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Ciclización in situ de proteínas.

La ciclación in situ de proteínas ( INCYPRO ) es una tecnología de ingeniería de proteínas que aumenta la durabilidad de proteínas y enzimas para aplicaciones biotecnológicas y biomédicas. [1] [2] Para tales aplicaciones, es esencial que las proteínas utilizadas mantengan su integridad estructural. [3] Sin embargo, esto a menudo se cuestiona debido a las condiciones requeridas para estas aplicaciones que requieren ingeniería de proteínas para estabilizar la estructura de la proteína. [4] La tecnología INCYPRO implica la unión de enlaces moleculares (entrecruzamientos) a una proteína, reduciendo así la tendencia de la proteína a desplegarse. Las proteínas reticuladas con INCYPRO resultantes son más estables a temperaturas elevadas y en presencia de desnaturalizantes químicos. [5]

Tecnología

La tecnología INCYPRO utiliza moléculas reactivas a tris para entrecruzar tres posiciones definidas dentro de una proteína [1] o un complejo proteico. [6] Por ejemplo, INCYPRO puede implicar la introducción de tres cisteínas espacialmente alineadas y accesibles a disolventes en la proteína que luego se hacen reaccionar con un agente tris-electrófilo. Se ha demostrado que las proteínas o complejos de proteínas reticulados resultantes presentan una mayor estabilidad frente al estrés térmico y químico y una menor tendencia a la agregación. [1] [6] Hasta ahora, la temperatura de fusión de las proteínas se incrementó hasta 39°C en un solo paso de diseño. [6]

Ejemplos

Un ejemplo temprano implicó la estabilización de la transpeptidasa Sortasa A, lo que dio como resultado variantes estabilizadas por INCYPRO con actividad a temperatura elevada y en presencia de cloruro de guanidinio . [1] [5] INCYPRO también se ha aplicado para estabilizar el dominio KIX del adaptador humano utilizando diferentes moléculas reticulantes. Aquí, se observó una dependencia de la estabilidad de las proteínas de la hidrofilicidad del entrecruzamiento. [2] Además, se estabilizó una serie de complejos proteicos homotriméricos, incluida la esterasa de Pseudomonas fluorescens (PFE) y una enoil-CoA hidratasa . [6] En estos casos, se generaron conjugados de enzimas con topología bicíclica general.

Ver también

Referencias

  1. ^ abcd Pelay-Gimeno M, Bange T, Hennig S, Grossmann TN (agosto de 2018). "Ciclación in situ de proteínas nativas: diseño basado en la estructura de una enzima bicíclica". Angewandte Chemie . 57 (35): 11164–11170. doi :10.1002/anie.201804506. PMC  6120448 . PMID  29847004.
  2. ^ ab Neubacher S, Saya JM, Amore A, Grossmann TN (febrero de 2020). "Ciclización in situ de proteínas (INCYPRO): la derivatización entrecruzada modula la estabilidad de las proteínas". La Revista de Química Orgánica . 85 (3): 1476-1483. doi :10.1021/acs.joc.9b02490. PMC 7011175 . PMID  31790232. 
  3. ^ Gligorijević V, Renfrew PD, Kosciolek T, Leman JK, Berenberg D, Vatanen T, et al. (mayo de 2021). "Predicción de funciones de proteínas basada en estructuras mediante redes convolucionales de gráficos". Comunicaciones de la naturaleza . 12 (1): 3168. Código bibliográfico : 2021NatCo..12.3168G. doi :10.1038/s41467-021-23303-9. PMC 8155034 . PMID  34039967. 
  4. ^ Bornscheuer UT, Huisman GW, Kazlauskas RJ, Lutz S, Moore JC, Robins K (mayo de 2012). "Ingeniería de la tercera ola de biocatálisis". Naturaleza . 485 (7397): 185–194. Código Bib :2012Natur.485..185B. doi : 10.1038/naturaleza11117. PMID  22575958. S2CID  4379415.
  5. ^ ab Kiehstaller S, Hutchins GH, Amore A, Gerber A, Ibrahim M, Hennig S, et al. (junio de 2023). "La sortasa A diseñada bicíclica realiza la transpeptidación en condiciones desnaturalizantes". Química de bioconjugados . 34 (6): 1114-1121. doi :10.1021/acs.bioconjchem.3c00151. PMC 10288436 . PMID  37246906. 
  6. ^ abcd Hutchins GH, Kiehstaller S, Poc P, Lewis AH, Oh J, Sadighi R, et al. (febrero de 2024). "La bicicleta covalente de complejos proteicos produce estructuras cuaternarias duraderas". química . 10 (2): 615–627. Código Bib : 2024Chem...10..615H. doi :10.1016/j.chempr.2023.10.003. PMC 10857811 . PMID  38344167.