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DDB1

La proteína 1 que se une al daño del ADN es una proteína que en los humanos está codificada por el gen DDB1 . [5] [6] [7]

Gene

La posición del gen está en el cromosoma 11q12-q13. [8]

Proteína

El gen DDB1 codifica la subunidad grande de la proteína de unión al daño del ADN , un heterodímero compuesto por una subunidad grande y una pequeña ( DDB2 ). DDB1 contiene 1140 aminoácidos, lo que equivale a una masa de 127 kDa. [8]

Función

Como sugiere su nombre, DDB1 estuvo inicialmente implicado en el proceso de un tipo específico de reparación del ADN conocido como reparación por escisión de nucleótidos . Desde entonces, los investigadores han descubierto que DDB1 funciona principalmente como un componente central de los complejos de ubiquitina ligasa E3 basados ​​en CUL4A y CUL4B . DDB1 sirve como un puente o proteína adaptadora que interactúa con docenas de proteínas conocidas como factores asociados a DDB1 y CUL4 (DCAF). [9] Estos DCAF son a menudo sustratos de la ubiquitina ligasa y regulan numerosos procesos esenciales en la célula, incluida la reparación del ADN (DDB2), la replicación del ADN, la remodelación de la cromatina ( Cdt2 ) y más.

Interacciones

Se ha demostrado que DDB1 interactúa con el homólogo de la proteína de iniciación de la transcripción SPT3 , [10] GCN5L2 , [11] DDB2 , [12] [13] CUL4A , [13] CUL4B [13] y P21 . [14]

Referencias

  1. ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000167986 – Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000024740 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  5. ^ Dualan R, Brody T, Keeney S, Nichols AF, Admon A, Linn S (febrero de 1996). "Localización cromosómica y clonación de ADNc de los genes (DDB1 y DDB2) para las subunidades p127 y p48 de una proteína de unión al ADN específica para daños humanos". Genómica . 29 (1): 62–9. doi :10.1006/geno.1995.1215. PMID  8530102.
  6. ^ Seki N, Hayashi A, Hattori A, Kozuma S, Sasaki M, Suzuki Y, Sugano S, Muramatsu M, Saito T (enero de 2000). "Clonación de ADNc, expresión tisular y asignación cromosómica de un gen de ratón que codifica una proteína de unión al ADN de 127 kDa dañada por UV que es defectuosa en células XPE". DNA Res . 6 (5): 319–22. doi : 10.1093/dnares/6.5.319 . PMID  10574459.
  7. ^ "Entrez Gene: proteína de unión al ADN específica del daño DDB1 1, 127 kDa".
  8. ^ ab Iovine B, Iannella ML, Bevilacqua MA (2011). "Proteína de unión al ADN específica de daño 1 (DDB1): una proteína con una amplia gama de funciones". Revista internacional de bioquímica y biología celular . 43 (12). Elsevier: 1664–1667. doi :10.1016/j.biocel.2011.09.001. PMID  21959250.
  9. ^ Lee J (2007). "DCAFs, el eslabón perdido de la ligasa de ubiquitina CUL4-DDB1". Molecular Cell . 26 (6): 775–780. doi : 10.1016/j.molcel.2007.06.001 . PMID  17588513.
  10. ^ Martinez E, Palhan VB, Tjernberg A, Lymar ES, Gamper AM, Kundu TK, Chait BT, Roeder RG (octubre de 2001). "El complejo STAGA humano es un coactivador de la transcripción acetilante de cromatina que interactúa con el empalme de pre-ARNm y los factores de unión al daño del ADN in vivo". Mol. Cell. Biol . 21 (20): 6782–95. doi :10.1128/MCB.21.20.6782-6795.2001. PMC 99856. PMID  11564863 . 
  11. ^ Huang J, Chen J (julio de 2008). "VprBP dirige a Merlin al complejo de ligasa E3 Roc1-Cul4A-DDB1 para su degradación". Oncogene . 27 (29): 4056–64. doi :10.1038/onc.2008.44. PMID  18332868. S2CID  23628888.
  12. ^ Bergametti F, Sitterlin D, Transy C (julio de 2002). "La renovación de la proteína X del virus de la hepatitis B está regulada por un complejo de unión al ADN dañado". J. Virol . 76 (13): 6495–501. doi :10.1128/JVI.76.13.6495-6501.2002. PMC 136256 . PMID  12050362. 
  13. ^ abc Guerrero-Santoro J, Kapetanaki MG, Hsieh CL, Gorbachinsky I, Levine AS, Rapić-Otrin V (julio de 2008). "La proteína ligasa de unión al ADN dañada por los rayos UV basada en cullin 4B se une a la cromatina dañada por los rayos UV y ubiquitina la histona H2A". Cancer Res . 68 (13): 5014–22. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-07-6162 . PMID  18593899.
  14. ^ Abbas T, Sivaprasad U, Terai K, Amador V, Pagano M, Dutta A (septiembre de 2008). "Regulación dependiente de PCNA de la ubiquitinación y degradación de p21 a través del complejo de ubiquitina ligasa CRL4Cdt2". Genes Dev . 22 (18): 2496–506. doi :10.1101/gad.1676108. PMC 2546691 . PMID  18794347. 

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