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Centro de stock de genética de hongos

Fundado en 1960, el Fungal Genetics Stock Center es el principal depósito abierto de hongos genéticamente caracterizados . El FGSC es miembro de la Federación Mundial de Colecciones Culturales y es una colección líder en la Red de Coordinación de Investigación de la Red de Colecciones Culturales de EE. UU.

Valores en cartera

El FGSC distribuye cepas de Neurospora y Aspergillus , así como cantidades limitadas de Fusarium , Magnaporthe y muchas cepas de proyectos actuales de genoma de hongos . [1]

En las décadas de 1980 y 1990, el FGSC añadió a la colección materiales moleculares, incluidos genes clonados , vectores de clonación y bibliotecas de genes .

A medida que se han secuenciado más genomas de hongos, el FGSC ha reevaluado la definición de sistema genético. Esto los ha llevado a ampliar la colección, con materiales adicionales que incluyen cepas de programas genómicos [2] y colecciones de mutantes para organismos como Neurospora crassa , Aspergillus nidulans , Cryptococcus neoformans y Candida albicans .

Como depósito genético, la FGSC siempre se ha esforzado en representar la diversidad de material genético disponible. Para ello, contienen una gran cantidad de cepas de algunas especies diferentes. Más concretamente, cepas de 76 especies diferentes que representan 23 géneros diferentes . De ellas, existen más de diez cepas de sólo diecinueve especies diferentes. Estas cepas han sido depositadas por 310 individuos diferentes, 64 de los cuales han depositado una sola cepa. El FGSC también posee una serie de cepas no adheridas, incluida la colección de cepas de tipo salvaje del Dr. David Perkins, así como cepas de Neurospora de otros investigadores que se han retirado. Estos se llevan a cabo con el entendimiento de que los conservarán mientras haya espacio disponible. No están seleccionados y están disponibles tal cual. Otras colecciones de cepas incluyen cepas de Allomyces (pdf), Aspergillus niger, Ustilago madis y Neurospora de la colección histórica del laboratorio Tatum.

Distribución

En el período comprendido entre enero de 1998 y diciembre de 2018, el FGSC distribuyó más de 630.000 cultivos, incluidos casi 5.000 mutantes individuales y más de 20.000 mutantes de deleción de genes dispuestos en formato de 96 pocillos. Desde el desarrollo de la base de datos del FGSC en 1987, el FGSC ha enviado más de 650.000 cepas.

Historia

El FGSC fue fundado en 1960 en Dartmouth College con una subvención de la Fundación Nacional de Ciencias de EE. UU . El Dr. R. Barratt fue el primer Director de la FGSC. El FGSC se ha mudado tres veces desde entonces y ha estado ubicado en la Universidad Estatal de Humboldt , el Centro Médico de la Universidad de Kansas, la Universidad de Missouri-Kansas City y, desde 2014, la Universidad Estatal de Kansas [1]. En KU Med Center, el Dr. J. Kinsey fue director y trabajó en la genética del metabolismo de los aminoácidos y luego identificó el transposón "Tad" en una cepa de Neurospora crassa de Adiopodoume, Costa de Marfil. [3] En la UMKC, el Dr. Michael Plamann, que trabajó en la dinámica del citoesqueleto, fue el director. [4] Desde 2014, el Dr. John Leslie del Departamento de Fitopatología de la Universidad Estatal de Kansas ha sido Director.

La FGSC ha tenido tres curadores desde su creación. William (Bill) Ogata fue el primer curador y trabajó hasta su jubilación en 1981. Fue sucedido por Craig Wilson en Humboldt. El Sr. Wilson se mudó con la colección a Kansas City, donde en 1995 el Dr. Kevin McCluskey se convirtió en curador. Desde 1995, las existencias del FGSC aumentaron de 8.000 cepas a más de 25.000 cepas. [5] De manera similar, las guías de mejores prácticas para colecciones de cultivos estuvieron disponibles y se integraron en las prácticas del FGSC. [6]

Apoyo

Durante muchos años, el FGSC contó con el apoyo de la Fundación Nacional de Ciencias de EE. UU. en el marco de su programa Living Stock Collection. [7] A partir de 2015, el FGSC ha contado con el apoyo de la Facultad de Agricultura de la Universidad Estatal de Kansas y de las tarifas pagadas por los clientes.

Servicios adicionales

Uno de los principales objetivos de la FGSC es hacer más accesible la investigación con hongos filamentosos ( moho ). Con ese fin, el sitio web de FGSC alberga protocolos extensos [8] para Neurospora y Aspergillus . Otros materiales y servicios están disponibles caso por caso.

Investigación

La mayor parte de las actividades de investigación de la FGSC tienen como objetivo añadir valor a los materiales de la colección. Proyectos específicos han incluido la mejora de cepas, la identificación de marcadores desconocidos y la producción de cepas marcadas múltiples veces. El trabajo reciente incluye la caracterización de mutaciones sensibles a la temperatura que de otro modo serían anónimas en Neurospora y la caracterización de mutantes clásicos que de otro modo serían anónimos en colaboración con el Departamento de Energía de EE. UU. JGI.

El FGSC formaba parte del programa de Genómica Funcional de Neurospora. [9] y adhirieron a más de 13.000 mutantes de deleción de genes que en conjunto comprenden un conjunto de deleciones de genoma completo entre 2006 y 2014.

Referencias

  1. ^ Cepas de varios programas de secuenciación del genoma
  2. ^ "Catálogo en línea FGSC".
  3. ^ Aislamiento de un elemento transponible de Neurospora crassa
  4. ^ Interacciones genéticas entre dineína citoplasmática, dinactina y mutantes de distribución nuclear de Neurospora crassa
  5. ^ McCluskey, Kevin (2011). "De la genética a la genómica: colecciones de hongos en el Fungal Genetics Stock Center". Micología : 1–8. doi : 10.1080/21501203.2011.584575 .
  6. ^ Mejores prácticas para depósitos de germoplasma de hongos y perspectivas sobre su implementación.
  7. ^ Colecciones de stock vivo (LSC)
  8. ^ Página de métodos del centro de stock de genética de hongos
  9. ^ Análisis funcional de un hongo filamentoso modelo

enlaces externos