La Copa Heineken 1999-2000 fue la quinta edición de la Copa Heineken de rugby. Los equipos de Francia , Irlanda , Italia , Gales , Inglaterra y Escocia se dividieron en seis grupos de cuatro y jugaron partidos de ida y vuelta entre sí. Los ganadores de cada grupo y los dos mejores segundos clasificados se clasificaron para las etapas eliminatorias.
En los partidos de grupo los equipos recibieron