Drosha es una enzima ribonucleasa III de clase 2 [5] que en los humanos está codificada por el gen DROSHA (anteriormente RNASEN ) . [6] [7] [8] Es la nucleasa primaria que ejecuta el paso de iniciación del procesamiento de miRNA en el núcleo. Trabaja en estrecha colaboración con DGCR8 y en correlación con Dicer . Se ha encontrado que es importante en el conocimiento clínico para el pronóstico del cáncer. [9] y la replicación del VIH-1. [10]
Historia
La Drosha humana fue clonada en el año 2000, cuando se la identificó como una ribonucleasa nuclear de dsRNA involucrada en el procesamiento de los precursores del ARN ribosómico . [11] Las otras dos enzimas humanas que participan en el procesamiento y la actividad del miRNA son las proteínas Dicer y Argonaute . Recientemente, se ha descubierto que proteínas como la Drosha son importantes en el pronóstico del cáncer [9] y en la replicación del VIH-1. [10]
Los microARN así generados son moléculas de ARN cortas que regulan una amplia variedad de otros genes al interactuar con el complejo de silenciamiento inducido por ARN (RISC) para inducir la escisión del ARN mensajero complementario (ARNm) como parte de la vía de interferencia del ARN . Las moléculas de microARN se sintetizan como transcripciones primarias de ARN largas conocidas como pri-miARN , que son escindidas por Drosha para producir una estructura característica de tallo-bucle de aproximadamente 70 pares de bases de longitud, conocida como pre-miARN. [11] Los pre-miARN, cuando se asocian con EXP5, se estabilizan debido a la eliminación de la tapa 5' y la cola poli(A) 3'. [13] </ref> Drosha existe como parte de un complejo proteico llamado complejo Microprocessor , que también contiene la proteína de unión a ARN bicatenario DGCR8 (llamada Pasha en D. melanogaster y C. elegans ). [14] DGCR8 es esencial para la actividad de Drosha y es capaz de unirse a fragmentos monocatenarios del pri-miRNA que son necesarios para el procesamiento adecuado. [15] El complejo Drosha también contiene varios factores auxiliares como EWSR1 , FUS, hnRNPs , p68 y p72. [16]
Tanto Drosha como DGCR8 se localizan en el núcleo celular , donde ocurre el procesamiento de pri-miRNA a pre-miRNA. Estas dos proteínas controlan homeostáticamente la biogénesis de miRNA mediante un ciclo de retroalimentación automática. [16] Drosha genera un saliente 3' de 2 nt en el núcleo reconocido por Dicer en el citoplasma, que acopla los eventos de procesamiento ascendente y descendente. Luego, la ARNasa Dicer procesa el pre-miRNA en miRNA maduros en el citoplasma celular . [11] [16] También existe una isoforma de Drosha que no contiene una señal de localización nuclear, lo que da como resultado la generación de c-Drosha. [17] [18] Se ha demostrado que esta variante se localiza en el citoplasma celular en lugar del núcleo, pero los efectos en el procesamiento de pri-miRNA aún no están claros.
Se ha descubierto que ciertos miRNA se desvían de las vías de biogénesis convencionales y no necesariamente requieren Drosha o Dicer , lo que se debe a que no requieren el procesamiento de pri-miRNA a pre-miRNA. [16] Los miRNA independientes de Drosha derivan de mirtrons , que son genes que codifican miRNA en sus intrones y hacen uso del empalme para evitar la escisión de Drosha. Los simtrons son similares a mirtron, independientes del empalme y requieren escisión mediada por Drosha, aunque no requieren la mayoría de las proteínas en la vía canónica, como DGCR8 o Dicer . [10]
Importancia clínica
Drosha y otras enzimas de procesamiento de miRNA pueden ser importantes en el pronóstico del cáncer. [9] Tanto Drosha como Dicer pueden funcionar como reguladores maestros del procesamiento de miRNA y se ha observado que están regulados a la baja en algunos tipos de cáncer de mama . [20] Los patrones de empalme alternativo de Drosha en The Cancer Genome Atlas también han indicado que c-drosha parece estar enriquecido en varios tipos de cáncer de mama, cáncer de colon y cáncer de esófago . [18] Sin embargo, la naturaleza exacta de la asociación entre el procesamiento de microRNA y la tumorigénesis no está clara, [21] pero su función puede examinarse eficazmente mediante la eliminación de siRNA en función de una validación independiente. [22]
Drosha y otras enzimas procesadoras de miRNA también pueden ser importantes en la replicación del VIH-1. Los miRNA contribuyen a la defensa antiviral innata. Esto se puede demostrar por la inhibición de dos proteínas procesadoras de miRNA importantes, Drosha y Dicer, que conduce a una mejora significativa de la replicación viral en PBMC de pacientes infectados con VIH-1. Por lo tanto, Drosha, junto con Dicer, parece tener un papel en el control de la replicación del VIH-1. [10]
Referencias
^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000113360 – Ensembl , mayo de 2017
^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000022191 – Ensembl , mayo de 2017
^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
^ Filippov V, Solovyev V , Filippova M, Gill SS (marzo de 2000). "Un nuevo tipo de proteínas de la familia de la ARNasa III en eucariotas". Gene . 245 (1): 213–221. doi :10.1016/s0378-1119(99)00571-5. PMID 10713462.
^ Filippov V, Solovyev V, Filippova M, Gill SS (marzo de 2000). "Un nuevo tipo de proteínas de la familia de la ARNasa III en eucariotas". Gene . 245 (1): 213–221. doi :10.1016/S0378-1119(99)00571-5. PMID 10713462.
^ Wu H, Xu H, Miraglia LJ, Crooke ST (noviembre de 2000). "La ARNasa III humana es una proteína de 160 kDa implicada en el procesamiento del ARN preribosómico". The Journal of Biological Chemistry . 275 (47): 36957–36965. doi : 10.1074/jbc.M005494200 . PMID 10948199.
^ ab "Entrez Gene: RNASEN ribonucleasa III, nuclear".
^ abc Slack FJ, Weidhaas JB (diciembre de 2008). "MicroARN en el pronóstico del cáncer". The New England Journal of Medicine . 359 (25): 2720–2722. doi :10.1056/NEJMe0808667. PMC 10035200 . PMID 19092157.
^ abcd Swaminathan G, Navas-Martín S, Martín-García J (marzo de 2014). "MicroRNAs and HIV-1 infection: antiviral activity and beyond". Revista de Biología Molecular . 426 (6): 1178–97. doi : 10.1016/j.jmb.2013.12.017 . PMID 24370931.
^ abcd Lee Y, Ahn C, Han J, Choi H, Kim J, Yim J, et al. (septiembre de 2003). "La ARNasa nuclear III Drosha inicia el procesamiento de microARN". Nature . 425 (6956): 415–419. Bibcode :2003Natur.425..415L. doi :10.1038/nature01957. PMID 14508493. S2CID 4421030.
^ Fortin KR, Nicholson RH, Nicholson AW (agosto de 2002). "Ribonucleasa III de ratón. Estructura del ADNc, análisis de expresión y localización cromosómica". BMC Genomics . 3 (1): 26. doi : 10.1186/1471-2164-3-26 . PMC 122089 . PMID 12191433.
^ Sloan KE, Gleizes PE, Bohnsack MT (mayo de 2016). "Transporte nucleocitoplasmático de ARN y complejos ARN-proteína". Journal of Molecular Biology . 428 (10 Pt A): 2040–59. doi :10.1016/j.jmb.2015.09.023. PMID 26434509.
^ Denli AM, Tops BB, Plasterk RH, Ketting RF, Hannon GJ (noviembre de 2004). "Procesamiento de microARN primarios por el complejo microprocesador". Nature . 432 (7014): 231–235. Bibcode :2004Natur.432..231D. doi :10.1038/nature03049. PMID 15531879. S2CID 4425505.
^ Han J, Lee Y, Yeom KH, Nam JW, Heo I, Rhee JK, et al. (junio de 2006). "Base molecular para el reconocimiento de microARN primarios por el complejo Drosha-DGCR8". Cell . 125 (5): 887–901. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.043 . PMID 16751099. S2CID 453021.
^ abcd Suzuki HI, Miyazono K (enero de 2011). "Complejidad emergente de las cascadas de generación de microARN". Journal of Biochemistry . 149 (1): 15–25. doi :10.1093/jb/mvq113. PMID 20876186.
^ Link S, Grund SE, Diederichs S (junio de 2016). "El empalme alternativo afecta la localización subcelular de Drosha". Nucleic Acids Research . 44 (11): 5330–5343. doi :10.1093/nar/gkw400. PMC 4914122 . PMID 27185895.
^ ab Dai L, Chen K, Youngren B, Kulina J, Yang A, Guo Z, et al. (diciembre de 2016). "Actividad citoplasmática de Drosha generada por empalme alternativo". Investigación de ácidos nucleicos . 44 (21): 10454–10466. doi :10.1093/nar/gkw668. PMC 5137420 . PMID 27471035.
^ Francia S, Michelini F, Saxena A, Tang D, de Hoon M, Anelli V, et al. (agosto de 2012). "Los productos de ARN de DICER y DROSHA específicos del sitio controlan la respuesta al daño del ADN". Nature . 488 (7410): 231–235. Bibcode :2012Natur.488..231F. doi :10.1038/nature11179. PMC 3442236 . PMID 22722852.
^ Thomson JM, Newman M, Parker JS, Morin-Kensicki EM, Wright T, Hammond SM (agosto de 2006). "Regulación postranscripcional extensa de microARN y sus implicaciones para el cáncer". Genes & Development . 20 (16): 2202–2207. doi :10.1101/gad.1444406. PMC 1553203 . PMID 16882971.
^ Iorio MV, Croce CM (junio de 2012). "Participación de microARN en el cáncer humano". Carcinogénesis . 33 (6): 1126–1133. doi :10.1093/carcin/bgs140. PMC 3514864 . PMID 22491715.
^ Munkácsy G, Sztupinszki Z, Herman P, Bán B, Pénzváltó Z, Szarvas N, et al. (Septiembre de 2016). "La validación de la eficiencia del silenciamiento de ARNi utilizando datos de matrices genéticas muestra una tasa de falla del 18,5% en 429 experimentos independientes". Terapia molecular. Ácidos nucleicos . 5 (9): e366. doi :10.1038/mtna.2016.66. PMC 5056990 . PMID 27673562.
Lectura adicional
Gunther M, Laithier M, Brison O (julio de 2000). "Un conjunto de proteínas que interactúan con el factor de transcripción Sp1 identificado en un análisis de dos híbridos". Bioquímica molecular y celular . 210 (1–2): 131–142. doi :10.1023/A:1007177623283. PMID 10976766. S2CID 1339642.
Fortin KR, Nicholson RH, Nicholson AW (agosto de 2002). "Ribonucleasa III de ratón. Estructura del ADNc, análisis de expresión y localización cromosómica". BMC Genomics . 3 (1): 26. doi : 10.1186/1471-2164-3-26 . PMC 122089 . PMID 12191433.
Lee Y, Ahn C, Han J, Choi H, Kim J, Yim J, et al. (septiembre de 2003). "La ARNasa nuclear III Drosha inicia el procesamiento de microARN". Nature . 425 (6956): 415–419. Bibcode :2003Natur.425..415L. doi :10.1038/nature01957. PMID 14508493. S2CID 4421030.
Gregory RI, Yan KP, Amuthan G, Chendrimada T, Doratotaj B, Cooch N, et al. (noviembre de 2004). "El complejo microprocesador media la génesis de los microARN". Nature . 432 (7014): 235–240. Bibcode :2004Natur.432..235G. doi :10.1038/nature03120. PMID 15531877. S2CID 4389261.
Zeng Y, Yi R, Cullen BR (enero de 2005). "Reconocimiento y escisión de precursores de microARN primarios por la enzima de procesamiento nuclear Drosha". The EMBO Journal . 24 (1): 138–148. doi :10.1038/sj.emboj.7600491. PMC 544904 . PMID 15565168.
Han J, Lee Y, Yeom KH, Kim YK, Jin H, Kim VN (diciembre de 2004). "El complejo Drosha-DGCR8 en el procesamiento primario de microARN". Genes & Development . 18 (24): 3016–3027. doi :10.1101/gad.1262504. PMC 535913 . PMID 15574589.
Landthaler M, Yalcin A, Tuschl T (diciembre de 2004). "El gen 8 de la región crítica del síndrome de DiGeorge humano y su homólogo de D. melanogaster son necesarios para la biogénesis de miRNA". Current Biology . 14 (23): 2162–2167. Bibcode :2004CBio...14.2162L. doi :10.1016/j.cub.2004.11.001. hdl : 11858/00-001M-0000-0012-EB83-3 . PMID 15589161. S2CID 13266269.
Zeng Y, Cullen BR (julio de 2005). "El procesamiento eficiente de las horquillas de microARN primarias por Drosha requiere secuencias de ARN no estructuradas flanqueantes". The Journal of Biological Chemistry . 280 (30): 27595–27603. doi : 10.1074/jbc.M504714200 . PMID 15932881.
Irvin-Wilson CV, Chaudhuri G (2006). "Iniciación y empalme alternativo en la expresión del gen dicer en células mamarias humanas". Investigación sobre el cáncer de mama . 7 (4): R563–R569. doi : 10.1186/bcr1043 . PMC 1175071. PMID 15987463 .
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, et al. (enero de 2006). "Diversificación de la modulación transcripcional: identificación y caracterización a gran escala de promotores alternativos putativos de genes humanos". Genome Research . 16 (1): 55–65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC 1356129 . PMID 16344560.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, et al. (noviembre de 2006). "Dinámica de fosforilación global, in vivo y específica del sitio en redes de señalización". Cell . 127 (3): 635–648. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573.
Sugito N, Ishiguro H, Kuwabara Y, Kimura M, Mitsui A, Kurehara H, et al. (diciembre de 2006). "RNASEN regula la proliferación celular y afecta la supervivencia en pacientes con cáncer de esófago". Clinical Cancer Research . 12 (24): 7322–7328. doi :10.1158/1078-0432.CCR-06-0515. PMID 17121874. S2CID 7569257.
Kim YK, Kim VN (febrero de 2007). "Procesamiento de microARN intrónicos". The EMBO Journal . 26 (3): 775–783. doi :10.1038/sj.emboj.7601512. PMC 1794378 . PMID 17255951.
Xing L, Kieff E (septiembre de 2007). "Arnúcleos micro y estables del virus BHRF1 de Epstein-Barr durante la latencia III y después de la inducción de la replicación". Journal of Virology . 81 (18): 9967–9975. doi :10.1128/JVI.02244-06. PMC 2045418 . PMID 17626073.
Enlaces externos
Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : Q9NRR4 (Ribonucleasa 3) en PDBe-KB .