrar soluciones creativas para la sostenibilidad de las bases de datos. En septiembre de 2013, con el apoyo de Phoenix, TAIR pasó a recibir ingresos por suscripción. Las tarifas de suscripción se utilizan para financiar la conservación continua de datos y las mejoras de la base de datos y las herramientas de TAIR. TAIR ofrece una variedad de opciones de suscripción para acceder al recurso completo y actualizado. [8]
Para garantizar el mayor acceso posible de la comunidad a los datos y promover su reutilización, los datos de TAIR solo para suscriptores se ponen a disposición del público un año después de su publicación inicial en el sitio de TAIR. [9]