El Centro del Genoma de Filipinas ( PGC ) es un centro de investigación multidisciplinario en Ciudad Quezón , Metro Manila , Filipinas , que se especializa en genómica .
El Centro de Genoma de Filipinas se estableció como una colaboración entre la Universidad de Filipinas y el Departamento de Ciencia y Tecnología (DOST) . [1] Se concibió por primera vez en 2009 en respuesta al brote de SARS que afectó a Hong Kong, los brotes de dengue que afectaron a Filipinas y la pandemia de gripe H1N1 en curso que se originó en México. Las primeras subvenciones recibidas por el PGC fueron para pruebas de diagnóstico del dengue y vigilancia de H1N1 . [2] Inicialmente, la instalación estuvo bajo la jurisdicción de la Oficina del Presidente de la Universidad de Filipinas (UP) Diliman según la aprobación de la Junta de Regentes de UP en su reunión del 31 de julio de 2009. [3]
El PGC se inauguró oficialmente el 28 de noviembre de 2011. Al principio, el centro funcionaba de forma virtual. Desde enero de 2013 hasta la inauguración de su edificio el 11 de septiembre de 2019, [4] estuvo alojado temporalmente en el Instituto Nacional de Biología Molecular y Biotecnología de la Universidad de Diliman.
Para que los servicios de secuenciación de ADN y bioinformática sean accesibles para los investigadores filipinos, se establecieron el Centro de Secuenciación de ADN (DSCF, por sus siglas en inglés) y el Centro de Bioinformática (CFB, por sus siglas en inglés) con apoyo financiero del DOST. El 26 de febrero de 2016, la Junta de Regentes de la UP aprobó la transferencia de la gestión y supervisión del PGC de la Oficina del Presidente de la universidad a la Oficina del Vicepresidente de Asuntos Académicos [3]
En 2019, PGC Mindanao [5] y PGC Visayas [6] se establecieron como oficinas satélite en Mindanao y Visayas respectivamente.
En enero de 2020, el PGC, en colaboración con los Institutos Nacionales de Salud de UP Manila, desarrolló un kit de detección de SARS CoV-2 mediante RT-PCR . [7]
En abril de 2020, el Departamento de Salud designó al Centro de Genoma de Filipinas como el 18.º centro de pruebas de coronavirus. [8] También se le encargó que realizara la secuenciación genómica de las muestras de COVID-19. [9] En julio de 2021, también se le encomendó a PGC Mindanao y PGC Visayas la tarea de detectar nuevas variantes con el plan de proporcionarles máquinas para realizar la secuenciación del genoma. [10] En septiembre de 2021, el PGC cambió su enfoque hacia la detección de nuevas variantes de COVID-19 en el país y se centró menos en la realización de pruebas RT-PCR. [11]
El PGC tiene dos "instalaciones centrales": la Instalación Central para Bioinformática (CFB) y la Instalación Central para Secuenciación de ADN (DSCF). Se prevé que la tercera instalación del PGC sea un biobanco . [12] Las dos instalaciones fueron financiadas con una subvención de ₱100 millones (US$2,2 millones) durante tres años del Consejo Filipino para la Investigación y el Desarrollo de la Industria, la Energía y las Tecnologías Emergentes (PCIEERD) del Departamento de Ciencia y Tecnología . [2]
El Centro de Secuenciación de ADN (DSCF, por sus siglas en inglés) fue inaugurado el 24 de septiembre de 2013. En el DSCF se realizan estudios genómicos en el campo de la agricultura, la biodiversidad, la ciencia forense, la salud y la etnicidad con la intención de atender específicamente las necesidades de los filipinos. [12] En el DSCF se ofrecen servicios de secuenciación de ADN y genoma . [2]
La instalación central para la bioinformática (CFB, por sus siglas en inglés) es una instalación que proporciona generación y análisis de datos a escala genómica a investigadores locales del ámbito académico, de instituciones gubernamentales y organizaciones privadas. También proporciona almacenamiento de datos genómicos. También se complementa con una supercomputadora IBM Blue Gene , que también es utilizada por la Administración de Servicios Atmosféricos, Geofísicos y Astronómicos de Filipinas (PAGASA, por sus siglas en inglés) y el Proyecto de Evaluación Operacional Nacional de Riesgos (Proyecto NOAH, por sus siglas en inglés) para fines de pronóstico del tiempo y modelado del cambio climático, además de su uso en investigación genómica. La CFB se puso en marcha el 14 de abril de 2014, mientras que la supercomputadora se puso en funcionamiento ese mismo día. [13]
PGC Mindanao ofrece diversos servicios de diagnóstico y laboratorio a investigadores y laboratorios locales. Estos servicios incluyen preparación de muestras, espectrofotometría , fluorometría , reacción en cadena de la polimerasa , electroforesis , citometría de flujo y otros servicios de bioinformática y laboratorio.
Los equipos avanzados del PGC Mindanao se encuentran alojados temporalmente en los diferentes laboratorios del CSM: Biotecnología , Biología Molecular y Laboratorio de Extracción . [14]